Education
Калькулятор плотности клеток по OD600 (E. coli)
Пересчитывает мутность OD600 в концентрацию клеток и сухой вес (CDW): нормированная OD = показание × фактор разведения ÷ длина пути; клеток/мл = OD × клеток на единицу OD (по умолчанию 1×10⁹, типично для E. coli); CDW г/л = OD × г/л на единицу OD (по умолчанию 0.36, BioNumbers 109837; диапазон 0.3–0.5). Оба коэффициента редактируются — они зависят от штамма, среды и прибора; значения по умолчанию самосогласованы: 0.36 г/л ÷ 10⁹ кл/мл = 0.36 пг/клетку. Показания OD > 1 помечаются как вне линейного диапазона (Sigma-Aldrich). Источники: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Калибруйте собственной кривой OD-КОЕ. Только для обучения.
Быстрый старт
Вызовите этот инструмент из своего кода на трёх языках.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/od600-cell-density' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"od600":0.5,"dilutionFactor":1,"pathLengthCm":1,"cellsPerOd":1000000000,"cdwPerOd":0.36,"cultureVolumeMl":25,"decimalPlaces":4}'Справочник API
Отправьте POST-запрос с входными данными в JSON. Параметры типа «файл» требуют предварительной загрузки.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/od600-cell-densityПараметры
| Имя | Тип | Обязательный | Описание |
|---|---|---|---|
| od600 | number | Да | Raw absorbance of the (diluted) sample at 600 nm, blanked against medium. |
| dilutionFactor | number | Да | Sample-to-total dilution before measurement (1 = measured undiluted). |
| pathLengthCm | number | Да | Cuvette path length (1 cm standard; readings are normalized to 1 cm). |
| cellsPerOd | number | Да | Viable+total cells per mL at OD600 = 1 (E. coli default 1×10⁹; range 5×10⁸–1.2×10⁹). |
| cdwPerOd | number |
Интеграция MCP
Добавьте этот инструмент на свой сервер Model Context Protocol, чтобы ИИ-агенты могли перечислять и вызывать его.
Конфигурация сервера
Добавьте этот блок в конфигурацию вашего MCP-клиента:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-od600-cell-density": {
"name": "od600-cell-density",
"description": "Пересчитывает мутность OD600 в концентрацию клеток и сухой вес (CDW): нормированная OD = показание × фактор разведения ÷ длина пути; клеток/мл = OD × клеток на единицу OD (по умолчанию 1×10⁹, типично для E. coli); CDW г/л = OD × г/л на единицу OD (по умолчанию 0.36, BioNumbers 109837; диапазон 0.3–0.5). Оба коэффициента редактируются — они зависят от штамма, среды и прибора; значения по умолчанию самосогласованы: 0.36 г/л ÷ 10⁹ кл/мл = 0.36 пг/клетку. Показания OD > 1 помечаются как вне линейного диапазона (Sigma-Aldrich). Источники: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Калибруйте собственной кривой OD-КОЕ. Только для обучения.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=od600-cell-density",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Получить список инструментов
После подключения к SSE-endpoint выведите список доступных инструментов:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Вызвать этот инструмент
Вызовите инструмент по его id; аргументы формируются из его параметров:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "od600-cell-density",
"arguments": {
"od600": 0.5,
"dilutionFactor": 1,
"pathLengthCm": 1,
"cellsPerOd": 1000000000,
"cdwPerOd": 0.36,
"cultureVolumeMl": 25,
"decimalPlaces": 4
}
}
}