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Calculadora de frecuencia de recombinación y mapa genético (cM)

Convierte entre frecuencia de recombinación y distancia del mapa genético. r = recombinantes / descendencia total (r ≤ 0.5; tiende a 0.5 para genes lejanos o en cromosomas distintos). Tres funciones de mapeo (d en morgans, 1 M = 100 cM): lineal d = r (solo distancias cortas); Haldane 1919: d = −½ln(1−2r) (sin interferencia); Kosambi 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (interferencia positiva). Corrigen el subregistro de dobles recombinantes: para el mismo r, Haldane ≥ Kosambi ≥ lineal. El modo de intervalos suma distancias y predice r con las funciones inversas (el mapa total puede superar 50 cM mientras r satura al 50%). Fuentes: Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Solo uso educativo.

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Inicio rápido

Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/recombination-frequency-map' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"mode":"counts","recombinantCount":18,"totalProgeny":100,"intervalDistances":"","decimalPlaces":4}'

Referencia de la API

Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/recombination-frequency-map

Parámetros

Nombre	Tipo	Obligatorio	Descripción
mode	select	Sí	From recombination counts, or from a list of map intervals.
recombinantCount	number	Sí	Recombinant offspring in a testcross (counts mode).
totalProgeny	number	Sí	Total offspring scored (counts mode).
intervalDistances	text	No	Comma-separated adjacent interval distances in centimorgans (intervals mode).
decimalPlaces	number

Integración MCP

Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.

Configuración del servidor

Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-recombination-frequency-map": {
      "name": "recombination-frequency-map",
      "description": "Convierte entre frecuencia de recombinación y distancia del mapa genético. r = recombinantes / descendencia total (r ≤ 0.5; tiende a 0.5 para genes lejanos o en cromosomas distintos). Tres funciones de mapeo (d en morgans, 1 M = 100 cM): lineal d = r (solo distancias cortas); Haldane 1919: d = −½ln(1−2r) (sin interferencia); Kosambi 1944: d = ¼ln((1+2r)/(1−2r)) (interferencia positiva). Corrigen el subregistro de dobles recombinantes: para el mismo r, Haldane ≥ Kosambi ≥ lineal. El modo de intervalos suma distancias y predice r con las funciones inversas (el mapa total puede superar 50 cM mientras r satura al 50%). Fuentes: Sturtevant 1913, Haldane 1919, Kosambi 1944, Griffiths. Solo uso educativo.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=recombination-frequency-map",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar herramientas disponibles

Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Llamar a esta herramienta

Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "recombination-frequency-map",
    "arguments": {
  "mode": "counts",
  "recombinantCount": 18,
  "totalProgeny": 100,
  "intervalDistances": "",
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

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