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Calculadora de densidad celular OD600 (E. coli)

Convierte lecturas de turbidez OD600 en concentración celular y peso seco (CDW): OD normalizada = lectura × factor de dilución ÷ camino óptico; células/mL = OD × células por OD (1×10⁹ por defecto, valor habitual de E. coli); CDW g/L = OD × g/L por OD (0.36 por defecto, BioNumbers 109837; rango 0.3–0.5). Ambos factores son editables — cepa, medio e instrumento los modifican; los valores por defecto son autoconsistentes: 0.36 g/L ÷ 10⁹ células/mL = 0.36 pg/célula. Marca lecturas OD > 1 fuera del rango lineal (Sigma-Aldrich). Fuentes: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Calibre con su propia curva OD-CFU. Solo para educación.

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Inicio rápido

Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.

cURL

curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/es/api/tools/od600-cell-density' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"od600":0.5,"dilutionFactor":1,"pathLengthCm":1,"cellsPerOd":1000000000,"cdwPerOd":0.36,"cultureVolumeMl":25,"decimalPlaces":4}'

Referencia de la API

Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.

Endpoint

HTTP

POST https://api.elysiatools.com/es/api/tools/od600-cell-density

Parámetros

Nombre	Tipo	Obligatorio	Descripción
od600	number	Sí	Raw absorbance of the (diluted) sample at 600 nm, blanked against medium.
dilutionFactor	number	Sí	Sample-to-total dilution before measurement (1 = measured undiluted).
pathLengthCm	number	Sí	Cuvette path length (1 cm standard; readings are normalized to 1 cm).
cellsPerOd	number	Sí	Viable+total cells per mL at OD600 = 1 (E. coli default 1×10⁹; range 5×10⁸–1.2×10⁹).
cdwPerOd	number

Integración MCP

Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.

Configuración del servidor

Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-od600-cell-density": {
      "name": "od600-cell-density",
      "description": "Convierte lecturas de turbidez OD600 en concentración celular y peso seco (CDW): OD normalizada = lectura × factor de dilución ÷ camino óptico; células/mL = OD × células por OD (1×10⁹ por defecto, valor habitual de E. coli); CDW g/L = OD × g/L por OD (0.36 por defecto, BioNumbers 109837; rango 0.3–0.5). Ambos factores son editables — cepa, medio e instrumento los modifican; los valores por defecto son autoconsistentes: 0.36 g/L ÷ 10⁹ células/mL = 0.36 pg/célula. Marca lecturas OD > 1 fuera del rango lineal (Sigma-Aldrich). Fuentes: BioNumbers 109835/109837, Agilent/VectorBuilder. Calibre con su propia curva OD-CFU. Solo para educación.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=od600-cell-density",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar herramientas disponibles

Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Llamar a esta herramienta

Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "od600-cell-density",
    "arguments": {
  "od600": 0.5,
  "dilutionFactor": 1,
  "pathLengthCm": 1,
  "cellsPerOd": 1000000000,
  "cdwPerOd": 0.36,
  "cultureVolumeMl": 25,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}

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