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Calculadora de densidad celular OD600 (E. coli)
Convierte lecturas de turbidez OD600 en concentración celular y peso seco (CDW): OD normalizada = lectura × factor de dilución ÷ camino óptico; células/mL = OD × células por OD (1×10⁹ por defecto, valor habitual de E. coli); CDW g/L = OD × g/L por OD (0.36 por defecto, BioNumbers 109837; rango 0.3–0.5). Ambos factores son editables — cepa, medio e instrumento los modifican; los valores por defecto son autoconsistentes: 0.36 g/L ÷ 10⁹ células/mL = 0.36 pg/célula. Marca lecturas OD > 1 fuera del rango lineal (Sigma-Aldrich). Fuentes: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Calibre con su propia curva OD-CFU. Solo para educación.
Inicio rápido
Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/es/api/tools/od600-cell-density' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"od600":0.5,"dilutionFactor":1,"pathLengthCm":1,"cellsPerOd":1000000000,"cdwPerOd":0.36,"cultureVolumeMl":25,"decimalPlaces":4}'Referencia de la API
Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/es/api/tools/od600-cell-densityParámetros
| Nombre | Tipo | Obligatorio | Descripción |
|---|---|---|---|
| od600 | number | Sí | Raw absorbance of the (diluted) sample at 600 nm, blanked against medium. |
| dilutionFactor | number | Sí | Sample-to-total dilution before measurement (1 = measured undiluted). |
| pathLengthCm | number | Sí | Cuvette path length (1 cm standard; readings are normalized to 1 cm). |
| cellsPerOd | number | Sí | Viable+total cells per mL at OD600 = 1 (E. coli default 1×10⁹; range 5×10⁸–1.2×10⁹). |
| cdwPerOd | number |
Integración MCP
Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.
Configuración del servidor
Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-od600-cell-density": {
"name": "od600-cell-density",
"description": "Convierte lecturas de turbidez OD600 en concentración celular y peso seco (CDW): OD normalizada = lectura × factor de dilución ÷ camino óptico; células/mL = OD × células por OD (1×10⁹ por defecto, valor habitual de E. coli); CDW g/L = OD × g/L por OD (0.36 por defecto, BioNumbers 109837; rango 0.3–0.5). Ambos factores son editables — cepa, medio e instrumento los modifican; los valores por defecto son autoconsistentes: 0.36 g/L ÷ 10⁹ células/mL = 0.36 pg/célula. Marca lecturas OD > 1 fuera del rango lineal (Sigma-Aldrich). Fuentes: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Calibre con su propia curva OD-CFU. Solo para educación.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=od600-cell-density",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Listar herramientas disponibles
Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Llamar a esta herramienta
Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "od600-cell-density",
"arguments": {
"od600": 0.5,
"dilutionFactor": 1,
"pathLengthCm": 1,
"cellsPerOd": 1000000000,
"cdwPerOd": 0.36,
"cultureVolumeMl": 25,
"decimalPlaces": 4
}
}
}