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Calculadora de peso molecular de proteínas (por secuencia)

Calcula el peso molecular de una proteína a partir de su secuencia: MW = Σ masas promedio de residuos + H₂O (18,01524 Da), con la misma tabla que ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). La entrada no distingue mayúsculas y se limpian espacios y separadores * - .; los códigos ambiguos (B/J/O/U/X/Z) no se suman pero se cuentan y reportan. El resultado es la cadena polipeptídica sin modificar: sin eliminación de péptido señal, puentes disulfuro (−2H por puente), PTMs ni etiquetas. Devuelve kDa, masa media por residuo y longitud. Fuentes: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), manual de Fasman. Solo para educación.

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Inicio rápido

Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/protein-molecular-weight' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH","decimalPlaces":2}'

Referencia de la API

Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/protein-molecular-weight

Parámetros

Nombre	Tipo	Obligatorio	Descripción
sequence	textarea	Sí	One-letter amino-acid sequence (case-insensitive; spaces and * - . separators are ignored).
decimalPlaces	number	No	—

Formato de respuesta

Resultado JSON

JSON

{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}

Integración MCP

Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.

Configuración del servidor

Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-protein-molecular-weight": {
      "name": "protein-molecular-weight",
      "description": "Calcula el peso molecular de una proteína a partir de su secuencia: MW = Σ masas promedio de residuos + H₂O (18,01524 Da), con la misma tabla que ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). La entrada no distingue mayúsculas y se limpian espacios y separadores * - .; los códigos ambiguos (B/J/O/U/X/Z) no se suman pero se cuentan y reportan. El resultado es la cadena polipeptídica sin modificar: sin eliminación de péptido señal, puentes disulfuro (−2H por puente), PTMs ni etiquetas. Devuelve kDa, masa media por residuo y longitud. Fuentes: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), manual de Fasman. Solo para educación.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=protein-molecular-weight",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar herramientas disponibles

Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Llamar a esta herramienta

Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "protein-molecular-weight",
    "arguments": {
  "sequence": "MGSSHHHHHHSSGLVPRGSH",
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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