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Ligations-Molverhältnisrechner (Insert:Vektor)
Richtet Ligationen nach NEB ein: pmol = ng × 10³ ÷ (650 × bp). Der Massenmodus nutzt die klassische Formel Insert_ng = Verhältnis × Vektor_ng × (Insert_bp ÷ Vektor_bp) (der Faktor 650 kürzt sich); der Prüfmodus nimmt beide Massen und liefert das tatsächliche Molverhältnis. Empfohlene Bereiche nach Insertgröße: <200 bp 5–10:1, 200–999 bp 3–5:1, ≥1000 bp 1–5:1, mit dem Hinweis, dass Verhältnisse >10:1 vor allem Insert-Konkatemere fördern. Mit Reaktionsvolumen folgen nM-Konzentrationen (Ligase ist empfindlich gegenüber Endkonzentration, >1 nM ist effizienter). Quellen: NEB NEBioCalculator und Ligationsleitfaden, Promega BioMath, Sambrook & Russell. Nur für Ausbildung.
Schnellstart
Rufen Sie dieses Werkzeug aus Ihrem Code in drei Sprachen auf.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/de/api/tools/ligation-molar-ratio' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"mode":"solveInsert","vectorSizeBp":3000,"vectorMassNg":100,"insertSizeBp":1000,"insertMassNg":50,"ratio":3,"reactionVolumeUl":20,"decimalPlaces":3}'API-Referenz
Senden Sie eine POST-Anfrage mit Ihren Eingaben als JSON. Dateiparameter erfordern einen vorherigen Upload.
Endpunkt
POST https://api.elysiatools.com/de/api/tools/ligation-molar-ratioParameter
| Name | Typ | Erforderlich | Beschreibung |
|---|---|---|---|
| mode | select | Ja | Solve for the insert mass a desired ratio needs, or check the actual ratio of two masses. |
| vectorSizeBp | number | Ja | Double-digested vector backbone length in base pairs. |
| vectorMassNg | number | Ja | Mass of the linearized vector in the reaction. |
| insertSizeBp | number | Ja | Insert fragment length in base pairs. |
| insertMassNg | number |
MCP-Integration
Fügen Sie dieses Werkzeug Ihrem Model-Context-Protocol-Server hinzu, damit KI-Agenten es auflisten und aufrufen können.
Serverkonfiguration
Fügen Sie diesen Block Ihrer MCP-Client-Konfiguration hinzu:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-ligation-molar-ratio": {
"name": "ligation-molar-ratio",
"description": "Richtet Ligationen nach NEB ein: pmol = ng × 10³ ÷ (650 × bp). Der Massenmodus nutzt die klassische Formel Insert_ng = Verhältnis × Vektor_ng × (Insert_bp ÷ Vektor_bp) (der Faktor 650 kürzt sich); der Prüfmodus nimmt beide Massen und liefert das tatsächliche Molverhältnis. Empfohlene Bereiche nach Insertgröße: <200 bp 5–10:1, 200–999 bp 3–5:1, ≥1000 bp 1–5:1, mit dem Hinweis, dass Verhältnisse >10:1 vor allem Insert-Konkatemere fördern. Mit Reaktionsvolumen folgen nM-Konzentrationen (Ligase ist empfindlich gegenüber Endkonzentration, >1 nM ist effizienter). Quellen: NEB NEBioCalculator und Ligationsleitfaden, Promega BioMath, Sambrook & Russell. Nur für Ausbildung.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=ligation-molar-ratio",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Verfügbare Werkzeuge auflisten
Nach dem Verbinden mit dem SSE-Endpunkt listen Sie die bereitgestellten Werkzeuge auf:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Dieses Werkzeug aufrufen
Rufen Sie das Werkzeug über seine ID auf; Argumente werden aus seiner Parameterliste gebildet:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "ligation-molar-ratio",
"arguments": {
"mode": "solveInsert",
"vectorSizeBp": 3000,
"vectorMassNg": 100,
"insertSizeBp": 1000,
"insertMassNg": 50,
"ratio": 3,
"reactionVolumeUl": 20,
"decimalPlaces": 3
}
}
}