Health

Калькулятор размера вспышки фага (одношаговый рост)

Вычисляет размер вспышки (burst size) по одношаговому эксперименту роста: вспышка = (свободные PFU/мл после лизиса − инокулированные PFU/мл) ÷ заражённые клетки, где заражённые клетки = плотность клеток × доля заражённых. Долю можно оценить по Пуассону P = 1 − e^(−MOI): MOI 1 ≈ 63%, MOI 2 ≈ 86%, MOI 3 ≈ 95%, MOI 5 ≈ 99%. Типичная интерпретация: <20 низкая, 20–100 обычная (λ ≈ 50–100), 100–300 высокая (Т4-подобные ≈ 100–200+), >300 проверьте данные.

json· JSON-результатОткрыть инструмент

Быстрый старт

Вызовите этот инструмент из своего кода на трёх языках.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/ru/api/tools/phage-burst-size' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"pfuAfterLysis":5010000000,"pfuInoculated":10000000,"cellDensity":100000000,"infectionPercent":50,"decimalPlaces":1}'

Справочник API

Отправьте POST-запрос с входными данными в JSON. Параметры типа «файл» требуют предварительной загрузки.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/ru/api/tools/phage-burst-size

Параметры

Имя	Тип	Обязательный	Описание
pfuAfterLysis	number	Да	Free phage in the lysate at the end of the one-step growth curve.
pfuInoculated	number	Да	Phage added at the start of infection (0 is acceptable when negligible).
cellDensity	number	Да	Host cell density when phage was added (e.g. mid-log ~1×10⁸ cells/mL).
infectionPercent	number	Да	Infected fraction in %. From MOI via Poisson: 1 ≈ 63%, 2 ≈ 86%, 3 ≈ 95%, 5 ≈ 99%.
decimalPlaces	number

Интеграция MCP

Добавьте этот инструмент на свой сервер Model Context Protocol, чтобы ИИ-агенты могли перечислять и вызывать его.

Конфигурация сервера

Добавьте этот блок в конфигурацию вашего MCP-клиента:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-phage-burst-size": {
      "name": "phage-burst-size",
      "description": "Вычисляет размер вспышки (burst size) по одношаговому эксперименту роста: вспышка = (свободные PFU/мл после лизиса − инокулированные PFU/мл) ÷ заражённые клетки, где заражённые клетки = плотность клеток × доля заражённых. Долю можно оценить по Пуассону P = 1 − e^(−MOI): MOI 1 ≈ 63%, MOI 2 ≈ 86%, MOI 3 ≈ 95%, MOI 5 ≈ 99%. Типичная интерпретация: <20 низкая, 20–100 обычная (λ ≈ 50–100), 100–300 высокая (Т4-подобные ≈ 100–200+), >300 проверьте данные.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=phage-burst-size",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Получить список инструментов

После подключения к SSE-endpoint выведите список доступных инструментов:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Вызвать этот инструмент

Вызовите инструмент по его id; аргументы формируются из его параметров:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "phage-burst-size",
    "arguments": {
  "pfuAfterLysis": 5010000000,
  "pfuInoculated": 10000000,
  "cellDensity": 100000000,
  "infectionPercent": 50,
  "decimalPlaces": 1
}
  }
}

Обзор инструментов Открыть инструмент