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Calcule le burst size d'une expérience de croissance en une étape : burst = (PFU/mL libres après lyse − PFU/mL inoculés) ÷ cellules infectées, où cellules infectées = densité cellulaire × pourcentage infecté. Le pourcentage s'estime par l'adsorption de Poisson P = 1 − e^(−MOI) : MOI 1 ≈ 63%, MOI 2 ≈ 86%, MOI 3 ≈ 95%, MOI 5 ≈ 99%. Interprétation : <20 faible, 20–100 courant (λ ≈ 50–100), 100–300 élevé (type T4 ≈ 100–200+), >300 à vérifier.
Appelez cet outil depuis votre code en trois langages.
curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/fr/api/tools/phage-burst-size' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"pfuAfterLysis":5010000000,"pfuInoculated":10000000,"cellDensity":100000000,"infectionPercent":50,"decimalPlaces":1}'Envoyez une requête POST avec vos entrées en JSON. Les paramètres de type fichier nécessitent un upload préalable.
POST http://127.0.0.1:3003/fr/api/tools/phage-burst-size| Nom | Type | Requis | Description |
|---|---|---|---|
| pfuAfterLysis | number | Oui | Free phage in the lysate at the end of the one-step growth curve. |
| pfuInoculated | number | Oui | Phage added at the start of infection (0 is acceptable when negligible). |
| cellDensity | number | Oui | Host cell density when phage was added (e.g. mid-log ~1×10⁸ cells/mL). |
| infectionPercent | number | Oui | Infected fraction in %. From MOI via Poisson: 1 ≈ 63%, 2 ≈ 86%, 3 ≈ 95%, 5 ≈ 99%. |
| decimalPlaces |
Ajoutez cet outil à votre serveur Model Context Protocol pour que les agents IA puissent le lister et l'appeler.
Ajoutez ce bloc à la configuration de votre client MCP :
{
"mcpServers": {
"elysiatools-phage-burst-size": {
"name": "phage-burst-size",
"description": "Calcule le burst size d'une expérience de croissance en une étape : burst = (PFU/mL libres après lyse − PFU/mL inoculés) ÷ cellules infectées, où cellules infectées = densité cellulaire × pourcentage infecté. Le pourcentage s'estime par l'adsorption de Poisson P = 1 − e^(−MOI) : MOI 1 ≈ 63%, MOI 2 ≈ 86%, MOI 3 ≈ 95%, MOI 5 ≈ 99%. Interprétation : <20 faible, 20–100 courant (λ ≈ 50–100), 100–300 élevé (type T4 ≈ 100–200+), >300 à vérifier.",
"baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=phage-burst-size",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Après connexion au point d'accès SSE, listez les outils exposés :
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Appelez l'outil par son id ; les arguments sont construits à partir de ses paramètres :
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "phage-burst-size",
"arguments": {
"pfuAfterLysis": 5010000000,
"pfuInoculated": 10000000,
"cellDensity": 100000000,
"infectionPercent": 50,
"decimalPlaces": 1
}
}
}| number |
| Non |
| — |
Résultat JSON
{
"key": {...},
"metadata": {
"key": "value"
},
"error": "Error message (optional)",
"message": "Notification message (optional)"
}Des questions ou un problème ? Contactez [email protected]