Поддерживает ли инструмент альтернативные генетические коды?

Нет, трансляция выполняется строго по стандартному (универсальному) генетическому коду.

Как программа обрабатывает символы, отличные от A, C, G, T/U?

Все неспецифические символы автоматически удаляются из последовательности перед началом трансляции.

Что означает «лучшая рамка считывания» в результатах?

Это рамка считывания, в которой обнаружена самая длинная непрерывная открытая рамка считывания (ORF) от старт-кодона до стоп-кодона.

Можно ли транслировать обратную комплементарную цепь?

Да, вы можете выбрать трансляцию только обратной цепи или сразу обеих цепей (всего 6 рамок считывания).

Требуется ли подключение к внешним базам данных для работы транслятора?

Нет, все вычисления и сопоставления кодонов происходят локально в браузере на основе встроенной таблицы генетического кода.

Elysia Tools

Навигация

Science & Education

Транслятор кодонов в аминокислоты

Транслирует последовательность ДНК или мРНК в белок по стандартному генетическому коду. Сканирует все 6 рамок считывания (прямая и обратная комплементарная), помечает старт-кодоны (AUG) и стоп-кодоны, находит самые длинные ORF и показывает состав аминокислот с цветовой маркировкой по химическому классу. Поддерживает нормализацию T→U и трансляцию обратной цепи.

Детали

С чем помогает этот инструмент

Транслятор молекулярной биологии для студентов, абитуриентов медиков и новичков в синтетической биологии:

Ввод — вставьте последовательность ДНК или РНК (T и U допустимы; символы не-ACGT удаляются с уведомлением).
Цепь — прямая (3 рамки), обратная комплементарная (3 рамки) или обе (6 рамок).
Рамки — каждый кодон показан рядом с аминокислотой; AUG — старт (Метионин), UAA/UAG/UGA — стоп.
Поиск ORF — находятся ORF (AUG → стоп) каждой рамки; рамка с самым длинным ORF выделяется.
Состав — состав аминокислот лучшей рамки приводится по количеству и %, с цветом по химическому классу.

Использует стандартный (универсальный) генетический код. Без внешних вызовов, только таблица.

Запуск

Запустить этот инструмент

Заполните форму, запустите инструмент и посмотрите результат на этой же странице.

Подготовленные примеры запуска

Нажмите пример, чтобы автоматически заполнить форму. Файлы по-прежнему нужно загрузить.

2 примеров

Трансляция короткого ORF

мРНК 12 нт AUGGCCAUAUAA → M-A-I-* (старт Met, затем Ala, Ile, Stop) в 6 рамках.

<div class="cat-wrap">…best frame F1: AUG(M) GCC(A) AUA(I) UAA(Stop)…</div>

Длинный ген, поиск на обратной цепи

Последовательность, настоящий ORF которой на обратной цепи; инструмент отмечает обратную рамку как лучшую.

<div class="cat-wrap">…6 frames rendered, reverse frame flagged best, composition table…</div>

Ввод

Заполните нужные поля и запустите инструмент.

5 параметров

СодержимоеВставьте или введите основные значения.1

Входная последовательность (ДНК или РНК)textareaОбязательно

НастройкиНастройте форматы, диапазоны, числа и режимы.4

Транслируемая цепьselectНеобязательноОтображениеselectНеобязательноЧисло кодонов (лучший ORF)numberНеобязательно0 = show all codons. Long sequences are truncated for display.Знаки после запятойnumberОбязательно

Результат

Готово к запуску

После запуска здесь появятся файлы, текст, структурированные данные или потоковый вывод.

Примеры

Примеры для этого инструмента

Связано

Транслятор кодонов в аминокислоты

С чем помогает этот инструмент

Запустить этот инструмент

Подготовленные примеры запуска

Ввод

Результат

Примеры для этого инструмента

Продолжить с похожими инструментами и темами

Подготовленные примеры запуска

Ввод

Результат

Узнайте, когда использовать этот инструмент, что он поддерживает и как его применяют пользователи.

Ключевые факты

Обзор

Когда использовать

Как это работает

Сценарии использования

Примеры

1. Трансляция короткого фрагмента мРНК

2. Поиск ORF на обратной комплементарной цепи ДНК

FAQ

Примеры Обработки Изображений Web Python

Примеры Обработки Изображений Android Java

Примеры Обработки Изображений Android Kotlin

Примеры Обработки Изображений Web Rust

Переписчик пунктов резюме по STAR

Форматировщик CSS

Анализатор PDF с формулами и графиками

Извлечь по Координатам

Инструменты кодирования и конвертации аудио

Инструменты конвертации форматов изображений и анимированного экспорта

Инструменты JSON-обмена и перевода форматов

Инструменты перевода цветовых пространств для веба и печати