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Calculadora de masa de péptidos (monoisotópica/media)

Calcula la masa de un péptido sumando residuos: M = Σ masas de residuo + H₂O (tabla ExPASy ProtParam). Dos modos: monoisotópica (H₂O = 18,01056, ideal para péptidos cortos en MS de alta resolución) o promedio (H₂O = 18,01524, para cadenas más largas), con los iones [M+H]⁺, [M+Na]⁺ y [M+2H]²⁺. La secuencia no distingue mayúsculas y se ignoran espacios y separadores; los códigos ambiguos B/J/O/U/X/Z se rechazan. Fuente: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Solo para educación.

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Inicio rápido

Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/peptide-mass-calculator' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"DRVYIHPF","massType":"monoisotopic","decimalPlaces":4}'

Referencia de la API

Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/peptide-mass-calculator

Parámetros

Nombre	Tipo	Obligatorio	Descripción
sequence	text	Sí	Single-letter amino acid codes; 1–200 residues.
massType	select	Sí	Monoisotopic for short peptides in HRMS; average for longer chains.
decimalPlaces	number	No	—

Formato de respuesta

Resultado JSON

JSON

{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}

Integración MCP

Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.

Configuración del servidor

Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-peptide-mass-calculator": {
      "name": "peptide-mass-calculator",
      "description": "Calcula la masa de un péptido sumando residuos: M = Σ masas de residuo + H₂O (tabla ExPASy ProtParam). Dos modos: monoisotópica (H₂O = 18,01056, ideal para péptidos cortos en MS de alta resolución) o promedio (H₂O = 18,01524, para cadenas más largas), con los iones [M+H]⁺, [M+Na]⁺ y [M+2H]²⁺. La secuencia no distingue mayúsculas y se ignoran espacios y separadores; los códigos ambiguos B/J/O/U/X/Z se rechazan. Fuente: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005). Solo para educación.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=peptide-mass-calculator",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar herramientas disponibles

Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Llamar a esta herramienta

Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "peptide-mass-calculator",
    "arguments": {
  "sequence": "DRVYIHPF",
  "massType": "monoisotopic",
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

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