Education

Калькулятор плотности клеток по OD600 (E. coli)

Пересчитывает мутность OD600 в концентрацию клеток и сухой вес (CDW): нормированная OD = показание × фактор разведения ÷ длина пути; клеток/мл = OD × клеток на единицу OD (по умолчанию 1×10⁹, типично для E. coli); CDW г/л = OD × г/л на единицу OD (по умолчанию 0.36, BioNumbers 109837; диапазон 0.3–0.5). Оба коэффициента редактируются — они зависят от штамма, среды и прибора; значения по умолчанию самосогласованы: 0.36 г/л ÷ 10⁹ кл/мл = 0.36 пг/клетку. Показания OD > 1 помечаются как вне линейного диапазона (Sigma-Aldrich). Источники: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Калибруйте собственной кривой OD-КОЕ. Только для обучения.

json· JSON-результатОткрыть инструмент

Быстрый старт

Вызовите этот инструмент из своего кода на трёх языках.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/od600-cell-density' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"od600":0.5,"dilutionFactor":1,"pathLengthCm":1,"cellsPerOd":1000000000,"cdwPerOd":0.36,"cultureVolumeMl":25,"decimalPlaces":4}'

Справочник API

Отправьте POST-запрос с входными данными в JSON. Параметры типа «файл» требуют предварительной загрузки.

Endpoint

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/od600-cell-density

Параметры

Имя	Тип	Обязательный	Описание
od600	number	Да	Raw absorbance of the (diluted) sample at 600 nm, blanked against medium.
dilutionFactor	number	Да	Sample-to-total dilution before measurement (1 = measured undiluted).
pathLengthCm	number	Да	Cuvette path length (1 cm standard; readings are normalized to 1 cm).
cellsPerOd	number	Да	Viable+total cells per mL at OD600 = 1 (E. coli default 1×10⁹; range 5×10⁸–1.2×10⁹).
cdwPerOd	number

Интеграция MCP

Добавьте этот инструмент на свой сервер Model Context Protocol, чтобы ИИ-агенты могли перечислять и вызывать его.

Конфигурация сервера

Добавьте этот блок в конфигурацию вашего MCP-клиента:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-od600-cell-density": {
      "name": "od600-cell-density",
      "description": "Пересчитывает мутность OD600 в концентрацию клеток и сухой вес (CDW): нормированная OD = показание × фактор разведения ÷ длина пути; клеток/мл = OD × клеток на единицу OD (по умолчанию 1×10⁹, типично для E. coli); CDW г/л = OD × г/л на единицу OD (по умолчанию 0.36, BioNumbers 109837; диапазон 0.3–0.5). Оба коэффициента редактируются — они зависят от штамма, среды и прибора; значения по умолчанию самосогласованы: 0.36 г/л ÷ 10⁹ кл/мл = 0.36 пг/клетку. Показания OD > 1 помечаются как вне линейного диапазона (Sigma-Aldrich). Источники: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Калибруйте собственной кривой OD-КОЕ. Только для обучения.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=od600-cell-density",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Получить список инструментов

После подключения к SSE-endpoint выведите список доступных инструментов:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Вызвать этот инструмент

Вызовите инструмент по его id; аргументы формируются из его параметров:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "od600-cell-density",
    "arguments": {
  "od600": 0.5,
  "dilutionFactor": 1,
  "pathLengthCm": 1,
  "cellsPerOd": 1000000000,
  "cdwPerOd": 0.36,
  "cultureVolumeMl": 25,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

Обзор инструментов Открыть инструмент