Education
Вычисляет теоретическую изоэлектрическую точку по аминокислотному составу: суммарный заряд по Гендерсону–Хассельбалу для каждой ионизируемой группы (упрощённый набор pKa ExPASy/Bjellqvist: N-конец 7.5, K 10.0, R 12.0, H 5.98; C-конец 3.55, D 4.05, E 4.45, C 9.0, Y 10.0) и бисекция до нулевого заряда. Также даёт заряд при физиологическом pH 7.4, среднюю молекулярную массу (таблица ProtParam + вода) и классификацию кислый/основный. Ограничения: pKa развёрнутой цепи, без посттрансляционных модификаций; набор pKa и алгоритм бисекции идентичны Biopython IsoelectricPoint (результаты совпадают численно), тогда как полный набор Бьеллквиста в ExPASy различает концевые остатки и может немного отличаться. Источники: Bjellqvist 1993, Gasteiger 2003 (ExPASy), Biopython IsoelectricPoint. Только для обучения.
Вызовите этот инструмент из своего кода на трёх языках.
curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/ru/api/tools/protein-isoelectric-point' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"sequence":"GIVEQCCTSICSLYQLENYCN","decimalPlaces":2}'Отправьте POST-запрос с входными данными в JSON. Параметры типа «файл» требуют предварительной загрузки.
POST http://127.0.0.1:3003/ru/api/tools/protein-isoelectric-point| Имя | Тип | Обязательный | Описание |
|---|---|---|---|
| sequence | textarea | Да | One-letter amino-acid codes, 20 standard residues only (FASTA headers, whitespace, and '*' are stripped). |
| decimalPlaces | number | Нет | — |
JSON-результат
{
"key": {...},
"metadata": {
"key": "value"
},
"error": "Error message (optional)",
"message": "Notification message (optional)"
}Добавьте этот инструмент на свой сервер Model Context Protocol, чтобы ИИ-агенты могли перечислять и вызывать его.
Добавьте этот блок в конфигурацию вашего MCP-клиента:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-protein-isoelectric-point": {
"name": "protein-isoelectric-point",
"description": "Вычисляет теоретическую изоэлектрическую точку по аминокислотному составу: суммарный заряд по Гендерсону–Хассельбалу для каждой ионизируемой группы (упрощённый набор pKa ExPASy/Bjellqvist: N-конец 7.5, K 10.0, R 12.0, H 5.98; C-конец 3.55, D 4.05, E 4.45, C 9.0, Y 10.0) и бисекция до нулевого заряда. Также даёт заряд при физиологическом pH 7.4, среднюю молекулярную массу (таблица ProtParam + вода) и классификацию кислый/основный. Ограничения: pKa развёрнутой цепи, без посттрансляционных модификаций; набор pKa и алгоритм бисекции идентичны Biopython IsoelectricPoint (результаты совпадают численно), тогда как полный набор Бьеллквиста в ExPASy различает концевые остатки и может немного отличаться. Источники: Bjellqvist 1993, Gasteiger 2003 (ExPASy), Biopython IsoelectricPoint. Только для обучения.",
"baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=protein-isoelectric-point",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}После подключения к SSE-endpoint выведите список доступных инструментов:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Вызовите инструмент по его id; аргументы формируются из его параметров:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "protein-isoelectric-point",
"arguments": {
"sequence": "GIVEQCCTSICSLYQLENYCN",
"decimalPlaces": 2
}
}
}Вопросы или проблемы? Свяжитесь с [email protected]