Education
Калькулятор длины рестрикционных фрагментов
Оценивает размеры фрагментов после рестрикции: кольцевой субстрат с n разрезами даёт n фрагментов (с заходом через начало координат), линейный — n+1. Режим позиций вычисляет точные фрагменты по координатам через запятую; режим числа сайтов даёт количество и средний размер при равномерном распределении. Плюс ожидаемая частота сайтов в случайной ДНК: 4-буквенные сайты ~1 на 256 п.н., 6-буквенные ~1 на 4096 п.н. (REBASE/Sambrook) и советы по разрешению агарозы (<50 п.н. может уйти). Источники: Sambrook & Russell 3-е изд., REBASE. Только для обучения.
Быстрый старт
Вызовите этот инструмент из своего кода на трёх языках.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/restriction-fragment-length' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"topology":"circular","inputMode":"positions","substrateLengthBp":2686,"cutPositions":"1000, 2000","cutSiteCount":2,"decimalPlaces":2}'Справочник API
Отправьте POST-запрос с входными данными в JSON. Параметры типа «файл» требуют предварительной загрузки.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/restriction-fragment-lengthПараметры
| Имя | Тип | Обязательный | Описание |
|---|---|---|---|
| topology | select | Да | Circular plasmids give n fragments from n cuts; linear DNA gives n+1. |
| inputMode | select | Да | Enter exact cut positions, or just the number of cut sites for an average estimate. |
| substrateLengthBp | number | Да | Total length of the substrate (plasmid or linear DNA) in base pairs. |
| cutPositions | text | Да | Cut coordinates counted from base 1 (positions mode); each must be strictly inside the substrate and unique. |
| cutSiteCount |
Интеграция MCP
Добавьте этот инструмент на свой сервер Model Context Protocol, чтобы ИИ-агенты могли перечислять и вызывать его.
Конфигурация сервера
Добавьте этот блок в конфигурацию вашего MCP-клиента:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-restriction-fragment-length": {
"name": "restriction-fragment-length",
"description": "Оценивает размеры фрагментов после рестрикции: кольцевой субстрат с n разрезами даёт n фрагментов (с заходом через начало координат), линейный — n+1. Режим позиций вычисляет точные фрагменты по координатам через запятую; режим числа сайтов даёт количество и средний размер при равномерном распределении. Плюс ожидаемая частота сайтов в случайной ДНК: 4-буквенные сайты ~1 на 256 п.н., 6-буквенные ~1 на 4096 п.н. (REBASE/Sambrook) и советы по разрешению агарозы (<50 п.н. может уйти). Источники: Sambrook & Russell 3-е изд., REBASE. Только для обучения.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=restriction-fragment-length",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Получить список инструментов
После подключения к SSE-endpoint выведите список доступных инструментов:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Вызвать этот инструмент
Вызовите инструмент по его id; аргументы формируются из его параметров:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "restriction-fragment-length",
"arguments": {
"topology": "circular",
"inputMode": "positions",
"substrateLengthBp": 2686,
"cutPositions": "1000, 2000",
"cutSiteCount": 2,
"decimalPlaces": 2
}
}
}