Elysia Tools
Навигация
Education
Вычисляет число оборотов kcat = Vmax ÷ [E]общ, в мин⁻¹ и с⁻¹. Три входа: Vmax(мкмоль/мин) ÷ количество фермента(мкмоль); Vmax(мкМ/мин) ÷ [E](мкМ); или из концентрации белка(мг/мл) и молекулярной массы(кДа): [E](мкМ) = 1000×c÷MW (1 мг/мл белка 1 кДа = 1000 мкМ), затем kcat. Диапазоны (с⁻¹): <0,01 очень медленный, 0,01–1 медленный, 1–100 умеренный (типичные метаболические ферменты), 100–10⁴ быстрый, >10⁴ очень быстрый (каталаза ≈4×10⁷ с⁻¹). [E] считают по активным центрам (n-мер × n). Источники: Михаэлис-Ментен 1913, Fersht, Lehninger. Только для обучения.
Запуск
Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.
Примеры
Связано
Руководство по использованию инструмента
Калькулятор числа оборотов фермента вычисляет kcat по формуле Vmax ÷ [E]общ и показывает результат в мин⁻¹ и с⁻¹. Можно указать количество фермента, его концентрацию или концентрацию белка вместе с молекулярной массой.
Контекст
В насыщенном тесте получены Vmax 12 мкмоль/мин и 0,02 мкмоль активных центров фермента.
Проблема
Нужно определить число оборотов фермента в мин⁻¹ и с⁻¹.
Как использовать
Выберите режим «Vmax + количество фермента», введите Vmax 12 и количество фермента 0,02.
Vmax = 12 мкмоль/мин; количество фермента = 0,02 мкмоль.Результат
kcat = 600 мин⁻¹ = 10 с⁻¹. Результат относится к умеренному диапазону.
Контекст
Раствор содержит 1 мг/мл белка с молекулярной массой 50 кДа; Vmax составляет 40 мкМ/мин.
Проблема
Нужно получить концентрацию фермента и вычислить kcat без отдельного пересчёта молярности.
Как использовать
Выберите режим «Vmax + концентрация и MW белка», укажите Vmax 40, концентрацию белка 1 мг/мл и MW 50 кДа.
kcat — число оборотов фермента: количество молекул субстрата, превращаемых одним активным центром за секунду при условиях Vmax.
kcat = Vmax ÷ [E]общ. В зависимости от режима используются количество фермента или его концентрация.
Используйте формулу [E](мкМ) = 1000 × c(мг/мл) ÷ MW(кДа).
Концентрацию следует считать по активным центрам: для n-мера учитывают число активных субъединиц.
В с⁻¹: менее 0,01 — очень медленный, 0,01–1 — медленный, 1–100 — умеренный, 100–10⁴ — быстрый, свыше 10⁴ — очень быстрый.
Vmax = 40 мкМ/мин; концентрация белка = 1 мг/мл; MW = 50 кДа.Результат
[E] = 20 мкМ, kcat = 2 мин⁻¹ = 0,0333 с⁻¹. Это медленный диапазон.