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PCR-Annealing-Temperatur-Rechner (Ta = Tm − 5°C)

Berechnet die PCR-Annealing-Temperatur (Ta) nach zwei Regeln: die einfache Laborregel Ta = Tm − 5°C (mit dem KLEINEREN Tm des Primerpaares) und die empirische Formel von Rychlik 1990: Ta = 0.3×Tm(Primer) + 0.7×Tm(Produkt) − 14.9 (Produkt-Tm typisch 75–90°C; die Formel liegt bei typischen Paaren 1–8°C über der einfachen Regel). Liefert die empfohlene Ta, einen ±3°C-Gradientenbereich und die Richtung der Justage: zu niedrige Ta gibt unspezifische Banden und Primerdimere, zu hohe kein Produkt; halten Sie die Primer-Tm-Werte innerhalb von 2–3°C und annealen Sie nach dem kleineren. Quellen: Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Nur für die Versuchsplanung.

json· JSON-ErgebnisWerkzeug öffnen

Schnellstart

Rufen Sie dieses Werkzeug aus Ihrem Code in drei Sprachen auf.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/de/api/tools/annealing-temperature-calculator' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"rule":"simple","forwardTm":62,"reverseTm":60,"productTm":85,"decimalPlaces":1}'

API-Referenz

Senden Sie eine POST-Anfrage mit Ihren Eingaben als JSON. Dateiparameter erfordern einen vorherigen Upload.

Endpunkt

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/de/api/tools/annealing-temperature-calculator

Parameter

Name	Typ	Erforderlich	Beschreibung
rule	select	Ja	Simple rule uses the lower primer Tm; Rychlik also weighs the product Tm.
forwardTm	number	Ja	Melting temperature of the forward primer.
reverseTm	number	Ja	Melting temperature of the reverse primer.
productTm	number	Ja	Amplicon melting temperature (typically 75–90°C for a 100–500 bp product); used by the Rychlik formula.
decimalPlaces	number

MCP-Integration

Fügen Sie dieses Werkzeug Ihrem Model-Context-Protocol-Server hinzu, damit KI-Agenten es auflisten und aufrufen können.

Serverkonfiguration

Fügen Sie diesen Block Ihrer MCP-Client-Konfiguration hinzu:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-annealing-temperature-calculator": {
      "name": "annealing-temperature-calculator",
      "description": "Berechnet die PCR-Annealing-Temperatur (Ta) nach zwei Regeln: die einfache Laborregel Ta = Tm − 5°C (mit dem KLEINEREN Tm des Primerpaares) und die empirische Formel von Rychlik 1990: Ta = 0.3×Tm(Primer) + 0.7×Tm(Produkt) − 14.9 (Produkt-Tm typisch 75–90°C; die Formel liegt bei typischen Paaren 1–8°C über der einfachen Regel). Liefert die empfohlene Ta, einen ±3°C-Gradientenbereich und die Richtung der Justage: zu niedrige Ta gibt unspezifische Banden und Primerdimere, zu hohe kein Produkt; halten Sie die Primer-Tm-Werte innerhalb von 2–3°C und annealen Sie nach dem kleineren. Quellen: Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Nur für die Versuchsplanung.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=annealing-temperature-calculator",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Verfügbare Werkzeuge auflisten

Nach dem Verbinden mit dem SSE-Endpunkt listen Sie die bereitgestellten Werkzeuge auf:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Dieses Werkzeug aufrufen

Rufen Sie das Werkzeug über seine ID auf; Argumente werden aus seiner Parameterliste gebildet:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "annealing-temperature-calculator",
    "arguments": {
  "rule": "simple",
  "forwardTm": 62,
  "reverseTm": 60,
  "productTm": 85,
  "decimalPlaces": 1
}
  }
}

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