Phagen-Burst-Size-Rechner (Ein-Schritt-Wachstum)

Phagen-Burst-Size-Rechner (Ein-Schritt-Wachstum) | Kostenloses Online-Tool | Elysia Tools

Leitfaden zur Tool-Nutzung

Erfahren Sie, wann dieses Tool passt, was es unterstützt und wie Nutzer es anwenden.

Wichtige Fakten

Kategorie: Health
Eingabetypen: number
Ausgabetyp: json
Sample-Abdeckung: 4
API bereit: Ja

Überblick

Der Phagen-Burst-Size-Rechner berechnet die Burst Size aus einem Ein-Schritt-Wachstumsversuch: Burst = (freie PFU/mL nach Lyse − inokulierte PFU/mL) ÷ infizierte Zellen. Infizierte Zellen ergeben sich aus Zelldichte × infiziertem Anteil; der Anteil lässt sich über Poisson-Adsorption aus der MOI schätzen (MOI 1 ≈ 63 %, 2 ≈ 86 %, 3 ≈ 95 %, 5 ≈ 99 %). Das Ergebnis wird mit typischen Bereichen eingeordnet: unter 20 niedrig, 20–100 üblich (λ etwa 50–100), 100–300 hoch (T4-ähnlich etwa 100–200+), über 300 prüfen.

Wann verwenden

Nach einem Ein-Schritt-Wachstumsversuch, wenn Sie aus Lysat-Titer, Inokulum und Zelldichte die Burst Size in PFU pro Zelle brauchen.
Wenn der infizierte Anteil nicht 100 % beträgt und Sie ihn über MOI und Poisson (P = 1 − e^(−MOI)) einsetzen wollen.
Zur schnellen Einordnung, ob der Burst niedrig, im üblichen Bereich oder T4-ähnlich hoch liegt.

So funktioniert es

1Tragen Sie den freien Phagentiter nach Lyse und den inokulierten Phagentiter in PFU/mL ein (Inokulum 0 ist zulässig, wenn es vernachlässigbar ist).
2Geben Sie die Zelldichte bei Infektion in Zellen/mL sowie den Anteil infizierter Zellen in Prozent ein (Vorgabe 100 %).
3Optional legen Sie die Anzahl der Dezimalstellen fest (0–6, Vorgabe 1).
4Der Rechner liefert Burst Size, Netto-Nachkommen, infizierte Zellen und eine kurze Interpretation der Größenordnung.

Anwendungsfälle

Auswertung eines Ein-Schritt-Wachstumsversuchs: Netto-Nachkommen und Burst Size aus PFU-Titern und Zelldichte berechnen.
Vergleich von Isolaten, etwa T4-ähnliche hohe Bursts gegenüber niedrigen Werten bei kleinem Genom oder suboptimaler Infektion.
Labor- und Praktikumsdokumentation: infizierte Zellen über Zelldichte und Poisson-MOI angeben und das Ergebnis einordnen.

Beispiele

1. T4-ähnlicher Burst von 100 PFU/Zelle

Virologin

Hintergrund

Nach einem Ein-Schritt-Wachstum liegt der freie Titer im Lysat bei 5,01×10⁹ PFU/mL. Das Inokulum war 1×10⁷ PFU/mL, die Wirtsdichte 1×10⁸ Zellen/mL; nur etwa die Hälfte der Zellen war infiziert.

Aufgabe

Netto-Nachkommen und Burst Size bei 50 % Infektion bestimmen und prüfen, ob der Wert im T4-Bereich liegt.

Verwendung

Freien Titer nach Lyse 5010000000, inokulierten Titer 10000000, Zelldichte 100000000 und infizierte Zellen 50 % eingeben; Dezimalstellen 1 belassen.

pfuAfterLysis: 5010000000
pfuInoculated: 10000000
cellDensity: 100000000
infectionPercent: 50
decimalPlaces: 1

Ergebnis

Burst Size ≈ 100,0 PFU/Zelle (Netto-Nachkommen 5×10⁹ PFU/mL aus 5×10⁷ infizierten Zellen/mL). Einordnung: hoch, T4-ähnlich.

2. Niedriger Burst bei vollständiger Infektion

Labortechniker

Hintergrund

Das Lysat misst 1,001×10¹⁰ PFU/mL, das Inokulum 1×10⁸ PFU/mL. Bei Infektion lagen 5×10⁸ Zellen/mL vor, der Infektionsanteil wurde mit 100 % angesetzt.

Aufgabe

Die Burst Size unter vollständiger Infektion berechnen und mit typischen Bereichen vergleichen.

FAQ

Wie wird die Burst Size berechnet?

Burst = (freier Titer nach Lyse − inokulierter Titer) geteilt durch infizierte Zellen. Infizierte Zellen = Zelldichte × (Infektionsanteil / 100).

Wie schätze ich den Infektionsanteil aus der MOI?

Über Poisson-Adsorption P = 1 − e^(−MOI): MOI 1 ≈ 63 %, MOI 2 ≈ 86 %, MOI 3 ≈ 95 %, MOI 5 ≈ 99 %. Den Wert in Prozent eintragen.

Was bedeuten die Interpretationsbereiche?

Unter 20 gilt als niedrig, 20–100 als üblich (λ oft 50–100), 100–300 als hoch (T4-ähnlich oft 100–200+). Werte über 300 sollten Sie prüfen.

Darf der inokulierte Titer 0 sein?

Ja, wenn das Inokulum gegenüber dem Lysat-Titer vernachlässigbar ist. Sonst den Start-Titer in PFU/mL eintragen.

Welche Eingaben sind Pflicht?

Freier Titer nach Lyse, inokulierter Titer, Zelldichte und Infektionsanteil in Prozent. Dezimalstellen sind optional.

pfuAfterLysis: 10010000000
pfuInoculated: 100000000
cellDensity: 500000000
infectionPercent: 100
decimalPlaces: 1

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