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Oligonukleotid-Tm-Rechner (Salzkorrektur)

Zwei klassische Tm-Schätzungen: die Wallace-Regel Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (kurze Oligos <14 nt, ohne Salzabhängigkeit) und die salzkorrigierte Formel Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 S. 11.46, wie in Primer3; der Längenterm variiert je nach Quelle 500–675/n). Der Automatikmodus wählt nach Länge. Ausgabe: %GC, Zusammensetzung und beide Schätzungen. Beide sind Näherungen — für Entwurfsgenauigkeit Nearest-Neighbor-Thermodynamik verwenden (Tool pcr-primer-tm). Annahmen: DNA, keine Fehlpaarungen, ohne Formamid/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Quellen: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Nur für Ausbildung.

json· JSON-ErgebnisWerkzeug öffnen

Schnellstart

Rufen Sie dieses Werkzeug aus Ihrem Code in drei Sprachen auf.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/de/api/tools/oligo-melting-temperature' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"sequence":"ATGCATGCATGCATGCATGC","method":"auto","sodiumMm":50,"decimalPlaces":2}'

API-Referenz

Senden Sie eine POST-Anfrage mit Ihren Eingaben als JSON. Dateiparameter erfordern einen vorherigen Upload.

Endpunkt

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/de/api/tools/oligo-melting-temperature

Parameter

Name	Typ	Erforderlich	Beschreibung
sequence	text	Ja	DNA sequence, A/C/G/T only (spaces stripped, case-insensitive), 4–200 nt.
method	select	Ja	Auto uses Wallace below 14 nt and the salt-corrected formula from 14 nt up.
sodiumMm	number	Ja	Total [Na⁺] (or equivalent monovalent) of the buffer; used by the salt-corrected formula.
decimalPlaces	number	Nein	—

Antwortformat

JSON-Ergebnis

MCP-Integration

Fügen Sie dieses Werkzeug Ihrem Model-Context-Protocol-Server hinzu, damit KI-Agenten es auflisten und aufrufen können.

Serverkonfiguration

Fügen Sie diesen Block Ihrer MCP-Client-Konfiguration hinzu:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-oligo-melting-temperature": {
      "name": "oligo-melting-temperature",
      "description": "Zwei klassische Tm-Schätzungen: die Wallace-Regel Tm = 2×(A+T) + 4×(G+C) (kurze Oligos <14 nt, ohne Salzabhängigkeit) und die salzkorrigierte Formel Tm = 81.5 + 16.6×log₁₀[Na⁺] + 0.41×(%G+C) − 600/n (Sambrook 1989 S. 11.46, wie in Primer3; der Längenterm variiert je nach Quelle 500–675/n). Der Automatikmodus wählt nach Länge. Ausgabe: %GC, Zusammensetzung und beide Schätzungen. Beide sind Näherungen — für Entwurfsgenauigkeit Nearest-Neighbor-Thermodynamik verwenden (Tool pcr-primer-tm). Annahmen: DNA, keine Fehlpaarungen, ohne Formamid/DMSO, [Na⁺] 0.01–1 M. Quellen: Wallace 1979, von Ahsen 2001, Sambrook & Maniatis, OligoCalc. Nur für Ausbildung.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=oligo-melting-temperature",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Verfügbare Werkzeuge auflisten

Nach dem Verbinden mit dem SSE-Endpunkt listen Sie die bereitgestellten Werkzeuge auf:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Dieses Werkzeug aufrufen

Rufen Sie das Werkzeug über seine ID auf; Argumente werden aus seiner Parameterliste gebildet:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "oligo-melting-temperature",
    "arguments": {
  "sequence": "ATGCATGCATGCATGCATGC",
  "method": "auto",
  "sodiumMm": 50,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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