Health

Phagen-Burst-Size-Rechner (Ein-Schritt-Wachstum)

Berechnet die Burst Size aus einem Ein-Schritt-Wachstumsversuch: Burst = (freie PFU/mL nach Lyse − inokulierte PFU/mL) ÷ infizierte Zellen, wobei infizierte Zellen = Zelldichte × infizierter Anteil. Der Anteil lässt sich über Poisson-Adsorption P = 1 − e^(−MOI) schätzen: MOI 1 ≈ 63%, MOI 2 ≈ 86%, MOI 3 ≈ 95%, MOI 5 ≈ 99%. Interpretation: <20 niedrig, 20–100 üblich (λ ≈ 50–100), 100–300 hoch (T4-ähnlich ≈ 100–200+), >300 prüfen.

json· JSON-ErgebnisWerkzeug öffnen

Schnellstart

Rufen Sie dieses Werkzeug aus Ihrem Code in drei Sprachen auf.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/de/api/tools/phage-burst-size' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"pfuAfterLysis":5010000000,"pfuInoculated":10000000,"cellDensity":100000000,"infectionPercent":50,"decimalPlaces":1}'

API-Referenz

Senden Sie eine POST-Anfrage mit Ihren Eingaben als JSON. Dateiparameter erfordern einen vorherigen Upload.

Endpunkt

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/de/api/tools/phage-burst-size

Parameter

Name	Typ	Erforderlich	Beschreibung
pfuAfterLysis	number	Ja	Free phage in the lysate at the end of the one-step growth curve.
pfuInoculated	number	Ja	Phage added at the start of infection (0 is acceptable when negligible).
cellDensity	number	Ja	Host cell density when phage was added (e.g. mid-log ~1×10⁸ cells/mL).
infectionPercent	number	Ja	Infected fraction in %. From MOI via Poisson: 1 ≈ 63%, 2 ≈ 86%, 3 ≈ 95%, 5 ≈ 99%.
decimalPlaces	number

MCP-Integration

Fügen Sie dieses Werkzeug Ihrem Model-Context-Protocol-Server hinzu, damit KI-Agenten es auflisten und aufrufen können.

Serverkonfiguration

Fügen Sie diesen Block Ihrer MCP-Client-Konfiguration hinzu:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-phage-burst-size": {
      "name": "phage-burst-size",
      "description": "Berechnet die Burst Size aus einem Ein-Schritt-Wachstumsversuch: Burst = (freie PFU/mL nach Lyse − inokulierte PFU/mL) ÷ infizierte Zellen, wobei infizierte Zellen = Zelldichte × infizierter Anteil. Der Anteil lässt sich über Poisson-Adsorption P = 1 − e^(−MOI) schätzen: MOI 1 ≈ 63%, MOI 2 ≈ 86%, MOI 3 ≈ 95%, MOI 5 ≈ 99%. Interpretation: <20 niedrig, 20–100 üblich (λ ≈ 50–100), 100–300 hoch (T4-ähnlich ≈ 100–200+), >300 prüfen.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=phage-burst-size",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Verfügbare Werkzeuge auflisten

Nach dem Verbinden mit dem SSE-Endpunkt listen Sie die bereitgestellten Werkzeuge auf:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Dieses Werkzeug aufrufen

Rufen Sie das Werkzeug über seine ID auf; Argumente werden aus seiner Parameterliste gebildet:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "phage-burst-size",
    "arguments": {
  "pfuAfterLysis": 5010000000,
  "pfuInoculated": 10000000,
  "cellDensity": 100000000,
  "infectionPercent": 50,
  "decimalPlaces": 1
}
  }
}

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