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Calculadora del número de recambio enzimático (kcat)

Calcula el número de recambio kcat = Vmax ÷ [E]total, en min⁻¹ y s⁻¹. Tres entradas: Vmax(µmol/min) ÷ cantidad de enzima(µmol); Vmax(µM/min) ÷ [E](µM); o desde concentración de proteína(mg/mL) y peso molecular(kDa), [E](µM) = 1000×c÷PM (1 mg/mL de una proteína de 1 kDa = 1000 µM) y luego kcat. Bandas (s⁻¹): <0,01 muy lenta, 0,01–1 lenta, 1–100 moderada (enzimas metabólicas típicas), 100–10⁴ rápida, >10⁴ muy rápida (catalasa ≈4×10⁷ s⁻¹). [E] debe contar centros activos (n-mero × n). Fuentes: Michaelis-Menten 1913, Fersht, Lehninger. Solo para educación.

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Inicio rápido

Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.

cURL
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/es/api/tools/enzyme-turnover-number' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"mode":"amount","vmaxUmolMin":12,"enzymeUmol":0.02,"vmaxUMLMin":40,"enzymeUM":2,"proteinMgPerMl":1,"molecularWeightKda":50,"decimalPlaces":4}'

Referencia de la API

Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.

Endpoint

HTTP
POST https://api.elysiatools.com/es/api/tools/enzyme-turnover-number

Parámetros

NombreTipoObligatorioDescripción
modeselectSíHow you know the enzyme: as an amount, a concentration, or protein concentration plus molecular weight.
vmaxUmolMinnumberSíMaximal velocity from a saturated assay (amount mode).
enzymeUmolnumberSíTotal enzyme (better: active-site) amount in the assay (amount mode).
vmaxUMLMinnumberSíMaximal velocity as a concentration rate (concentration and protein modes).
enzymeUMnumber

Integración MCP

Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.

Configuración del servidor

Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:

mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-enzyme-turnover-number": {
      "name": "enzyme-turnover-number",
      "description": "Calcula el número de recambio kcat = Vmax ÷ [E]total, en min⁻¹ y s⁻¹. Tres entradas: Vmax(µmol/min) ÷ cantidad de enzima(µmol); Vmax(µM/min) ÷ [E](µM); o desde concentración de proteína(mg/mL) y peso molecular(kDa), [E](µM) = 1000×c÷PM (1 mg/mL de una proteína de 1 kDa = 1000 µM) y luego kcat. Bandas (s⁻¹): <0,01 muy lenta, 0,01–1 lenta, 1–100 moderada (enzimas metabólicas típicas), 100–10⁴ rápida, >10⁴ muy rápida (catalasa ≈4×10⁷ s⁻¹). [E] debe contar centros activos (n-mero × n). Fuentes: Michaelis-Menten 1913, Fersht, Lehninger. Solo para educación.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=enzyme-turnover-number",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Listar herramientas disponibles

Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:

tools/list
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Llamar a esta herramienta

Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:

tools/call
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "enzyme-turnover-number",
    "arguments": {
  "mode": "amount",
  "vmaxUmolMin": 12,
  "enzymeUmol": 0.02,
  "vmaxUMLMin": 40,
  "enzymeUM": 2,
  "proteinMgPerMl": 1,
  "molecularWeightKda": 50,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}
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Sí
Enzyme (active-site) concentration (concentration mode).
proteinMgPerMlnumberSíProtein concentration of the enzyme stock (protein mode).
molecularWeightKdanumberSíMolecular weight of one active-site-bearing subunit (protein mode).
decimalPlacesnumberNo—

Formato de respuesta

Resultado JSON

JSON
{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}
Encadena varias herramientas en una sesión con una lista toolId separada por comas, p. ej. /mcp/sse?toolId=png-to-webp,jpg-to-webp,gif-to-webp (máx. 20).

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