Education
Simulador del efecto cuello de botella (pérdida de heterocigosidad)
Simula la pérdida esperada de heterocigosidad tras un cuello de botella (esperanza determinista). Bajo deriva Wright-Fisher ideal, H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) por generación, luego H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; el tamaño efectivo por media armónica Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) queda dominado por el mínimo; F acumulado = 1 − H_final/H₀. Para un alelo de frecuencia p, la supervivencia a UNA generación de cuello es 1 − (1−p)^(2Nb); los alelos raros se pierden primero. Casos clásicos: foca elefante del norte (~20 supervivientes en 1890), guepardo, nēnē Hawái, bisonte europeo, atolón Pingelap. Fuentes: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Solo uso educativo.
Inicio rápido
Llama a esta herramienta desde tu código en tres lenguajes.
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/es/api/tools/bottleneck-effect-simulator' \
-H 'Content-Type: application/json' \
-d '{"initialHeterozygosity":0.5,"bottleneckSize":20,"bottleneckGenerations":5,"recoverySize":2000,"recoveryGenerations":10,"alleleFrequency":0.1,"decimalPlaces":4}'Referencia de la API
Envía una petición POST con tus entradas en JSON. Los parámetros de tipo archivo requieren una subida previa.
Endpoint
POST https://api.elysiatools.com/es/api/tools/bottleneck-effect-simulatorParámetros
| Nombre | Tipo | Obligatorio | Descripción |
|---|---|---|---|
| initialHeterozygosity | number | Sí | Heterozygosity before the bottleneck (0 < H₀ ≤ 1). |
| bottleneckSize | number | Sí | Census size during the bottleneck (Nb). |
| bottleneckGenerations | number | Sí | Number of generations spent at the bottleneck size (t). |
| recoverySize | number | Sí | Census size after recovery (Nr). |
| recoveryGenerations | number |
Integración MCP
Añade esta herramienta a tu servidor Model Context Protocol para que los agentes de IA puedan listarla y llamarla.
Configuración del servidor
Añade este bloque a la configuración de tu cliente MCP:
{
"mcpServers": {
"elysiatools-bottleneck-effect-simulator": {
"name": "bottleneck-effect-simulator",
"description": "Simula la pérdida esperada de heterocigosidad tras un cuello de botella (esperanza determinista). Bajo deriva Wright-Fisher ideal, H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) por generación, luego H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; el tamaño efectivo por media armónica Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) queda dominado por el mínimo; F acumulado = 1 − H_final/H₀. Para un alelo de frecuencia p, la supervivencia a UNA generación de cuello es 1 − (1−p)^(2Nb); los alelos raros se pierden primero. Casos clásicos: foca elefante del norte (~20 supervivientes en 1890), guepardo, nēnē Hawái, bisonte europeo, atolón Pingelap. Fuentes: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Solo uso educativo.",
"baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=bottleneck-effect-simulator",
"command": "",
"args": [],
"env": {},
"isActive": true,
"type": "sse"
}
}
}Listar herramientas disponibles
Tras conectar al endpoint SSE, lista las herramientas expuestas:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 1,
"method": "tools/list"
}Llamar a esta herramienta
Invoca la herramienta por su id; los argumentos se construyen a partir de sus parámetros:
{
"jsonrpc": "2.0",
"id": 2,
"method": "tools/call",
"params": {
"name": "bottleneck-effect-simulator",
"arguments": {
"initialHeterozygosity": 0.5,
"bottleneckSize": 20,
"bottleneckGenerations": 5,
"recoverySize": 2000,
"recoveryGenerations": 10,
"alleleFrequency": 0.1,
"decimalPlaces": 4
}
}
}