Education

Калькулятор Tm олигонуклеотидов (солевая поправка)

Две классические оценки Tm: правило Уоллеса Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (короткие олиги <14 нт, без зависимости от соли) и формула с солевой поправкой Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%ГЦ) − 600/n (Sambrook 1989, с. 11.46, как в Primer3; член длины 500–675/n в разных источниках). Автоматический режим выбирает по длине. Выводит %ГЦ, состав и обе оценки. Обе — приближения; для точности проектирования используйте термодинамику ближайших соседей (инструмент pcr-primer-tm). Допущения: ДНК, без неспаренностей, без формамида/ДМСО, [Na⁺] 0.01–1 М. Источники: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Только для обучения.

json· JSON-результатОткрыть инструмент

Быстрый старт

Вызовите этот инструмент из своего кода на трёх языках.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/oligo-melting-temperature' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"ATGCATGCATGCATGCATGC","method":"auto","sodiumMm":50,"decimalPlaces":2}'

Справочник API

Отправьте POST-запрос с входными данными в JSON. Параметры типа «файл» требуют предварительной загрузки.

Endpoint

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/oligo-melting-temperature

Параметры

Имя	Тип	Обязательный	Описание
sequence	text	Да	DNA sequence, A/C/G/T only (spaces stripped, case-insensitive), 4–200 nt.
method	select	Да	Auto uses Wallace below 14 nt and the salt-corrected formula from 14 nt up.
sodiumMm	number	Да	Total [Na⁺] (or equivalent monovalent) of the buffer; used by the salt-corrected formula.
decimalPlaces	number	Нет	—

Формат ответа

JSON-результат

Интеграция MCP

Добавьте этот инструмент на свой сервер Model Context Protocol, чтобы ИИ-агенты могли перечислять и вызывать его.

Конфигурация сервера

Добавьте этот блок в конфигурацию вашего MCP-клиента:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-oligo-melting-temperature": {
      "name": "oligo-melting-temperature",
      "description": "Две классические оценки Tm: правило Уоллеса Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (короткие олиги <14 нт, без зависимости от соли) и формула с солевой поправкой Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%ГЦ) − 600/n (Sambrook 1989, с. 11.46, как в Primer3; член длины 500–675/n в разных источниках). Автоматический режим выбирает по длине. Выводит %ГЦ, состав и обе оценки. Обе — приближения; для точности проектирования используйте термодинамику ближайших соседей (инструмент pcr-primer-tm). Допущения: ДНК, без неспаренностей, без формамида/ДМСО, [Na⁺] 0.01–1 М. Источники: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Только для обучения.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=oligo-melting-temperature",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Получить список инструментов

После подключения к SSE-endpoint выведите список доступных инструментов:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Вызвать этот инструмент

Вызовите инструмент по его id; аргументы формируются из его параметров:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "oligo-melting-temperature",
    "arguments": {
  "sequence": "ATGCATGCATGCATGCATGC",
  "method": "auto",
  "sodiumMm": 50,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

Обзор инструментов Открыть инструмент