Calculateur de pureté OD260/230 (contamination sels/solvants) | Outil en ligne gratuit | Elysia Tools
Elysia Tools
Navigation mobile
Education
Calculateur de pureté OD260/230 (contamination sels/solvants)
Évalue la contamination par sels et solvants organiques via le ratio OD260/230 — le contrôle qui voit ce que le 260/280 ne voit pas : l'acide nucléique pur donne 2.0–2.2, et une valeur inférieure à 2.0 signale un entraînement de guanidinium (TRIzol/kits à colonne), de phénol, de glucides, d'EDTA, de sels concentrés ou de β-mercaptoéthanol ; 2.2–2.3 est généralement un effet de tampon acceptable ; au-dessus de 2.3, artefact d'eau/tampon probable — re-mesurer. Champ A280 optionnel pour le croisement OD260/280 (ADN ~1.8, ARN ~2.0) : une seule série de lectures couvre les deux dimensions de pureté. Sous ~0.05 de lecture le ratio n'est pas fiable. Sources : Thermo Fisher T042, Sambrook & Russell, Manchester 1995. Uniquement pour l'éducation.
Exécution
Exécuter cet outil
Remplissez le formulaire, lancez l’outil et consultez le résultat au même endroit.
Exemples
Exemples adaptés à cet outil
Associé
Continuer avec des outils et dossiers associés
Résultat
Prêt à exécuter
Après exécution, les fichiers, textes, données structurées ou sorties en flux apparaîtront ici.
Guide d'utilisation de l'outil
Découvrez quand utiliser cet outil, ce qu'il prend en charge et comment les utilisateurs l'appliquent.
Points clés
Catégorie
Education
Types d’entrée
select, number
Type de sortie
json
Exemples associés
4
API disponible
Oui
Aperçu
Ce calculateur de ratio OD260/230 évalue la pureté d’un échantillon d’ADN ou d’ARN à partir des absorbances à 260 et 230 nm. Il signale notamment un éventuel entraînement de guanidinium, de phénol, de sels, d’EDTA ou d’autres contaminants, avec un contrôle OD260/280 facultatif via l’absorbance à 280 nm.
Quand l’utiliser
Vérifier la présence de sels ou de solvants organiques après une extraction d’ADN ou d’ARN.
Compléter le ratio OD260/280 lorsque la pureté de l’échantillon doit être examinée sous plusieurs angles.
Évaluer rapidement un échantillon avant une étape expérimentale, comme une transfection ou une RT-qPCR.
Fonctionnement
1Sélectionnez le type d’acide nucléique : ADN ou ARN.
2Saisissez les absorbances A260 et A230 mesurées sur le même échantillon dilué.
3Ajoutez éventuellement A280 pour obtenir le ratio OD260/280 en complément.
4Le calculateur divise A260 par A230 et fournit une interprétation du résultat, avec le nombre de décimales choisi.
Cas d’usage
Contrôle de pureté d’ADN plasmidique après purification sur colonne.
Recherche de résidus de guanidinium ou de phénol dans un ARN extrait au TRIzol.
Vérification complémentaire d’échantillons destinés à des analyses de biologie moléculaire.
Exemples
1. Plasmide purifié sur colonne
Chercheuse en biologie moléculaire
Contexte
Un plasmide purifié présente des absorbances mesurées à 260, 230 et 280 nm.
Problème
Vérifier l’absence d’entraînement de sels et confirmer la pureté de l’ADN.
Utilisation
Sélectionner ADN, puis saisir A260 = 0,5, A230 = 0,25 et A280 = 0,278.
Décimales : 2
Résultat
Le ratio OD260/230 est de 2,00, compatible avec une absence de contamination saline ou organique indiquée. Le ratio OD260/280 est de 1,80, conforme à l’ADN pur.
2. ARN extrait au TRIzol
Technicien de laboratoire
Contexte
Un échantillon d’ARN mesuré après extraction au TRIzol donne A260 = 0,60, A230 = 1,20 et A280 = 0,36.
Problème
Déterminer si des résidus de guanidinium ou de phénol peuvent compromettre l’échantillon.
Utilisation
Sélectionner ARN et saisir les trois absorbances mesurées.
FAQ
Que signifie un ratio OD260/230 compris entre 2,0 et 2,2 ?
Cette plage est généralement compatible avec un acide nucléique pur, sans entraînement important de sels ou de solvants organiques.
Que signifie un ratio OD260/230 inférieur à 2,0 ?
Il peut indiquer un entraînement de guanidinium, de phénol, de sels, d’EDTA, de glucides ou de β-mercaptoéthanol.
Pourquoi saisir une absorbance à 280 nm ?
A280 est facultative et permet de calculer le ratio OD260/280 en complément du ratio OD260/230. Les valeurs attendues sont environ 1,8 pour l’ADN et 2,0 pour l’ARN pur.
Le type ADN ou ARN change-t-il le calcul OD260/230 ?
Non. Les attentes du ratio OD260/230 sont identiques ; le type sélectionné sert principalement à interpréter le contrôle OD260/280.
Le ratio est-il fiable pour de très faibles absorbances ?
Sous environ 0,05 de lecture, le ratio peut être peu fiable. Une nouvelle mesure est recommandée.
Le ratio OD260/230 est de 0,500, ce qui suggère un entraînement de guanidinium, de phénol ou de sels. Le ratio OD260/280 est de 1,667, également inférieur à la valeur attendue pour un ARN pur.