Education
Симулятор эффекта бутылочного горлышка (потеря гетерозиготности)
Моделирует ожидаемую потерю гетерозиготности после бутылочного горлышка (детерминированное ожидание). При идеальном дрейфе Райта—Фишера H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) за поколение, откуда H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; эффективный размер по среднему гармоническому Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) определяется минимумом; накопленный F = 1 − H_final/H₀. Для аллеля частоты p выживание за ОДНО поколение горлышка = 1 − (1−p)^(2Nb); редкие аллели теряются первыми. Классика: северный морской слон (~20 особей в 1890-х), гепард, гавайская казарка, зубр, атолл Пингелап. Источники: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Только для обучения.
Быстрый старт
Вызовите этот инструмент из своего кода на трёх языках.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/bottleneck-effect-simulator' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"initialHeterozygosity":0.5,"bottleneckSize":20,"bottleneckGenerations":5,"recoverySize":2000,"recoveryGenerations":10,"alleleFrequency":0.1,"decimalPlaces":4}'Справочник API
Отправьте POST-запрос с входными данными в JSON. Параметры типа «файл» требуют предварительной загрузки.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/ru/api/tools/bottleneck-effect-simulatorПараметры
| Имя | Тип | Обязательный | Описание |
|---|---|---|---|
| initialHeterozygosity | number | Да | Heterozygosity before the bottleneck (0 < H₀ ≤ 1). |
| bottleneckSize | number | Да | Census size during the bottleneck (Nb). |
| bottleneckGenerations | number | Да | Number of generations spent at the bottleneck size (t). |
| recoverySize | number | Да | Census size after recovery (Nr). |
| recoveryGenerations | number |
Интеграция MCP
Добавьте этот инструмент на свой сервер Model Context Protocol, чтобы ИИ-агенты могли перечислять и вызывать его.
Конфигурация сервера
Добавьте этот блок в конфигурацию вашего MCP-клиента:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-bottleneck-effect-simulator": {
"name": "bottleneck-effect-simulator",
"description": "Моделирует ожидаемую потерю гетерозиготности после бутылочного горлышка (детерминированное ожидание). При идеальном дрейфе Райта—Фишера H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) за поколение, откуда H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; эффективный размер по среднему гармоническому Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) определяется минимумом; накопленный F = 1 − H_final/H₀. Для аллеля частоты p выживание за ОДНО поколение горлышка = 1 − (1−p)^(2Nb); редкие аллели теряются первыми. Классика: северный морской слон (~20 особей в 1890-х), гепард, гавайская казарка, зубр, атолл Пингелап. Источники: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Только для обучения.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=bottleneck-effect-simulator",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Получить список инструментов
После подключения к SSE-endpoint выведите список доступных инструментов:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Вызвать этот инструмент
Вызовите инструмент по его id; аргументы формируются из его параметров:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "bottleneck-effect-simulator",
"arguments": {
"initialHeterozygosity": 0.5,
"bottleneckSize": 20,
"bottleneckGenerations": 5,
"recoverySize": 2000,
"recoveryGenerations": 10,
"alleleFrequency": 0.1,
"decimalPlaces": 4
}
}
}