Какие последовательности поддерживаются?

ДНК-последовательности длиной от 4 до 200 нт, содержащие A, C, G и T. Пробелы удаляются автоматически.

Как работает автоматический режим?

Для последовательностей короче 14 нт он выбирает правило Уоллеса, а для последовательностей от 14 нт — формулу с солевой поправкой.

Зачем указывать концентрацию натрия?

Концентрация Na⁺ влияет на расчёт по солевой формуле. В правиле Уоллеса она не используется.

Что показывает результат?

Результат включает выбранную оценку Tm, метод, GC-содержание, длину, состав и обе оценки Tm.

Можно ли использовать расчёт для точного подбора праймера?

Нет. Это приближённые оценки для обучения и предварительного планирования; для точного проектирования нужна термодинамика ближайших соседей.

Elysia Tools

Навигация

Education

Калькулятор Tm олигонуклеотидов (солевая поправка)

Две классические оценки Tm: правило Уоллеса Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (короткие олиги <14 нт, без зависимости от соли) и формула с солевой поправкой Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%ГЦ) − 600/n (Sambrook 1989, с. 11.46, как в Primer3; член длины 500–675/n в разных источниках). Автоматический режим выбирает по длине. Выводит %ГЦ, состав и обе оценки. Обе — приближения; для точности проектирования используйте термодинамику ближайших соседей (инструмент pcr-primer-tm). Допущения: ДНК, без неспаренностей, без формамида/ДМСО, [Na⁺] 0.01–1 М. Источники: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Только для обучения.

Запуск

Запустить этот инструмент

Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.

Примеры

Примеры для этого инструмента

Связано

Калькулятор Tm олигонуклеотидов (солевая поправка)

Запустить этот инструмент

Примеры для этого инструмента

Продолжить с похожими инструментами и темами

Узнайте, когда использовать этот инструмент, что он поддерживает и как его применяют пользователи.

Ключевые факты

Обзор

Когда использовать

Как это работает

Сценарии использования

Примеры

1. 20-мер с 50 мМ Na⁺

2. Короткий 10-мер по правилу Уоллеса

FAQ

Примеры Обработки Изображений Web Python

Примеры Обработки Изображений Android Java

Примеры Обработки Изображений Android Kotlin

Примеры Обработки Изображений Web Rust

Конвертер поглощения и пропускания (A = −log₁₀T)

Калькулятор температуры отжига ПЦР (Ta = Tm − 5°C)

Анализатор родословных аутосомно-доминантного наследования

Калькулятор риска аутосомно-рецессивного наследования