Zwei-Punkt-Kopplungsanalyse mit LOD-Scores: LOD(θ) = log10[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0.5^N], mit r rekombinanten und N insgesamt informativen Meiosen. Die Maximum-Likelihood-Schätzung ist θ̂ = r/N; berechnet den maximalen LOD (Zmax) oder den LOD bei festem θ, inklusive LOD-Kurventabelle für θ = 0.05–0.45. Klassische Schwellen (Morton 1955): Z ≥ 3 signifikante Kopplung (1000:1); Z ≤ −2 signifikant dagegen; dazwischen nicht schlüssig. Quellen: Morton 1955, Ott 1999, Griffiths, StatPearls. Nur für Bildungszwecke.
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Leitfaden zur Tool-Nutzung
Erfahren Sie, wann dieses Tool passt, was es unterstützt und wie Nutzer es anwenden.
Wichtige Fakten
Kategorie
Education
Eingabetypen
select, number
Ausgabetyp
json
Sample-Abdeckung
4
API bereit
Ja
Überblick
Der LOD-Score-Rechner führt eine Zwei-Punkt-Kopplungsanalyse anhand rekombinanter und nicht rekombinanter Meiosen durch. Er berechnet wahlweise den maximalen LOD-Score mit geschätztem Rekombinationsanteil θ̂ oder den LOD-Score bei einem festen θ und liefert zusätzlich eine LOD-Kurventabelle.
Wann verwenden
Wenn Sie prüfen möchten, ob Beobachtungsdaten für eine genetische Kopplung zwischen zwei Loci sprechen.
Wenn Sie den Maximum-Likelihood-Schätzer θ̂ = r/N und den zugehörigen maximalen LOD-Score benötigen.
Wenn Sie eine Kopplungshypothese für einen festgelegten Rekombinationsanteil θ bewerten möchten.
So funktioniert es
1Wählen Sie zwischen dem maximalen LOD mit geschätztem θ und der Auswertung bei einem festen θ.
2Geben Sie die Anzahl der rekombinanten und nicht rekombinanten Meiosen ein.
3Tragen Sie im Modus mit festem θ einen Rekombinationsanteil zwischen 0 und 0,5 ein und legen Sie bei Bedarf die Dezimalstellen fest.
4Der Rechner gibt den LOD-Score, relevante Ergebniswerte, eine Schlussfolgerung anhand der klassischen Schwellen und eine Kurventabelle für θ = 0,05 bis 0,45 aus.
Anwendungsfälle
Auswertung von Kreuzungs- oder Stammbuchdaten in Übungen zur mendelschen Genetik.
Vergleich der Kopplungsevidenz bei unterschiedlichen Rekombinationsanteilen.
Veranschaulichung der Morton-Schwellen in Lehrveranstaltungen zur Genkartierung.
Beispiele
1. Signifikante Kopplung aus 20 informativen Meiosen
Genetikstudentin
Hintergrund
In einer Übungsaufgabe wurden 2 rekombinante und 18 nicht rekombinante Meiosen beobachtet.
Aufgabe
Der geschätzte Rekombinationsanteil und der maximale LOD-Score sollen bestimmt werden.
Verwendung
Den Modus „Maximaler LOD (θ schätzen)“ wählen, 2 Rekombinanten und 18 Nicht-Rekombinanten eingeben und auf 4 Dezimalstellen rechnen.