Оценивает чистоту препаратов нуклеиновых кислот по отношению OD260/280: основания максимально поглощают при 260 нм, а ароматические аминокислоты белка (и фенол) — около 280 нм, поэтому A260/A280 выявляет примеси белка/фенола. Ожидаемые значения: чистая ДНК ≈ 1.8 (окно 1.7–2.0), чистая РНК ≈ 2.0 (окно 1.8–2.2); ДНК < 1.7 или РНК < 1.8 — загрязнение белком/фенолом/гуанидином, ДНК > 2.0 — примесь РНК, РНК > 2.2 — артефакт измерения (низкая ионная сила). Опционально A230 для вторичного отношения A260/A230 (чистое 2.0–2.2; ниже — гуанидин/фенол/углеводы/соли). При показаниях < ~0.05 отношение недостоверно. Источники: Manchester 1995, Sambrook & Russell, Thermo Fisher T042. Только для обучения.
Запуск
Запустить этот инструмент
Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.
Примеры
Примеры для этого инструмента
Связано
Продолжить с похожими инструментами и темами
Результат
Готово к запуску
После запуска здесь появятся файлы, текст, структурированные данные или потоковый вывод.
Руководство по использованию инструмента
Узнайте, когда использовать этот инструмент, что он поддерживает и как его применяют пользователи.
Ключевые факты
Категория
Education
Типы ввода
select, number
Тип вывода
json
Покрытие примерами
4
API доступен
Да
Обзор
Калькулятор чистоты нуклеиновых кислот рассчитывает отношение A260/A280 для ДНК или РНК и интерпретирует его по ожидаемым диапазонам. При заполнении A230 дополнительно рассчитывается A260/A230 для оценки остатков гуанидина, фенола, солей и других примесей. Инструмент предназначен только для обучения.
Когда использовать
Проверить чистоту препарата ДНК или РНК после выделения.
Оценить возможную белковую, фенольную или солевую контаминацию по спектрофотометрическим показаниям.
Сопоставить результаты измерения с ожидаемыми диапазонами перед дальнейшей работой с образцом.
Как это работает
1Выберите тип нуклеиновой кислоты: ДНК или РНК.
2Введите значения оптической плотности A260 и A280 одного и того же разбавленного образца.
3При необходимости укажите A230 для расчёта дополнительного отношения A260/A230.
4Калькулятор делит A260 на A280, сравнивает результат с диапазоном для выбранного типа и показывает оценку чистоты с заданным числом знаков.
Сценарии использования
Контроль качества ДНК после выделения из клеток, тканей или плазмиды.
Проверка РНК после очистки, включая оценку образцов после процедур с фенолом или гуанидином.
Учебная интерпретация результатов NanoDrop или другого спектрофотометрического измерения.
Примеры
1. Чистый препарат плазмидной ДНК
Сотрудник лаборатории
Контекст
После выделения плазмиды получены значения A260 = 0,45 и A280 = 0,25.
Проблема
Нужно проверить, соответствует ли чистота препарата ожидаемому диапазону для ДНК.
Как использовать
Выберите «ДНК», введите A260 0,45 и A280 0,25, затем укажите A230 0,20 для дополнительной проверки.
A260/A280 = 1,6667 — ниже окна 1,8–2,2 для РНК и совместимо с белковой или фенольной контаминацией. A260/A230 = 0,6667 — значительно ниже ожидаемого диапазона, что указывает на перенос гуанидина, фенола или солей.