Калькулятор плотности клеток по OD600 (E. coli) | Бесплатный онлайн-инструмент | Elysia Tools
Elysia Tools
Навигация
Education
Калькулятор плотности клеток по OD600 (E. coli)
Пересчитывает мутность OD600 в концентрацию клеток и сухой вес (CDW): нормированная OD = показание × фактор разведения ÷ длина пути; клеток/мл = OD × клеток на единицу OD (по умолчанию 1×10⁹, типично для E. coli); CDW г/л = OD × г/л на единицу OD (по умолчанию 0.36, BioNumbers 109837; диапазон 0.3–0.5). Оба коэффициента редактируются — они зависят от штамма, среды и прибора; значения по умолчанию самосогласованы: 0.36 г/л ÷ 10⁹ кл/мл = 0.36 пг/клетку. Показания OD > 1 помечаются как вне линейного диапазона (Sigma-Aldrich). Источники: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Калибруйте собственной кривой OD-КОЕ. Только для обучения.
Запуск
Запустить этот инструмент
Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.
Примеры
Примеры для этого инструмента
Связано
Продолжить с похожими инструментами и темами
Результат
Готово к запуску
После запуска здесь появятся файлы, текст, структурированные данные или потоковый вывод.
Руководство по использованию инструмента
Узнайте, когда использовать этот инструмент, что он поддерживает и как его применяют пользователи.
Ключевые факты
Категория
Education
Типы ввода
number
Тип вывода
json
Покрытие примерами
4
API доступен
Да
Обзор
Калькулятор OD600 пересчитывает оптическую плотность культуры E. coli в нормированную OD, клеток/мл и сухой вес клеток (CDW) в г/л. Можно учесть фактор разведения, длину оптического пути, объём культуры и задать собственные коэффициенты для штамма, среды и прибора.
Когда использовать
Чтобы оценить концентрацию клеток E. coli по показанию OD600.
Чтобы пересчитать оптическую плотность в сухой вес биомассы и общий CDW культуры.
Чтобы учесть разведение образца и проверить, не превышает ли нормированная OD линейный диапазон.
Как это работает
1Введите показание OD600, фактор разведения и длину оптического пути кюветы.
2Калькулятор рассчитывает нормированную OD по формуле: показание × фактор разведения ÷ длина пути.
3Нормированная OD умножается на коэффициент клеток на единицу OD и коэффициент CDW в г/л.
4При указанном объёме культуры рассчитываются общее число клеток и общий сухой вес; при OD выше 1 появляется предупреждение о линейности.
Сценарии использования
Оценка плотности культуры перед сбором клеток или последующей обработкой.
Расчёт микробной биомассы в г/л и общего сухого веса для заданного объёма.
Учебная интерпретация OD600 и планирование измерений с учётом разведения.
Примеры
1. Культура в лог-фазе: OD600 0,5
Лаборант
Контекст
Неразведённая культура E. coli измерена в кювете с оптическим путём 1 см. Объём культуры составляет 25 мл.
Проблема
Нужно быстро оценить концентрацию клеток, сухой вес и суммарные показатели культуры.
Как использовать
Введите OD600 0,5, фактор разведения 1, длину пути 1 см, стандартные коэффициенты и объём 25 мл.
OD600: 0,5; разведение: 1; путь: 1 см; клеток на OD: 1×10⁹; CDW на OD: 0,36 г/л; объём: 25 мл.
Результат
Нормированная OD равна 0,5; расчётная концентрация — 5×10⁸ клеток/мл, CDW — 0,18 г/л. В 25 мл примерно 1,25×10¹⁰ клеток и 0,0045 г CDW.
2. Разведение 1:10 и OD выше линейного диапазона
Исследователь микробиологии
Контекст
Поздняя культура измерена после разведения 1:10 и показала OD600 0,25 в кювете с путём 1 см.
Проблема
Нужно восстановить значение исходной культуры и понять, можно ли считать измерение линейным.
Как использовать
Введите OD600 0,25, фактор разведения 10, длину пути 1 см и стандартные коэффициенты. Объём можно оставить равным 0.
FAQ
Какие значения коэффициентов используются по умолчанию?
Для E. coli используются 1×10⁹ клеток/мл на единицу OD и 0,36 г/л CDW на единицу OD.
Как учитывается разведение образца?
Показание OD600 умножается на фактор разведения перед расчётом концентрации и CDW.
Зачем указывать длину оптического пути?
Показание нормируется к стандартному пути 1 см: OD = показание × фактор разведения ÷ длина пути.
Что означает предупреждение при OD выше 1?
Нормированная OD находится выше ориентировочного линейного диапазона; образец рекомендуется разбавить сильнее и измерить повторно.
Можно ли использовать собственные коэффициенты?
Да. Коэффициенты клеток на OD и CDW на OD можно изменить с учётом штамма, среды и прибора.
OD600: 0,25; разведение: 10; путь: 1 см; клеток на OD: 1×10⁹; CDW на OD: 0,36 г/л; объём: 0 мл.
Результат
Нормированная OD равна 2,5, расчётная концентрация — 2,5×10⁹ клеток/мл, CDW — 0,9 г/л. Появится предупреждение: значение выше линейного диапазона, образец следует разбавить сильнее.