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Calculadora de Tm de oligonucleótidos (corrección por sal)

Dos estimaciones clásicas de Tm: la regla de Wallace Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (oligos cortos <14 nt, sin dependencia de sal) y la fórmula con corrección por sal Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 p.11.46, la misma de Primer3; el término de longitud varía 500–675/n según la fuente). El modo automático elige por longitud. Devuelve %GC, composición y ambas estimaciones. Son aproximaciones — para precisión de diseño use termodinámica de vecinos más cercanos (herramienta pcr-primer-tm). Supuestos: ADN, sin desapareamientos, sin formamida/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Fuentes: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Solo para educación.

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Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/es/api/tools/oligo-melting-temperature' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"ATGCATGCATGCATGCATGC","method":"auto","sodiumMm":50,"decimalPlaces":2}'

Referencia de la API

Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.

Endpoint

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/es/api/tools/oligo-melting-temperature

Parámetros

Nombre	Tipo	Obligatorio	Descripción
sequence	text	Sí	DNA sequence, A/C/G/T only (spaces stripped, case-insensitive), 4–200 nt.
method	select	Sí	Auto uses Wallace below 14 nt and the salt-corrected formula from 14 nt up.
sodiumMm	number	Sí	Total [Na⁺] (or equivalent monovalent) of the buffer; used by the salt-corrected formula.
decimalPlaces	number	No	—

Formato de respuesta

Resultado JSON

Integración MCP

Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.

Configuración del servidor

Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-oligo-melting-temperature": {
      "name": "oligo-melting-temperature",
      "description": "Dos estimaciones clásicas de Tm: la regla de Wallace Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (oligos cortos <14 nt, sin dependencia de sal) y la fórmula con corrección por sal Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 p.11.46, la misma de Primer3; el término de longitud varía 500–675/n según la fuente). El modo automático elige por longitud. Devuelve %GC, composición y ambas estimaciones. Son aproximaciones — para precisión de diseño use termodinámica de vecinos más cercanos (herramienta pcr-primer-tm). Supuestos: ADN, sin desapareamientos, sin formamida/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Fuentes: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Solo para educación.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=oligo-melting-temperature",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar herramientas disponibles

Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Llamar a esta herramienta

Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "oligo-melting-temperature",
    "arguments": {
  "sequence": "ATGCATGCATGCATGCATGC",
  "method": "auto",
  "sodiumMm": 50,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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