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Flaschenhals-Effekt-Simulator (Heterozygotieverlust)

Simuliert den erwarteten Heterozygotieverlust nach einem Flaschenhals (deterministische Erwartung). Bei idealem Wright-Fisher-Drift gilt pro Generation H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)), also H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; die harmonische effektive Größe Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) wird vom Minimum dominiert; kumuliertes F = 1 − H_final/H₀. Für ein Allel der Frequenz p beträgt das Überleben EINER Flaschenhals-Generation 1 − (1−p)^(2Nb); seltene Allele gehen zuerst verloren. Klassiker: See-Elefant (~20 Überlebende um 1890), Gepard, Hawaiigans, Wisent, Pingelap-Atoll. Quellen: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Nur für Bildungszwecke.

json· JSON-ErgebnisWerkzeug öffnen

Schnellstart

Rufen Sie dieses Werkzeug aus Ihrem Code in drei Sprachen auf.

cURL
curl -X POST 'https://api.elysiatools.com/de/api/tools/bottleneck-effect-simulator' \
  -H 'Content-Type: application/json' \
  -d '{"initialHeterozygosity":0.5,"bottleneckSize":20,"bottleneckGenerations":5,"recoverySize":2000,"recoveryGenerations":10,"alleleFrequency":0.1,"decimalPlaces":4}'

API-Referenz

Senden Sie eine POST-Anfrage mit Ihren Eingaben als JSON. Dateiparameter erfordern einen vorherigen Upload.

Endpunkt

HTTP
POST https://api.elysiatools.com/de/api/tools/bottleneck-effect-simulator

Parameter

NameTypErforderlichBeschreibung
initialHeterozygositynumberJaHeterozygosity before the bottleneck (0 < H₀ ≤ 1).
bottleneckSizenumberJaCensus size during the bottleneck (Nb).
bottleneckGenerationsnumberJaNumber of generations spent at the bottleneck size (t).
recoverySizenumberJaCensus size after recovery (Nr).
recoveryGenerationsnumber

MCP-Integration

Fügen Sie dieses Werkzeug Ihrem Model-Context-Protocol-Server hinzu, damit KI-Agenten es auflisten und aufrufen können.

Serverkonfiguration

Fügen Sie diesen Block Ihrer MCP-Client-Konfiguration hinzu:

mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "elysiatools-bottleneck-effect-simulator": {
      "name": "bottleneck-effect-simulator",
      "description": "Simuliert den erwarteten Heterozygotieverlust nach einem Flaschenhals (deterministische Erwartung). Bei idealem Wright-Fisher-Drift gilt pro Generation H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)), also H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; die harmonische effektive Größe Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) wird vom Minimum dominiert; kumuliertes F = 1 − H_final/H₀. Für ein Allel der Frequenz p beträgt das Überleben EINER Flaschenhals-Generation 1 − (1−p)^(2Nb); seltene Allele gehen zuerst verloren. Klassiker: See-Elefant (~20 Überlebende um 1890), Gepard, Hawaiigans, Wisent, Pingelap-Atoll. Quellen: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Nur für Bildungszwecke.",
      "baseUrl": "https://api.elysiatools.com/mcp/sse?toolId=bottleneck-effect-simulator",
      "command": "",
      "args": [],
      "env": {},
      "isActive": true,
      "type": "sse"
    }
  }
}

Verfügbare Werkzeuge auflisten

Nach dem Verbinden mit dem SSE-Endpunkt listen Sie die bereitgestellten Werkzeuge auf:

tools/list
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 1,
  "method": "tools/list"
}

Dieses Werkzeug aufrufen

Rufen Sie das Werkzeug über seine ID auf; Argumente werden aus seiner Parameterliste gebildet:

tools/call
{
  "jsonrpc": "2.0",
  "id": 2,
  "method": "tools/call",
  "params": {
    "name": "bottleneck-effect-simulator",
    "arguments": {
  "initialHeterozygosity": 0.5,
  "bottleneckSize": 20,
  "bottleneckGenerations": 5,
  "recoverySize": 2000,
  "recoveryGenerations": 10,
  "alleleFrequency": 0.1,
  "decimalPlaces": 4
}
  }
}
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Ja
Generations spent at the recovery size (g; 0 to skip).
alleleFrequencynumberJaFrequency p of a focal allele used for the one-generation bottleneck survival estimate.
decimalPlacesnumberNein—

Antwortformat

JSON-Ergebnis

JSON
{
  "key": {...},
  "metadata": {
    "key": "value"
  },
  "error": "Error message (optional)",
  "message": "Notification message (optional)"
}
Verketten Sie mehrere Werkzeuge in einer Sitzung mit einer kommagetrennten toolId-Liste, z. B. /mcp/sse?toolId=png-to-webp,jpg-to-webp,gif-to-webp (max. 20).

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