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Calculadora de pureza de ácidos nucleicos (OD260/280)

Evalúa la pureza de ácidos nucleicos por el ratio OD260/280: las bases absorben máximo a 260 nm y los aminoácidos aromáticos (y el fenol) cerca de 280 nm, así que A260/A280 diagnostica arrastre de proteína/fenol. Valores esperados: ADN puro ≈ 1.8 (ventana 1.7–2.0), ARN puro ≈ 2.0 (ventana 1.8–2.2); ADN < 1.7 o ARN < 1.8 indica contaminación por proteína/fenol/guanidina, ADN > 2.0 sugiere contaminación con ARN, ARN > 2.2 apunta a artefacto de medición (baja fuerza iónica). Campo opcional A230 para el ratio secundario A260/A230 (puro 2.0–2.2; menor indica guanidina/fenol/carbohidratos/sales). Con lecturas < ~0.05 el ratio no es fiable. Fuentes: Manchester 1995, Sambrook & Russell, Thermo Fisher T042. Solo educación y planificación.

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Inicio rápido

Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/od260-280-ratio' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"nucleicAcidType":"DNA","a260":0.45,"a280":0.25,"a230":0.2,"decimalPlaces":2}'

Referencia de la API

Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/od260-280-ratio

Parámetros

Nombre	Tipo	Obligatorio	Descripción
nucleicAcidType	select	Sí	Expected ratio: DNA ~1.8, RNA ~2.0 — the acceptable window shifts with type.
a260	number	Sí	Absorbance at 260 nm (nucleic acid peak), same diluted sample as the A280 reading.
a280	number	Sí	Absorbance at 280 nm (protein/phenol peak) of the same diluted sample.
a230	number	No	Absorbance at 230 nm; enter 0 to skip the secondary A260/A230 ratio.
decimalPlaces	number

Integración MCP

Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.

Configuración del servidor

Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-od260-280-ratio": {
      "name": "od260-280-ratio",
      "description": "Evalúa la pureza de ácidos nucleicos por el ratio OD260/280: las bases absorben máximo a 260 nm y los aminoácidos aromáticos (y el fenol) cerca de 280 nm, así que A260/A280 diagnostica arrastre de proteína/fenol. Valores esperados: ADN puro ≈ 1.8 (ventana 1.7–2.0), ARN puro ≈ 2.0 (ventana 1.8–2.2); ADN < 1.7 o ARN < 1.8 indica contaminación por proteína/fenol/guanidina, ADN > 2.0 sugiere contaminación con ARN, ARN > 2.2 apunta a artefacto de medición (baja fuerza iónica). Campo opcional A230 para el ratio secundario A260/A230 (puro 2.0–2.2; menor indica guanidina/fenol/carbohidratos/sales). Con lecturas < ~0.05 el ratio no es fiable. Fuentes: Manchester 1995, Sambrook & Russell, Thermo Fisher T042. Solo educación y planificación.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=od260-280-ratio",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar herramientas disponibles

Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Llamar a esta herramienta

Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "od260-280-ratio",
    "arguments": {
  "nucleicAcidType": "DNA",
  "a260": 0.45,
  "a280": 0.25,
  "a230": 0.2,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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