Оценивает загрязнение солями и органическими растворителями по отношению OD260/230 — проверка, дополняющая 260/280 тем, чего та не видит: чистая нуклеиновая кислота даёт 2.0–2.2, а значение ниже 2.0 указывает на остатки гуанидина (TRIzol/колоночные наборы), фенола, углеводов, EDTA, высоких солей или β-меркаптоэтанола; 2.2–2.3 обычно допустимый эффект буфера; выше 2.3 — артефакт воды/буфера, стоит перемерять. Опциональное A280 даёт перекрёстную проверку OD260/280 (ДНК ~1.8, РНК ~2.0): одна серия измерений закрывает оба измерения чистоты. При показаниях < ~0.05 отношение недостоверно. Источники: Thermo Fisher T042, Sambrook & Russell, Manchester 1995. Только для обучения.
Запуск
Запустить этот инструмент
Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.
Примеры
Примеры для этого инструмента
Связано
Продолжить с похожими инструментами и темами
Результат
Готово к запуску
После запуска здесь появятся файлы, текст, структурированные данные или потоковый вывод.
Руководство по использованию инструмента
Узнайте, когда использовать этот инструмент, что он поддерживает и как его применяют пользователи.
Ключевые факты
Категория
Education
Типы ввода
select, number
Тип вывода
json
Покрытие примерами
4
API доступен
Да
Обзор
Калькулятор рассчитывает отношение OD260/230 по значениям A260 и A230 и оценивает возможное загрязнение нуклеиновой кислоты солями, гуанидином, фенолом и другими органическими примесями. Необязательное значение A280 добавляет перекрёстную проверку OD260/280 для ДНК или РНК. Инструмент предназначен для обучения и планирования экспериментов.
Когда использовать
Чтобы проверить чистоту ДНК или РНК после выделения с помощью TRIzol или колоночного набора.
Чтобы выявить остатки солей, гуанидина, фенола, EDTA или β-меркаптоэтанола, которые не всегда заметны по OD260/280.
Чтобы дополнить оценку OD260/230 необязательной проверкой OD260/280 по одному набору измерений.
Как это работает
1Выберите тип нуклеиновой кислоты: ДНК или РНК.
2Введите A260 и A230, измеренные для одного и того же разведённого образца.
3При необходимости добавьте A280 для расчёта OD260/280; значение 0 позволяет пропустить эту проверку.
4Калькулятор делит A260 на A230, округляет результат до заданного числа знаков и показывает оценку чистоты.
Сценарии использования
Контроль очистки плазмидной ДНК после колоночного выделения.
Проверка РНК после выделения TRIzol перед RT-qPCR.
OD260/230 = 0,500 — ниже 2,0, поэтому подозревается перенос гуанидина, фенола или солей. OD260/280 = 1,667 также ниже ожидаемого диапазона для РНК; образец требует дополнительной оценки и очистки.