Calculadora de escore LOD (análise de ligação)

Calculadora de escore LOD (análise de ligação) | Ferramenta online grátis | Elysia Tools

Guia de uso da ferramenta

Veja quando usar esta ferramenta, o que ela suporta e como os usuários a aplicam.

Fatos principais

Categoria: Education
Tipos de entrada: select, number
Tipo de saída: json
Cobertura de exemplos: 4
API pronta: Sim

Visão geral

Calcule escores LOD para análise de ligação genética de dois pontos usando o número de meioses recombinantes e não recombinantes. A ferramenta estima θ̂ e o LOD máximo ou avalia o LOD em um valor fixo de θ, com interpretação pelos limiares clássicos de Morton.

Quando usar

Para estimar a fração de recombinação θ̂ = r/N e o LOD máximo de uma amostra.
Para testar a evidência de ligação genética em uma fração de recombinação específica.
Para comparar escores na tabela da curva LOD entre θ = 0,05 e 0,45.

Como funciona

1Escolha entre calcular o LOD máximo ou avaliar o LOD em θ fixo.
2Informe as quantidades de meioses recombinantes e não recombinantes.
3No modo fixo, defina um valor de θ maior que 0 e menor que 0,5.
4Consulte o resultado, os metadados do cálculo e a conclusão baseada em Z ≥ 3, Z ≤ −2 ou intervalo inconclusivo.

Casos de uso

Resolver exercícios de genética mendeliana e ligação de dois pontos.
Avaliar se contagens familiares oferecem evidência a favor ou contra ligação.
Explorar como diferentes valores de θ alteram o escore LOD.

Exemplos

1. Evidência significativa de ligação

Estudante de genética

Contexto

Uma amostra contém 20 meioses informativas, sendo 2 recombinantes e 18 não recombinantes.

Problema

Estimar a fração de recombinação e verificar se os dados sustentam ligação genética.

Como usar

Selecione “LOD máximo”, informe 2 recombinantes, 18 não recombinantes e escolha 4 casas decimais.

Modo: LOD máximo; recombinantes: 2; não recombinantes: 18; casas decimais: 4.

Resultado

A estimativa é θ̂ = 0,1 e Zmax = 3,197, indicando evidência significativa a favor da ligação.

2. Ligação excluída em θ = 0,1

Professor de genética

Contexto

Um conjunto de 20 meioses apresenta 10 recombinantes e 10 não recombinantes.

Problema

Avaliar se os dados são compatíveis com ligação na fração de recombinação θ = 0,1.

Como usar

Selecione “Avaliar LOD em θ fixo”, informe as duas contagens como 10, defina θ como 0,1 e use 4 casas decimais.

Perguntas frequentes

O que é um escore LOD?

É o logaritmo decimal da razão entre a probabilidade dos dados sob ligação em determinado θ e sob ausência de ligação, com θ = 0,5.

Qual é a diferença entre LOD máximo e LOD em θ fixo?

O LOD máximo usa θ̂ = r/N; o modo fixo calcula o escore no valor de θ informado.

Como interpretar o resultado?

Z ≥ 3 favorece significativamente a ligação, Z ≤ −2 é evidência significativa contra e valores intermediários são inconclusivos.

Quais contagens devo informar?

Informe o número de meioses recombinantes e o número de meioses não recombinantes observados.

A calculadora pode substituir uma análise genética completa?

Não. Ela realiza uma análise educativa de ligação de dois pontos e não substitui avaliação genética especializada.

Modo: θ fixo; recombinantes: 10; não recombinantes: 10; θ: 0,1; casas decimais: 4.

Executar esta ferramenta

Exemplos compatíveis com esta ferramenta

Continue com ferramentas e temas relacionados

Veja quando usar esta ferramenta, o que ela suporta e como os usuários a aplicam.

Fatos principais

Visão geral

Quando usar

Como funciona

Casos de uso

Exemplos

1. Evidência significativa de ligação

2. Ligação excluída em θ = 0,1

Perguntas frequentes

Exemplos de Processamento de Imagem Web Python

Exemplos de Análise de Logs ELK Stack

Exemplos de Processamento de Imagem Android Java

Exemplos de Processamento de Imagem Android Kotlin

Analisador de pedigree de herança autossômica dominante

Calculadora do coeficiente de endogamia (F de Wright)

Calculadora do coeficiente de parentesco (r e φ)

Calculadora de probabilidade em pedigree (árvore de probabilidade)