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OD600-Zelldichte-Rechner (E. coli)
Rechnet OD600-Trübungsmessungen in Zellkonzentration und Zelltrockengewicht (CDW) um: normierte OD = Messwert × Verdünnungsfaktor ÷ Schichtdicke; Zellen/mL = OD × Zellen pro OD-Einheit (standardmäßig 1×10⁹, üblich für E. coli); CDW g/L = OD × g/L pro OD-Einheit (Standard 0.36, BioNumbers 109837; Bereich 0.3–0.5). Beide Faktoren sind editierbar — Stamm, Medium und Gerät beeinflussen sie; die Defaults sind selbstkonsistent: 0.36 g/L ÷ 10⁹ Zellen/mL = 0.36 pg/Zelle. Messungen über OD 1 werden als außerhalb des linearen Bereichs markiert (Sigma-Aldrich). Quellen: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Mit eigener OD-KBE-Kurve kalibrieren. Nur für Ausbildung.
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Wichtige Fakten
Kategorie
Education
Eingabetypen
number
Ausgabetyp
json
Sample-Abdeckung
4
API bereit
Ja
Überblick
Der OD600-Zelldichte-Rechner wandelt eine gemessene optische Dichte in normierte OD, Zellen pro mL und Zelltrockengewicht (CDW) in g/L um. Verdünnungsfaktor, Schichtdicke sowie die Faktoren für Zellen und CDW pro OD-Einheit können an Stamm, Medium und Gerät angepasst werden.
Wann verwenden
Wenn eine OD600-Messung in geschätzte Zellen pro mL und mikrobielle Biomasse umgerechnet werden soll.
Wenn Verdünnungsfaktor oder Küvetten-Schichtdicke berücksichtigt werden müssen.
Wenn bei bekanntem Kulturvolumen zusätzlich Gesamtzellzahl und Gesamt-CDW benötigt werden.
So funktioniert es
1Die normierte OD wird aus Messwert × Verdünnungsfaktor ÷ Schichtdicke berechnet.
2Die Zellkonzentration ergibt sich aus normierter OD × Zellen pro mL pro OD600.
3Das Zelltrockengewicht in g/L ergibt sich aus normierter OD × CDW pro OD600.
4Bei einem Kulturvolumen über 0 berechnet das Tool außerdem Gesamtzellzahl und Gesamt-CDW; Werte über OD 1 werden als außerhalb des linearen Bereichs markiert.
Anwendungsfälle
Schnelle Abschätzung der E.-coli-Zellkonzentration aus einer OD600-Messung.
Berechnung der mikrobiellen Biomasse für Kulturvolumina und Versuchsplanung.
Kontrolle verdünnter Messungen und Erkennen von Werten außerhalb des linearen OD-Bereichs.
Beispiele
1. Log-Phase-Kultur mit OD600 0,5
Studierende der Molekularbiologie
Hintergrund
Eine unverdünnte E.-coli-Kultur wird in einer 1-cm-Küvette gemessen. Der Kulturkolben enthält 25 mL.
Aufgabe
Die Messung soll in Zellkonzentration, CDW sowie Gesamtzellzahl und Gesamt-CDW umgerechnet werden.
Verwendung
OD600 0,5, Verdünnungsfaktor 1, Schichtdicke 1 cm, 1×10⁹ Zellen pro mL pro OD, 0,36 g/L CDW pro OD und Kulturvolumen 25 mL eingeben.
OD600: 0,5; Verdünnungsfaktor: 1; Schichtdicke: 1 cm; Zellen pro OD: 1×10⁹; CDW pro OD: 0,36 g/L; Kulturvolumen: 25 mL
Ergebnis
Das Ergebnis beträgt 5×10⁸ Zellen/mL und 0,18 g/L CDW. Für 25 mL werden 1,25×10¹⁰ Zellen und 0,0045 g Gesamt-CDW geschätzt.
2. Verdünnte Probe mit OD600 0,25
Laborpraktikum
Hintergrund
Eine Kulturprobe wurde 1:10 verdünnt und anschließend mit OD600 0,25 gemessen. Das Kulturvolumen wird nicht angegeben.
Aufgabe
Die tatsächliche OD und die daraus abgeleiteten Zell- und CDW-Werte sollen berechnet werden.
Verwendung
OD600 0,25, Verdünnungsfaktor 10, Schichtdicke 1 cm sowie die Standardfaktoren eingeben und das Kulturvolumen auf 0 setzen.
FAQ
Welche Standardwerte verwendet der Rechner?
Standardmäßig verwendet er 1×10⁹ Zellen/mL pro OD600 und 0,36 g/L CDW pro OD600.
Wie wird der Verdünnungsfaktor angewendet?
Der OD600-Messwert wird mit dem Verdünnungsfaktor multipliziert und anschließend durch die Schichtdicke in cm geteilt.
Was bedeutet eine OD über 1?
Sie liegt laut Tool außerhalb des angenommenen linearen Bereichs. Für eine genauere Messung sollte die Probe stärker verdünnt werden.
Kann ich die Umrechnungsfaktoren ändern?
Ja. Die Faktoren für Zellen pro OD und CDW pro OD sind editierbar und können an eigene Kalibrierungen angepasst werden.
Wofür wird das Kulturvolumen benötigt?
Mit dem Kulturvolumen berechnet der Rechner die Gesamtzellzahl und das gesamte Zelltrockengewicht. Bei 0 werden diese Summen übersprungen.
OD600: 0,25; Verdünnungsfaktor: 10; Schichtdicke: 1 cm; Zellen pro OD: 1×10⁹; CDW pro OD: 0,36 g/L; Kulturvolumen: 0 mL
Ergebnis
Die normierte OD beträgt 2,5, entsprechend 2,5×10⁹ Zellen/mL und 0,9 g/L CDW. Der Wert wird als außerhalb des linearen Bereichs markiert; eine stärkere Verdünnung wird empfohlen.