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OD600-Zelldichte-Rechner (E. coli)

Rechnet OD600-Trübungsmessungen in Zellkonzentration und Zelltrockengewicht (CDW) um: normierte OD = Messwert × Verdünnungsfaktor ÷ Schichtdicke; Zellen/mL = OD × Zellen pro OD-Einheit (standardmäßig 1×10⁹, üblich für E. coli); CDW g/L = OD × g/L pro OD-Einheit (Standard 0.36, BioNumbers 109837; Bereich 0.3–0.5). Beide Faktoren sind editierbar — Stamm, Medium und Gerät beeinflussen sie; die Defaults sind selbstkonsistent: 0.36 g/L ÷ 10⁹ Zellen/mL = 0.36 pg/Zelle. Messungen über OD 1 werden als außerhalb des linearen Bereichs markiert (Sigma-Aldrich). Quellen: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Mit eigener OD-KBE-Kurve kalibrieren. Nur für Ausbildung.

json· JSON-ErgebnisWerkzeug öffnen

Schnellstart

Rufen Sie dieses Werkzeug aus Ihrem Code in drei Sprachen auf.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/de/api/tools/od600-cell-density' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"od600":0.5,"dilutionFactor":1,"pathLengthCm":1,"cellsPerOd":1000000000,"cdwPerOd":0.36,"cultureVolumeMl":25,"decimalPlaces":4}'

API-Referenz

Senden Sie eine POST-Anfrage mit Ihren Eingaben als JSON. Dateiparameter erfordern einen vorherigen Upload.

Endpunkt

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/de/api/tools/od600-cell-density

Parameter

Name	Typ	Erforderlich	Beschreibung
od600	number	Ja	Raw absorbance of the (diluted) sample at 600 nm, blanked against medium.
dilutionFactor	number	Ja	Sample-to-total dilution before measurement (1 = measured undiluted).
pathLengthCm	number	Ja	Cuvette path length (1 cm standard; readings are normalized to 1 cm).
cellsPerOd	number	Ja	Viable+total cells per mL at OD600 = 1 (E. coli default 1×10⁹; range 5×10⁸–1.2×10⁹).
cdwPerOd	number

MCP-Integration

Fügen Sie dieses Werkzeug Ihrem Model-Context-Protocol-Server hinzu, damit KI-Agenten es auflisten und aufrufen können.

Serverkonfiguration

Fügen Sie diesen Block Ihrer MCP-Client-Konfiguration hinzu:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-od600-cell-density": {
      "name": "od600-cell-density",
      "description": "Rechnet OD600-Trübungsmessungen in Zellkonzentration und Zelltrockengewicht (CDW) um: normierte OD = Messwert × Verdünnungsfaktor ÷ Schichtdicke; Zellen/mL = OD × Zellen pro OD-Einheit (standardmäßig 1×10⁹, üblich für E. coli); CDW g/L = OD × g/L pro OD-Einheit (Standard 0.36, BioNumbers 109837; Bereich 0.3–0.5). Beide Faktoren sind editierbar — Stamm, Medium und Gerät beeinflussen sie; die Defaults sind selbstkonsistent: 0.36 g/L ÷ 10⁹ Zellen/mL = 0.36 pg/Zelle. Messungen über OD 1 werden als außerhalb des linearen Bereichs markiert (Sigma-Aldrich). Quellen: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Mit eigener OD-KBE-Kurve kalibrieren. Nur für Ausbildung.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=od600-cell-density",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Verfügbare Werkzeuge auflisten

Nach dem Verbinden mit dem SSE-Endpunkt listen Sie die bereitgestellten Werkzeuge auf:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Dieses Werkzeug aufrufen

Rufen Sie das Werkzeug über seine ID auf; Argumente werden aus seiner Parameterliste gebildet:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "od600-cell-density",
    "arguments": {
  "od600": 0.5,
  "dilutionFactor": 1,
  "pathLengthCm": 1,
  "cellsPerOd": 1000000000,
  "cdwPerOd": 0.36,
  "cultureVolumeMl": 25,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

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