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PCR-Zyklus- und Produktrechner (2^n-Amplifikation)

Berechnet das PCR-Produkt bei idealer exponentieller Amplifikation: nach n Zyklen Kopien = Matrize × (1 + Effizienz)^n; bei 100% das Lehrbuch-Doppel 2^n (30 Zyklen ≈ 1.07×10⁹-fach); real läuft PCR bei 70–100%, und 25 Zyklen bei 90% kosten ~100× Produkt gegenüber dem Ideal. Mit der Amplicon-Länge erfolgt die Umrechnung in Masse ng (660 Da pro Basenpaar, N_A = 6.022×10²³). Realitätskorrekturen inklusive: die Reaktion erreicht bei ~10¹²–10¹³ Produktmolekülen ein Plateau (das Tool markiert Überschreitungen), und über 35 Zyklen amplifizieren vor allem unspezifische Produkte und Primerdimere. Quellen: Saiki 1988, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Nur für die Planung.

json· JSON-ErgebnisWerkzeug öffnen

Schnellstart

Rufen Sie dieses Werkzeug aus Ihrem Code in drei Sprachen auf.

cURL

curl -X POST 'http://127.0.0.1:3003/de/api/tools/pcr-cycle-number' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"templateCopies":1000,"cycles":30,"efficiencyPercent":100,"ampliconLengthBp":500,"decimalPlaces":2}'

API-Referenz

Senden Sie eine POST-Anfrage mit Ihren Eingaben als JSON. Dateiparameter erfordern einen vorherigen Upload.

Endpunkt

HTTP

POST http://127.0.0.1:3003/de/api/tools/pcr-cycle-number

Parameter

Name	Typ	Erforderlich	Beschreibung
templateCopies	number	Ja	Starting number of target molecules (see the companion copy-number tool).
cycles	number	Ja	Number of thermal cycles (most protocols: 25–35).
efficiencyPercent	number	Ja	Per-cycle amplification efficiency; 100% = perfect doubling, real PCR typically 70–100%.
ampliconLengthBp	number	Nein	Amplicon length in base pairs for the ng-yield conversion; enter 0 to skip.
decimalPlaces	number

MCP-Integration

Fügen Sie dieses Werkzeug Ihrem Model-Context-Protocol-Server hinzu, damit KI-Agenten es auflisten und aufrufen können.

Serverkonfiguration

Fügen Sie diesen Block Ihrer MCP-Client-Konfiguration hinzu:

mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-pcr-cycle-number": {
      "name": "pcr-cycle-number",
      "description": "Berechnet das PCR-Produkt bei idealer exponentieller Amplifikation: nach n Zyklen Kopien = Matrize × (1 + Effizienz)^n; bei 100% das Lehrbuch-Doppel 2^n (30 Zyklen ≈ 1.07×10⁹-fach); real läuft PCR bei 70–100%, und 25 Zyklen bei 90% kosten ~100× Produkt gegenüber dem Ideal. Mit der Amplicon-Länge erfolgt die Umrechnung in Masse ng (660 Da pro Basenpaar, N_A = 6.022×10²³). Realitätskorrekturen inklusive: die Reaktion erreicht bei ~10¹²–10¹³ Produktmolekülen ein Plateau (das Tool markiert Überschreitungen), und über 35 Zyklen amplifizieren vor allem unspezifische Produkte und Primerdimere. Quellen: Saiki 1988, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Nur für die Planung.",
      "baseUrl": "http://127.0.0.1:3003/mcp/sse?toolId=pcr-cycle-number",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Verfügbare Werkzeuge auflisten

Nach dem Verbinden mit dem SSE-Endpunkt listen Sie die bereitgestellten Werkzeuge auf:

tools/list

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Dieses Werkzeug aufrufen

Rufen Sie das Werkzeug über seine ID auf; Argumente werden aus seiner Parameterliste gebildet:

tools/call

{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "pcr-cycle-number",
    "arguments": {
  "templateCopies": 1000,
  "cycles": 30,
  "efficiencyPercent": 100,
  "ampliconLengthBp": 500,
  "decimalPlaces": 2
}
  }
}

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