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Rekombinationsfrequenz- und Karten-Distanz-Rechner (cM)

Rechnet zwischen Rekombinationsfrequenz und kartografischer Distanz um. r = Rekombinanten / Gesamtnachkommen (r ≤ 0.5; strebt für weit entfernte Gene oder verschiedene Chromosomen gegen 0.5). Drei Mapping-Funktionen (d in Morgan, 1 M = 100 cM): linear d = r (nur kurze Distanzen); Haldane 1919: d = −½ln(1−2r) (ohne Interferenz); Kosambi 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (positive Interferenz). Sie korrigieren die Unterschätzung durch Doppel-Crossover: bei gleichem r gilt Haldane ≥ Kosambi ≥ linear. Der Intervallmodus summiert Distanzen und sagt r über die Umkehrfunktionen vorher (Gesamtkarte > 50 cM möglich, während r bei 50% sättigt). Quellen: Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Nur für Bildungszwecke.

json· JSON-ErgebnisWerkzeug öffnen

Schnellstart

Rufen Sie dieses Werkzeug aus Ihrem Code in drei Sprachen auf.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/de/api/tools/recombination-frequency-map' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"mode":"counts","recombinantCount":18,"totalProgeny":100,"intervalDistances":"","decimalPlaces":4}'

API-Referenz

Senden Sie eine POST-Anfrage mit Ihren Eingaben als JSON. Dateiparameter erfordern einen vorherigen Upload.

Endpunkt

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/de/api/tools/recombination-frequency-map

Parameter

Name	Typ	Erforderlich	Beschreibung
mode	select	Ja	From recombination counts, or from a list of map intervals.
recombinantCount	number	Ja	Recombinant offspring in a testcross (counts mode).
totalProgeny	number	Ja	Total offspring scored (counts mode).
intervalDistances	text	Nein	Comma-separated adjacent interval distances in centimorgans (intervals mode).
decimalPlaces	number

MCP-Integration

Fügen Sie dieses Werkzeug Ihrem Model-Context-Protocol-Server hinzu, damit KI-Agenten es auflisten und aufrufen können.

Serverkonfiguration

Fügen Sie diesen Block Ihrer MCP-Client-Konfiguration hinzu:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-recombination-frequency-map": {
      "name": "recombination-frequency-map",
      "description": "Rechnet zwischen Rekombinationsfrequenz und kartografischer Distanz um. r = Rekombinanten / Gesamtnachkommen (r ≤ 0.5; strebt für weit entfernte Gene oder verschiedene Chromosomen gegen 0.5). Drei Mapping-Funktionen (d in Morgan, 1 M = 100 cM): linear d = r (nur kurze Distanzen); Haldane 1919: d = −½ln(1−2r) (ohne Interferenz); Kosambi 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (positive Interferenz). Sie korrigieren die Unterschätzung durch Doppel-Crossover: bei gleichem r gilt Haldane ≥ Kosambi ≥ linear. Der Intervallmodus summiert Distanzen und sagt r über die Umkehrfunktionen vorher (Gesamtkarte > 50 cM möglich, während r bei 50% sättigt). Quellen: Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Nur für Bildungszwecke.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=recombination-frequency-map",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Verfügbare Werkzeuge auflisten

Nach dem Verbinden mit dem SSE-Endpunkt listen Sie die bereitgestellten Werkzeuge auf:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Dieses Werkzeug aufrufen

Rufen Sie das Werkzeug über seine ID auf; Argumente werden aus seiner Parameterliste gebildet:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "recombination-frequency-map",
    "arguments": {
  "mode": "counts",
  "recombinantCount": 18,
  "totalProgeny": 100,
  "intervalDistances": "",
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

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