Calculadora do Burst Size de Fagos (crescimento em uma etapa)

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Guia de uso da ferramenta

Veja quando usar esta ferramenta, o que ela suporta e como os usuários a aplicam.

Fatos principais

Categoria: Health
Tipos de entrada: number
Tipo de saída: json
Cobertura de exemplos: 4
API pronta: Sim

Visão geral

Calcule o burst size de bacteriófagos a partir de um experimento de crescimento em uma etapa: burst = (PFU/mL livres após a lise − PFU/mL inoculados) ÷ células infectadas. As células infectadas resultam da densidade celular vezes o percentual infectado, que pode ser estimado pela adsorção de Poisson a partir da MOI (1 ≈ 63 %, 2 ≈ 86 %, 3 ≈ 95 %, 5 ≈ 99 %). O resultado inclui progénie líquida e uma interpretação típica das faixas de λ e T4.

Quando usar

Quando tiver títulos de PFU do lisado e do inóculo e quiser o número médio de partículas libertadas por célula infectada.
Para estimar o percentual de células infectadas a partir da MOI com a fórmula de Poisson.
Quando precisar classificar o burst size como baixo, comum ou alto face a valores típicos de λ e T4.

Como funciona

1Introduza o título de fagos livres após a lise e o título inoculado no início da infeção, ambos em PFU/mL.
2Indique a densidade celular no momento da adição do fago (células/mL) e o percentual de células infectadas (predefinição 100 %).
3Ajuste as casas decimais se necessário; a calculadora obtém a progénie líquida, o número de células infectadas e o burst size, com interpretação das faixas habituais.

Casos de uso

Quantificar o rendimento médio por célula após uma curva de crescimento em uma etapa.
Comparar o burst size de isolados ou de condições diferentes de MOI e densidade celular.
Documentar a qualidade de um lisado na caracterização ou na produção de bacteriófagos.

Exemplos

1. Burst size tipo T4 de 100 PFU/célula

Investigador de bacteriófagos

Contexto

Numa curva de crescimento em uma etapa com fago tipo T4, o lisado atingiu 5,01×10⁹ PFU/mL após um inóculo de 1×10⁷ PFU/mL em 1×10⁸ células/mL, com cerca de 50 % de células infectadas.

Problema

Converter os títulos em burst size médio e confirmar se o valor se enquadra na faixa alta típica de T4.

Como usar

Introduza 5010000000 no título após a lise, 10000000 no título inoculado, 100000000 na densidade celular e 50 no percentual de células infectadas.

Resultado

Burst size ≈ 100,0 PFU/célula (progénie líquida 5×10⁹ PFU/mL a partir de 5×10⁷ células infectadas/mL). Interpretação: alto, faixa T4.

2. Burst baixo de 19,8 PFU/célula com infeção total

Técnico de laboratório de virologia

Contexto

O lisado apresentou 1,001×10¹⁰ PFU/mL após inóculo de 1×10⁸ PFU/mL em 5×10⁸ células/mL, assumindo 100 % de células infectadas.

Problema

Obter o burst size e perceber se o valor baixo aponta para fago de genoma pequeno ou condições subótimas.

Como usar

Introduza 10010000000 no título após a lise, 100000000 no título inoculado, 500000000 na densidade celular e 100 no percentual infectado.

Perguntas frequentes

Como se calcula o burst size?

Burst = (título livre após a lise − título inoculado) ÷ células infectadas, em que células infectadas = densidade celular × (percentual infectado / 100).

Como estimar o percentual de células infectadas a partir da MOI?

Pela adsorção de Poisson P = 1 − e^(−MOI): MOI 1 ≈ 63 %, MOI 2 ≈ 86 %, MOI 3 ≈ 95 %, MOI 5 ≈ 99 %.

Posso colocar zero no título inoculado?

Sim. Zero é aceitável quando o inóculo é desprezível em relação ao título do lisado.

Como interpretar o valor do burst size?

Abaixo de 20 é baixo; 20–100 é comum (λ ≈ 50–100); 100–300 é alto (tipo T4 ≈ 100–200+); acima de 300 convém verificar os dados.

Quais campos são obrigatórios?

Título após a lise, título inoculado, densidade celular e percentual de células infectadas. As casas decimais são opcionais (predefinição 1).

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Fatos principais

Visão geral

Quando usar

Como funciona

Casos de uso

Exemplos

1. Burst size tipo T4 de 100 PFU/célula

2. Burst baixo de 19,8 PFU/célula com infeção total

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