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Calculadora de escore LOD (análise de ligação)
Análise de ligação de dois pontos por escores LOD: LOD(θ) = log10[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0.5^N], com r meioses recombinantes e N meioses informativas totais. A estimativa de máxima verossimilhança é θ̂ = r/N; calcula o LOD máximo (Zmax) ou o LOD em θ fixo, com tabela da curva LOD para θ = 0.05–0.45. Limiares clássicos (Morton 1955): Z ≥ 3 evidência significativa de ligação (1000:1); Z ≤ −2 evidência significativa contra; entre ambos, inconclusivo. Fontes: Morton 1955, Ott 1999, Griffiths, StatPearls. Apenas uso educativo.
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Exemplos
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Guia de uso da ferramenta
Veja quando usar esta ferramenta, o que ela suporta e como os usuários a aplicam.
Fatos principais
Categoria
Education
Tipos de entrada
select, number
Tipo de saída
json
Cobertura de exemplos
4
API pronta
Sim
Visão geral
Calcule escores LOD para análise de ligação genética de dois pontos usando o número de meioses recombinantes e não recombinantes. A ferramenta estima θ̂ e o LOD máximo ou avalia o LOD em um valor fixo de θ, com interpretação pelos limiares clássicos de Morton.
Quando usar
Para estimar a fração de recombinação θ̂ = r/N e o LOD máximo de uma amostra.
Para testar a evidência de ligação genética em uma fração de recombinação específica.
Para comparar escores na tabela da curva LOD entre θ = 0,05 e 0,45.
Como funciona
1Escolha entre calcular o LOD máximo ou avaliar o LOD em θ fixo.
2Informe as quantidades de meioses recombinantes e não recombinantes.
3No modo fixo, defina um valor de θ maior que 0 e menor que 0,5.
4Consulte o resultado, os metadados do cálculo e a conclusão baseada em Z ≥ 3, Z ≤ −2 ou intervalo inconclusivo.
Casos de uso
Resolver exercícios de genética mendeliana e ligação de dois pontos.
Avaliar se contagens familiares oferecem evidência a favor ou contra ligação.
Explorar como diferentes valores de θ alteram o escore LOD.
Exemplos
1. Evidência significativa de ligação
Estudante de genética
Contexto
Uma amostra contém 20 meioses informativas, sendo 2 recombinantes e 18 não recombinantes.
Problema
Estimar a fração de recombinação e verificar se os dados sustentam ligação genética.
Como usar
Selecione “LOD máximo”, informe 2 recombinantes, 18 não recombinantes e escolha 4 casas decimais.