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Chemistry

Double Hélice d'ADN - DNA Double Helix

Visualisation 3D interactive de la structure en double hélice de l'ADN, appariement des bases, liaisons hydrogène, et dénaturation thermique

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Dossier

Dénombrement cellulaire, viabilité et suivi de croissance

Convertissez les comptages bruts des carrés d'une chambre de Neubauer en cellules par millilitre, calculez la viabilité au bleu de trypan avec les concentrations vivantes et mortes, convertissez la densité entre les dialectes qu'emploient réellement les protocoles et tirez le temps de doublement de deux comptages en phase exponentielle.

Dossier

Quantification par absorbance et calculs acido-basiques

Changez des lectures d'appareil en concentrations défendables — passez de l'absorbance à la transmittance et retour, résolvez la loi de Beer-Lambert pour la variable manquante, parcourez la chaîne des acides nucléiques de A260 aux microgrammes aux nanomolaires aux copies par microlitre, prédisez le pH depuis les concentrations d'acides et de bases fortes, concevez des tampons par Henderson-Hasselbalch et vérifiez la dissociation par la conductivité molaire.

Dossier

Nettoyage et livraison par lots d'une bibliothèque audio

Transformez un tas de fichiers audio mélangés en une bibliothèque livrable — repérez et jugez les doublons, convertissez tout le lot vers un seul format avec des réglages d'encodeur délibérés, fixez la politique de débit CBR ou VBR, réparez tags et noms de fichiers en masse, et corrigez la vitesse sans toucher à la hauteur.

Dossier

Nettoyage Déterministe des Listes de Texte et Ordre des Lignes

Transformez un texte collé ou exporté en liste reproductible en définissant les limites de ligne, en normalisant les espaces, en supprimant les doublons, en filtrant les entrées et en choisissant un ordre explicite.

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Education

Calculateur de concentration d'ADN (absorbance A260)

Détermine la concentration d'ADN par absorbance UV à 260 nm : concentration (µg/mL) = A260 × facteur de dilution × constante ÷ trajet optique (cm). Constantes : ADN double brin 1 OD = 50 µg/mL, ADN simple brin 1 OD = 33 µg/mL (ARN 40 — voir l'outil ARN). 1 µg/mL = 1 ng/µL ; indiquez le volume d'élution pour obtenir le rendement total en µg. Inclut la fenêtre linéaire 0.1–1.5 : en dessous de 0.1 le bruit domine, au-dessus de 1.5 le détecteur peut saturer. La pureté s'évalue par OD260/280. Sources : Marmur & Doty 1961/1962, Sambrook & Russell, Thermo Fisher NanoDrop. Uniquement pour l'éducation et la planification.

Education

Calculateur de concentration molaire d'ADN (µg/mL → nM)

Convertit la concentration massique d'ADN en concentration molaire : nM = µg/mL × 10⁶ ÷ (masse par paire de bases × bp). Masses moyennes selon NEB : ADN double brin 650 Da/bp, simple brin 330 Da/nt (Promega utilise 660). Piège classique : avec 10⁻³ au dénominateur on obtient des µM, pas des nM (facteur 1000). 1 µg/mL = 1 ng/µL ; avec le volume, l'outil donne les pmol totaux et les molécules par µL. Sources : NEB NEBioCalculator, Promega BioMath, N_A = 6.022×10²³. Uniquement pour l'éducation et la planification.

Education

Calculateur de nombre de copies d'ADN (concentration → copies)

Convertit une concentration massique d'ADN en copies moléculaires par microlitre : copies/µL = c(g/µL) × N_A ÷ (longueur pb × 660 g/mol). Accepte ng/µL (sortie NanoDrop habituelle, identique à µg/mL), pg/µL (gamme Qubit) et µg/µL ; fournit la conversion en pmol/µL et le total de copies dans un volume optionnel. Repère : un plasmide de 5 000 pb à 50 ng/µL → 9.12×10⁹ copies/µL (0.0152 pmol/µL). Rappels : 660 Da/pb est une moyenne suffisante pour plasmides/génome/amplicons (pour des oligos exacts, sommez les masses des bases) ; l'A260 surestime les échantillons contaminés par ARN/nucléotides libres — pour la précision, préférez un dosage fluorométrique. Sources : N_A SI 2019, convention Thermo Fisher, Sambrook & Russell. Uniquement pour la planification.

Education

Calculateur d'affinité protéine-ADN (estimation de Kd)

Estime le Kd à partir d'un point selon l'équilibre 1:1 : en excès de protéine, f = [P]÷([P]+Kd), donc Kd = [P]×(1−f)÷f ; à f = 0,5 le Kd égale la concentration en protéine. Deux entrées : fraction liée directe (0–1) ou anisotropie de fluorescence f = (r−rlibre)÷(rlié−rlibre). Ajoute ΔG° = RT·ln(Kd) (25 °C par défaut). Bandes : <1 nM très forte, 1–100 nM forte (cibles typiques de facteurs de transcription), 100 nM–1 µM modérée, >1 µM faible (vérifier sel et compétiteur poly(dI-dC)). Hypothèses : équilibre, 1:1, protéine en grand excès ; pour une courbe complète, ajuster toute la titration. Sources : Cantor & Schimmel, Heyduk & Lee 1990, Lakowicz. Uniquement pour l'éducation.

Chemistry

Réaction d'Ordre Zéro - Visualisation Interactive

Visualisation interactive de la cinétique de réaction d'ordre zéro et des changements de concentration au cours du temps

Chemistry

Réaction de Premier Ordre - Visualisation Interactive

Visualisation interactive de la cinétique de réaction de premier ordre et de la décroissance exponentielle de concentration

Chemistry

Réaction de Deuxième Ordre - Visualisation Interactive

Visualisation interactive de la cinétique de réaction de deuxième ordre et de la dynamique de collision bimoléculaire

Chemistry

Équation d'Arrhenius

Visualisation interactive de l'effet de la température sur la vitesse de réaction - Explorez l'énergie d'activation, le facteur pré-exponentiel et la relation avec la constante de vitesse

Chemistry

Réaction Réversible

Visualisation interactive de la cinétique de réaction réversible A ⇌ B - Explorez les taux de réaction directs et inverses, la constante d'équilibre et les changements de concentration

Chemistry

Réaction Consécutive

Visualisation interactive de la cinétique de réaction consécutive A → B → C - Explorez les pics de concentration intermédiaire et les étapes déterminantes

Chemistry

Réaction en Chaîne

Visualisation interactive de la polymérisation radicalaire en chaîne

Chemistry

Principe de Le Chatelier

Visualisation interactive du principe de Le Chatelier - Explorez comment les changements de concentration, pression et température affectent l'équilibre chimique