Calculadora del Tamaño de Ráfaga de Fagos (crecimiento un paso)

Calculadora del Tamaño de Ráfaga de Fagos (crecimiento un paso) | Herramienta online gratis | Elysia Tools

Guía de uso de la herramienta

Conoce cuándo usar esta herramienta, qué admite y cómo la aplican los usuarios.

Datos clave

Categoría: Health
Tipos de entrada: number
Tipo de salida: json
Cobertura de ejemplos: 4
API disponible: Sí

Resumen

Calcula el tamaño de ráfaga (burst size) de un experimento de crecimiento en un paso: ráfaga = (PFU/mL libres tras la lisis − PFU/mL inoculados) ÷ células infectadas. Las células infectadas se obtienen de la densidad celular y el porcentaje infectado, que puede estimarse por adsorción de Poisson según el MOI. El resultado incluye progenie neta, células infectadas e interpretación típica del valor.

Cuándo usarlo

Cuando tengas títulos de fago (PFU/mL) al final de la lisis y al inocular, más la densidad celular del momento de la infección.
Cuando quieras convertir el porcentaje infectado o un MOI (1 ≈ 63 %, 2 ≈ 86 %, 3 ≈ 95 %, 5 ≈ 99 %) en células infectadas reales.
Cuando necesites interpretar si la ráfaga es baja (<20), habitual (20–100), alta tipo T4 (100–300) o sospechosamente elevada (>300).

Cómo funciona

1Introduce el título de fagos libres tras la lisis (PFU/mL) y el título inoculado (puede ser 0 si es despreciable).
2Indica la densidad celular en la infección (células/mL) y el porcentaje de células infectadas (por defecto 100 %, o el valor estimado por Poisson según el MOI).
3Opcionalmente elige el número de decimales (0–6). La calculadora resta el inóculo, obtiene la progenie neta, divide por las células infectadas y clasifica el burst size.
4Obtienes el tamaño de ráfaga en PFU/célula, la progenie neta, las células infectadas y una interpretación típica del rango.

Casos de uso

Cuantificar el burst size de un lisado de crecimiento en un paso con títulos de placa y densidad celular conocidos.
Comparar ráfagas de fagos tipo T4 frente a fagos de genoma pequeño o condiciones subóptimas.
Estimar células infectadas a partir de un MOI y obtener la progenie neta en notación científica.

Ejemplos

1. Infección tipo T4: ráfaga ≈ 100 PFU/célula

Virologista de laboratorio

Contexto

En un ensayo de crecimiento en un paso con un fago tipo T4 se tituló el lisado al final de la lisis y se conoce la densidad celular al inocular.

Problema

Obtener el burst size restando el inóculo y dividiendo por las células realmente infectadas (50 %).

Cómo usarlo

Introduce 5010000000 en título tras la lisis, 10000000 en título inoculado, 100000000 en densidad celular y 50 en porcentaje infectado (1 decimal).

pfuAfterLysis: 5010000000; pfuInoculated: 10000000; cellDensity: 100000000; infectionPercent: 50; decimalPlaces: 1

Resultado

Burst size ≈ 100,0 PFU/célula (progenie neta 5 × 10⁹ PFU/mL a partir de 5 × 10⁷ células infectadas/mL). Alta, territorio T4 (≈ 100–200+).

2. Ráfaga baja: ≈ 19,8 PFU/célula con infección total

Investigador de bacteriófagos

Contexto

Un lisado denso se tituló tras la lisis; todas las células se consideraron infectadas (100 %) a alta densidad.

Problema

Comprobar si el rendimiento por célula es bajo (fago de genoma pequeño o condiciones subóptimas).

Preguntas frecuentes

¿Qué fórmula usa la calculadora?

Ráfaga = (PFU/mL libres tras la lisis − PFU/mL inoculados) ÷ células infectadas, donde células infectadas = densidad celular × (porcentaje infectado / 100).

¿Cómo estimo el porcentaje infectado a partir del MOI?

Por adsorción de Poisson P = 1 − e^(−MOI): MOI 1 ≈ 63 %, MOI 2 ≈ 86 %, MOI 3 ≈ 95 %, MOI 5 ≈ 99 %. Introduce ese porcentaje en el campo correspondiente.

¿Puedo poner 0 en el título inoculado?

Sí. El campo admite 0 cuando el inóculo es despreciable frente al lisado.

¿Qué significa un valor <20, 20–100 o >300?

Menos de 20 es baja; 20–100 es habitual (λ ≈ 50–100); 100–300 es alta (tipo T4 ≈ 100–200+); por encima de 300 conviene revisar los datos (p. ej. adsorción secundaria).

¿Qué unidades debo usar?

PFU/mL para ambos títulos de fago y células/mL para la densidad. El porcentaje infectado se introduce en % (p. ej. 50 o 100).

pfuAfterLysis: 10010000000; pfuInoculated: 100000000; cellDensity: 500000000; infectionPercent: 100; decimalPlaces: 1

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Ejemplos

1. Infección tipo T4: ráfaga ≈ 100 PFU/célula

2. Ráfaga baja: ≈ 19,8 PFU/célula con infección total

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