Education

Калькулятор частоты рекомбинации и генетических расстояний (сМ)

Преобразование между частотой рекомбинации и расстоянием на генетической карте. r = рекомбинанты / всё потомство (r ≤ 0.5; стремится к 0.5 для далёких генов или разных хромосом). Три функции картирования (d в морганидах, 1 М = 100 сМ): линейная d = r (только короткие расстояния); Холдейн 1919: d = −½ln(1−2r) (без интерференции); Косамби 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (положительная интерференция). Они корректируют занижение r из-за двойных кроссоверов: при одном r Холдейн ≥ Косамби ≥ линейная. Режим интервалов суммирует расстояния и предсказывает r через обратные функции (суммарная карта может превышать 50 сМ, а r насыщается на 50%). Источники: Sturtevant 1913, Халдейн 1919, Косамби 1944, Griffiths. Только для обучения.

json· JSON-результатОткрыть инструмент

Быстрый старт

Вызовите этот инструмент из своего кода на трёх языках.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/ru/api/tools/recombination-frequency-map' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"mode":"counts","recombinantCount":18,"totalProgeny":100,"intervalDistances":"","decimalPlaces":4}'

Справочник API

Отправьте POST-запрос с входными данными в JSON. Параметры типа «файл» требуют предварительной загрузки.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/ru/api/tools/recombination-frequency-map

Параметры

Имя	Тип	Обязательный	Описание
mode	select	Да	From recombination counts, or from a list of map intervals.
recombinantCount	number	Да	Recombinant offspring in a testcross (counts mode).
totalProgeny	number	Да	Total offspring scored (counts mode).
intervalDistances	text	Нет	Comma-separated adjacent interval distances in centimorgans (intervals mode).
decimalPlaces	number

Интеграция MCP

Добавьте этот инструмент на свой сервер Model Context Protocol, чтобы ИИ-агенты могли перечислять и вызывать его.

Конфигурация сервера

Добавьте этот блок в конфигурацию вашего MCP-клиента:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-recombination-frequency-map": {
      "name": "recombination-frequency-map",
      "description": "Преобразование между частотой рекомбинации и расстоянием на генетической карте. r = рекомбинанты / всё потомство (r ≤ 0.5; стремится к 0.5 для далёких генов или разных хромосом). Три функции картирования (d в морганидах, 1 М = 100 сМ): линейная d = r (только короткие расстояния); Холдейн 1919: d = −½ln(1−2r) (без интерференции); Косамби 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (положительная интерференция). Они корректируют занижение r из-за двойных кроссоверов: при одном r Холдейн ≥ Косамби ≥ линейная. Режим интервалов суммирует расстояния и предсказывает r через обратные функции (суммарная карта может превышать 50 сМ, а r насыщается на 50%). Источники: Sturtevant 1913, Халдейн 1919, Косамби 1944, Griffiths. Только для обучения.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=recombination-frequency-map",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Получить список инструментов

После подключения к SSE-endpoint выведите список доступных инструментов:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Вызвать этот инструмент

Вызовите инструмент по его id; аргументы формируются из его параметров:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "recombination-frequency-map",
    "arguments": {
  "mode": "counts",
  "recombinantCount": 18,
  "totalProgeny": 100,
  "intervalDistances": "",
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

Обзор инструментов Открыть инструмент