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Calculadora de puntaje LOD (análisis de ligamiento)
Análisis de ligamiento de dos puntos mediante puntajes LOD: LOD(θ) = log10[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0.5^N], con r meiosis recombinantes y N meiosis informativas totales. La estimación de máxima verosimilitud es θ̂ = r/N; calcula el LOD máximo (Zmax) o el LOD en un θ fijo, con tabla de la curva LOD para θ = 0.05–0.45. Umbrales clásicos (Morton 1955): Z ≥ 3 evidencia significativa de ligamiento (1000:1); Z ≤ −2 evidencia significativa en contra; entre ambos, inconcluso. Fuentes: Morton 1955, Ott 1999, Griffiths, StatPearls. Solo uso educativo.
Inicio rápido
Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/es/api/tools/lod-score-calculator' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"thetaMode":"max","recombinantCount":2,"nonRecombinantCount":18,"theta":0.1,"decimalPlaces":4}'Referencia de la API
Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/es/api/tools/lod-score-calculatorParámetros
| Nombre | Tipo | Obligatorio | Descripción |
|---|---|---|---|
| thetaMode | select | Sí | Report the maximum LOD at θ̂ = r/N, or evaluate the LOD at a fixed θ. |
| recombinantCount | number | Sí | Number of recombinant meioses observed (r). |
| nonRecombinantCount | number | Sí | Number of non-recombinant meioses observed. |
| theta | number | Sí | Recombination fraction at which to evaluate the LOD in fixed-θ mode (0 < θ < 0.5). |
| decimalPlaces | number |
Integración MCP
Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.
Configuración del servidor
Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-lod-score-calculator": {
"name": "lod-score-calculator",
"description": "Análisis de ligamiento de dos puntos mediante puntajes LOD: LOD(θ) = log10[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0.5^N], con r meiosis recombinantes y N meiosis informativas totales. La estimación de máxima verosimilitud es θ̂ = r/N; calcula el LOD máximo (Zmax) o el LOD en un θ fijo, con tabla de la curva LOD para θ = 0.05–0.45. Umbrales clásicos (Morton 1955): Z ≥ 3 evidencia significativa de ligamiento (1000:1); Z ≤ −2 evidencia significativa en contra; entre ambos, inconcluso. Fuentes: Morton 1955, Ott 1999, Griffiths, StatPearls. Solo uso educativo.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=lod-score-calculator",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Listar herramientas disponibles
Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Llamar a esta herramienta
Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "lod-score-calculator",
"arguments": {
"thetaMode": "max",
"recombinantCount": 2,
"nonRecombinantCount": 18,
"theta": 0.1,
"decimalPlaces": 4
}
}
}