Education

Калькулятор циклов ПЦР и продукта (амплификация 2^n)

Вычисляет продукт ПЦР по идеальной экспоненциальной амплификации: после n циклов копий = матрица × (1 + эффективность)^n; при 100% — учебное удвоение 2^n (30 циклов ≈ 1.07×10⁹ раз); реальная ПЦР даёт 70–100%, и 25 циклов при 90% теряют ~100× продукта против идеала. С длиной ампликона пересчитывает в массу нг (660 Да на пару оснований, N_A = 6.022×10²³). Учтены поправки на реальность: реакция выходит на плато при ~10¹²–10¹³ молекулах продукта (инструмент помечает превышения), а более 35 циклов амплифицируют в основном неспецифику и димеры. Источники: Saiki 1988, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Только для планирования.

json· JSON-результатОткрыть инструмент

Быстрый старт

Вызовите этот инструмент из своего кода на трёх языках.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/ru/api/tools/pcr-cycle-number' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"templateCopies":1000,"cycles":30,"efficiencyPercent":100,"ampliconLengthBp":500,"decimalPlaces":2}'

Справочник API

Отправьте POST-запрос с входными данными в JSON. Параметры типа «файл» требуют предварительной загрузки.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/ru/api/tools/pcr-cycle-number

Параметры

Имя	Тип	Обязательный	Описание
templateCopies	number	Да	Starting number of target molecules (see the companion copy-number tool).
cycles	number	Да	Number of thermal cycles (most protocols: 25–35).
efficiencyPercent	number	Да	Per-cycle amplification efficiency; 100% = perfect doubling, real PCR typically 70–100%.
ampliconLengthBp	number	Нет	Amplicon length in base pairs for the ng-yield conversion; enter 0 to skip.
decimalPlaces	number

Интеграция MCP

Добавьте этот инструмент на свой сервер Model Context Protocol, чтобы ИИ-агенты могли перечислять и вызывать его.

Конфигурация сервера

Добавьте этот блок в конфигурацию вашего MCP-клиента:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-pcr-cycle-number": {
      "name": "pcr-cycle-number",
      "description": "Вычисляет продукт ПЦР по идеальной экспоненциальной амплификации: после n циклов копий = матрица × (1 + эффективность)^n; при 100% — учебное удвоение 2^n (30 циклов ≈ 1.07×10⁹ раз); реальная ПЦР даёт 70–100%, и 25 циклов при 90% теряют ~100× продукта против идеала. С длиной ампликона пересчитывает в массу нг (660 Да на пару оснований, N_A = 6.022×10²³). Учтены поправки на реальность: реакция выходит на плато при ~10¹²–10¹³ молекулах продукта (инструмент помечает превышения), а более 35 циклов амплифицируют в основном неспецифику и димеры. Источники: Saiki 1988, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Только для планирования.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=pcr-cycle-number",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Получить список инструментов

После подключения к SSE-endpoint выведите список доступных инструментов:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Вызвать этот инструмент

Вызовите инструмент по его id; аргументы формируются из его параметров:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "pcr-cycle-number",
    "arguments": {
  "templateCopies": 1000,
  "cycles": 30,
  "efficiencyPercent": 100,
  "ampliconLengthBp": 500,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

Обзор инструментов Открыть инструмент