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Calculadora de ciclos PCR y producto (amplificación 2^n)

Calcula el producto de una PCR con amplificación exponencial ideal: tras n ciclos, copias = molde × (1 + eficiencia)^n; con eficiencia del 100% es la duplicación 2^n de libro (30 ciclos ≈ 1.07×10⁹ veces); la PCR real rinde 70–100%, y 25 ciclos al 90% cuestan ~100× de producto frente al ideal. Con la longitud del amplicón se convierte a masa en ng (660 Da por par de bases, N_A = 6.022×10²³). Incluye correcciones de la realidad: la reacción entra en meseta hacia 10¹²–10¹³ moléculas de producto (la herramienta marca los resultados que la superan) y más de 35 ciclos amplifican sobre todo productos inespecíficos y dímeros. Fuentes: Saiki 1988, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Solo planificación.

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Inicio rápido

Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/pcr-cycle-number' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"templateCopies":1000,"cycles":30,"efficiencyPercent":100,"ampliconLengthBp":500,"decimalPlaces":2}'

Referencia de la API

Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.

Endpoint

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/es/api/tools/pcr-cycle-number

Parámetros

Nombre	Tipo	Obligatorio	Descripción
templateCopies	number	Sí	Starting number of target molecules (see the companion copy-number tool).
cycles	number	Sí	Number of thermal cycles (most protocols: 25–35).
efficiencyPercent	number	Sí	Per-cycle amplification efficiency; 100% = perfect doubling, real PCR typically 70–100%.
ampliconLengthBp	number	No	Amplicon length in base pairs for the ng-yield conversion; enter 0 to skip.
decimalPlaces

Integración MCP

Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.

Configuración del servidor

Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-pcr-cycle-number": {
      "name": "pcr-cycle-number",
      "description": "Calcula el producto de una PCR con amplificación exponencial ideal: tras n ciclos, copias = molde × (1 + eficiencia)^n; con eficiencia del 100% es la duplicación 2^n de libro (30 ciclos ≈ 1.07×10⁹ veces); la PCR real rinde 70–100%, y 25 ciclos al 90% cuestan ~100× de producto frente al ideal. Con la longitud del amplicón se convierte a masa en ng (660 Da por par de bases, N_A = 6.022×10²³). Incluye correcciones de la realidad: la reacción entra en meseta hacia 10¹²–10¹³ moléculas de producto (la herramienta marca los resultados que la superan) y más de 35 ciclos amplifican sobre todo productos inespecíficos y dímeros. Fuentes: Saiki 1988, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Solo planificación.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=pcr-cycle-number",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar herramientas disponibles

Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Llamar a esta herramienta

Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "pcr-cycle-number",
    "arguments": {
  "templateCopies": 1000,
  "cycles": 30,
  "efficiencyPercent": 100,
  "ampliconLengthBp": 500,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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