Calculateur d'efficacité de transfection (taux GFP+) | Outil en ligne gratuit | Elysia Tools
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Calculateur d'efficacité de transfection (taux GFP+)
Calcule l'efficacité de transfection via le taux GFP+ : efficacité = cellules GFP+ ÷ total × 100. Le mode mesure unique ajoute un intervalle de confiance Wilson à 95% (plus fiable que l'approximation normale pour petits effectifs) ; le mode réplicats prend des comptages parallèles séparés par virgules et renvoie l'efficacité par puits, la moyenne et l'écart-type d'échantillon (n−1). Bandes d'interprétation : ≥70% excellent (lignes faciles HEK293/CHO), 30–70% bon, 10–30% modéré, <10% faible (envisager électroporation ou vecteurs viraux). Hypothèses : même seuil GFP, cellules mortes exclues, lecture au pic 24–72 h. Sources : Wilson 1927, Newcombe 1998, Kim & Eberwine 2010. Uniquement pour l'éducation.
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Guide d'utilisation de l'outil
Découvrez quand utiliser cet outil, ce qu'il prend en charge et comment les utilisateurs l'appliquent.
Points clés
Catégorie
Education
Types d’entrée
select, number, text
Type de sortie
json
Exemples associés
4
API disponible
Oui
Aperçu
Ce calculateur estime l’efficacité de transfection à partir du nombre de cellules GFP positives et du nombre total de cellules viables. Le mode mesure unique fournit aussi un intervalle de confiance de Wilson à 95 %, tandis que le mode réplicats calcule l’efficacité de chaque puits ou champ, la moyenne et l’écart-type.
Quand l’utiliser
Calculer rapidement le pourcentage de cellules GFP positives après une transfection.
Quantifier et comparer plusieurs puits ou champs de microscopie répliqués.
Interpréter un résultat de transfection avec des repères de 10 %, 30 % et 70 %.
Fonctionnement
1Sélectionnez le mode « Mesure unique » ou « Puits ou champs répliqués ».
2En mesure unique, saisissez le total de cellules viables et le nombre de cellules GFP positives.
3En mode réplicats, indiquez les totaux et les comptages GFP positifs dans le même ordre, séparés par des virgules.
4L’outil renvoie les pourcentages, avec l’intervalle de Wilson à 95 % en mesure unique ou la moyenne et l’écart-type d’échantillon en mode réplicats.
Cas d’usage
Évaluer une transfection de plasmide GFP par cytométrie en flux.
Comparer plusieurs champs de microscopie en fluorescence dans un même essai.
Suivre l’optimisation d’une transfection de cellules de mammifère à partir de comptages viables.
Exemples
1. Mesure unique en cytométrie : 150 cellules GFP positives sur 500
Chercheur en biologie cellulaire
Contexte
Une analyse par cytométrie compte 500 cellules viables après une transfection avec un rapporteur GFP.
Problème
Obtenir l’efficacité de transfection et une estimation de l’incertitude associée.
Utilisation
Sélectionnez « Mesure unique », saisissez 500 dans « Total de cellules comptées » et 150 dans « Cellules GFP positives », puis choisissez 2 décimales.
Résultat
L’efficacité est de 30 %, avec un intervalle de confiance de Wilson à 95 % d’environ 26,15 à 34,16 %. Le résultat est classé comme bon.
2. Trois champs de microscopie : moyenne de 27,04 %
Technicienne de laboratoire
Contexte
Trois champs de fluorescence contiennent respectivement 120/480, 155/510 et 130/505 cellules GFP positives sur cellules comptées.
Problème
Comparer les champs et résumer la variabilité du comptage.
Utilisation
Sélectionnez « Puits ou champs répliqués », saisissez « 480, 510, 505 » pour les totaux et « 120, 155, 130 » pour les cellules GFP positives.
FAQ
Quelle est la formule utilisée ?
L’efficacité est calculée ainsi : cellules GFP positives ÷ total de cellules × 100.
Que fournit le mode mesure unique ?
Il fournit l’efficacité en pourcentage et un intervalle de confiance de Wilson à 95 %.
Comment saisir les réplicats ?
Saisissez les totaux et les cellules GFP positives comme deux listes séparées par des virgules, avec le même nombre de valeurs et le même ordre.
Comment interpréter le pourcentage obtenu ?
Un résultat d’au moins 70 % est excellent, de 30 à 70 % bon, de 10 à 30 % modéré et inférieur à 10 % faible.
Quelles précautions prendre pour le comptage ?
Utilisez le même seuil GFP, excluez les cellules mortes et privilégiez une lecture au pic d’expression de 24 à 72 heures.