Двухточечный анализ сцепления по LOD-баллам: LOD(θ) = log10[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0.5^N], где r — число рекомбинантных мейозов, N — общее число информативных мейозов. Оценка максимального правдоподобия θ̂ = r/N; вычисляется максимальный LOD (Zmax) или LOD при фиксированном θ, плюс таблица кривой LOD для θ = 0.05–0.45. Классические пороги (Morton 1955): Z ≥ 3 — значимое сцепление (1000:1); Z ≤ −2 — значимое отсутствие сцепления; между ними — неопределённо. Источники: Morton 1955, Ott 1999, Griffiths, StatPearls. Только для обучения.
Запуск
Запустить этот инструмент
Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.
Примеры
Примеры для этого инструмента
Связано
Продолжить с похожими инструментами и темами
Результат
Готово к запуску
После запуска здесь появятся файлы, текст, структурированные данные или потоковый вывод.
Руководство по использованию инструмента
Узнайте, когда использовать этот инструмент, что он поддерживает и как его применяют пользователи.
Ключевые факты
Категория
Education
Типы ввода
select, number
Тип вывода
json
Покрытие примерами
4
API доступен
Да
Обзор
Калькулятор выполняет двухточечный анализ генетического сцепления по числу рекомбинантных и нерекомбинантных мейозов. Он вычисляет максимальный LOD-балл при θ̂ = r/N или LOD при заданной доле рекомбинации θ, формирует таблицу кривой LOD и интерпретирует результат по порогам Мортона.
Когда использовать
Для оценки свидетельств в пользу сцепления между двумя генетическими локусами.
Для проверки гипотезы о сцеплении при заданной доле рекомбинации θ.
Для учебных расчётов по генетическому картированию и интерпретации LOD-баллов.
Как это работает
1Выберите режим: максимальный LOD с оценкой θ̂ или расчёт LOD при фиксированном θ.
2Введите число рекомбинантных и нерекомбинантных мейозов.
3Для фиксированного режима задайте θ в диапазоне 0 < θ < 0,5 и выберите число знаков после запятой.
4Калькулятор возвращает LOD-балл, оценку θ при применимости, вывод по порогам Мортона и таблицу значений для θ от 0,05 до 0,45.
Сценарии использования
Расчёт Zmax и оценки доли рекомбинации по наблюдаемым мейозам.
Исключение сцепления на заданном генетическом расстоянии с помощью фиксированного θ.
Сравнение LOD-баллов при θ от 0,05 до 0,45 по таблице кривой.
Примеры
1. Значимое свидетельство генетического сцепления
Студент-генетик
Контекст
В учебной выборке зарегистрированы 2 рекомбинантные и 18 нерекомбинантных мейозов.
Проблема
Нужно оценить наиболее вероятную долю рекомбинации и определить, поддерживают ли данные сцепление.
Как использовать
Выбрать режим «Максимальный LOD», ввести 2 рекомбинанта, 18 нерекомбинантов и установить 4 знака после запятой.
Калькулятор получает θ̂ = 0,1 и Zmax ≈ 3,197. Поскольку результат не меньше 3, данные значимо поддерживают сцепление.
2. Проверка сцепления при θ = 0,1
Преподаватель генетики
Контекст
В наборе из 20 информативных мейозов наблюдаются 10 рекомбинантов и 10 нерекомбинантов.
Проблема
Нужно проверить гипотезу о сцеплении при доле рекомбинации 0,1.
Как использовать
Выбрать расчёт при фиксированном θ, ввести по 10 рекомбинантных и нерекомбинантных мейозов, задать θ = 0,1 и 4 знака после запятой.
FAQ
Что означает LOD-балл?
Это десятичный логарифм отношения правдоподобия сцепления при выбранном θ к правдоподобию свободной рекомбинации при θ = 0,5.
Как рассчитывается оценка θ̂?
В режиме максимального LOD используется оценка максимального правдоподобия θ̂ = r/N, где r — число рекомбинантов, а N — общее число информативных мейозов.
Как интерпретировать результат?
LOD ≥ 3 значимо поддерживает сцепление, LOD ≤ −2 свидетельствует против него при проверяемом θ, а промежуточный результат считается неопределённым.
Какой диапазон θ допустим в фиксированном режиме?
Нужно задать значение больше 0 и меньше 0,5.
Можно ли использовать результат для клинического решения?
Нет. Калькулятор предназначен только для обучения.