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Calculadora de longitud de fragmentos de restricción
Estima los tamaños de los fragmentos tras la digestión: un sustrato circular con n cortes produce n fragmentos (envolviendo el origen) y uno lineal produce n+1. El modo de posiciones calcula fragmentos exactos a partir de coordenadas separadas por comas; el modo de número de sitios da el recuento y la media con distribución uniforme. Incluye la frecuencia esperada de sitios en ADN aleatorio: cortadores de 4 bases ~1 cada 256 bp, de 6 bases ~1 cada 4096 bp (REBASE/Sambrook), y avisos de resolución en agarosa (<50 bp puede perderse). Fuentes: Sambrook & Russell 3.ª ed., REBASE. Solo para educación.
Inicio rápido
Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/es/api/tools/restriction-fragment-length' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"topology":"circular","inputMode":"positions","substrateLengthBp":2686,"cutPositions":"1000, 2000","cutSiteCount":2,"decimalPlaces":2}'Referencia de la API
Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/es/api/tools/restriction-fragment-lengthParámetros
| Nombre | Tipo | Obligatorio | Descripción |
|---|---|---|---|
| topology | select | Sí | Circular plasmids give n fragments from n cuts; linear DNA gives n+1. |
| inputMode | select | Sí | Enter exact cut positions, or just the number of cut sites for an average estimate. |
| substrateLengthBp | number | Sí | Total length of the substrate (plasmid or linear DNA) in base pairs. |
| cutPositions | text | Sí | Cut coordinates counted from base 1 (positions mode); each must be strictly inside the substrate and unique. |
| cutSiteCount |
Integración MCP
Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.
Configuración del servidor
Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-restriction-fragment-length": {
"name": "restriction-fragment-length",
"description": "Estima los tamaños de los fragmentos tras la digestión: un sustrato circular con n cortes produce n fragmentos (envolviendo el origen) y uno lineal produce n+1. El modo de posiciones calcula fragmentos exactos a partir de coordenadas separadas por comas; el modo de número de sitios da el recuento y la media con distribución uniforme. Incluye la frecuencia esperada de sitios en ADN aleatorio: cortadores de 4 bases ~1 cada 256 bp, de 6 bases ~1 cada 4096 bp (REBASE/Sambrook), y avisos de resolución en agarosa (<50 bp puede perderse). Fuentes: Sambrook & Russell 3.ª ed., REBASE. Solo para educación.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=restriction-fragment-length",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Listar herramientas disponibles
Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Llamar a esta herramienta
Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "restriction-fragment-length",
"arguments": {
"topology": "circular",
"inputMode": "positions",
"substrateLengthBp": 2686,
"cutPositions": "1000, 2000",
"cutSiteCount": 2,
"decimalPlaces": 2
}
}
}