Quelle formule le calculateur utilise-t-il ?

Il calcule les copies finales avec matrice × (1 + efficacité)^n, où n est le nombre de cycles et l’efficacité est exprimée en fraction.

Que signifie une efficacité de 100 % ?

Chaque cycle double la quantité de produit, ce qui correspond à une amplification de 2^n.

Quels paramètres dois-je renseigner ?

Les copies de matrice, le nombre de cycles et l’efficacité sont obligatoires. La longueur de l’amplicon est optionnelle.

À quoi sert la longueur de l’amplicon ?

Elle permet d’estimer la masse du produit en ng à partir du nombre de molécules et d’une masse moyenne de 660 Da par paire de bases.

Le résultat représente-t-il le rendement réel d’une PCR ?

Non. Il s’agit d’une estimation pour la planification. La réaction réelle est limitée par les réactifs, atteint un plateau et peut produire des produits non spécifiques, notamment à nombre de cycles élevé.

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Calculateur de cycles PCR et de produit (amplification 2^n)

Calcule le produit d'une PCR en amplification exponentielle idéale : après n cycles, copies = matrice × (1 + efficacité)^n ; à 100% c'est le doublement 2^n des manuels (30 cycles ≈ 1.07×10⁹ fois) ; la PCR réelle tourne à 70–100%, et 25 cycles à 90% coûtent ~100× de produit par rapport à l'idéal. Avec la longueur de l'amplicon, convertit en masse ng (660 Da par paire de bases, N_A = 6.022×10²³). Corrections de réalité incluses : la réaktion atteint un plateau vers 10¹²–10¹³ molécules de produit (l'outil signale les dépassements) et au-delà de 35 cycles on amplifie surtout des produits non spécifiques et des dimères. Sources : Saiki 1988, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Uniquement pour la planification.

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Exemples

1. Amplification idéale de 1 000 matrices sur 30 cycles

2. Effet d’une efficacité de 90 % sur 25 cycles

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