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Chemistry

DNA-Doppelhelix - DNA Double Helix

Interaktive 3D-Visualisierung der DNA-Doppelhelixstruktur, Basenpaarung, Wasserstoffbrücken und thermischer Denaturierung

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Vergleichen Sie eine Seite vor und nach dem Redesign bei gleichen Viewports, prüfen Sie Layout- und Farbänderungen und übergeben Sie begründete Freigaben mit nachvollziehbaren Bildnachweisen.

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Erstellen Sie wiederholbare Mock-Payloads, erzeugen Sie formatgerechte Grenzwerte, finden Sie verwirrende Feldnamen und prüfen Sie einen temporären Mock-Server vor der Weitergabe.

Extinktions-Quantifizierung und Säure-Base-Berechnungen

Verwandeln Sie Instrumentenablesungen in verteidigungsfähige Konzentrationen — wechseln Sie zwischen Absorbanz und Transmission, lösen Sie das Beer-Lambert-Gesetz nach der fehlenden Variablen, gehen Sie die Nukleinsäure-Kette von A260 zu Mikrogramm zu Nanomolar zu Kopien pro Mikroliter, sagen Sie den pH aus starken Säuren und Basen voraus, entwerfen Sie Puffer mit Henderson-Hasselbalch und prüfen Sie die Dissoziation über die molare Leitfähigkeit.

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Education

DNA-Konzentrationsrechner (A260-Absorption)

Bestimmt die DNA-Konzentration über die UV-Absorption bei 260 nm: Konzentration (µg/mL) = A260 × Verdünnungsfaktor × Konstante ÷ Schichtdicke (cm). Konstanten: doppelsträngige DNA 1 OD = 50 µg/mL, einzelsträngige DNA 1 OD = 33 µg/mL (RNA 40 — siehe RNA-Tool). 1 µg/mL = 1 ng/µL; mit Elutionsvolumen ergibt sich die Gesamtausbeute in µg. Enthält das lineare Fenster 0.1–1.5: unter 0.1 dominiert Rauschen, über 1.5 kann der Detektor sättigen. Reinheit über OD260/280 beurteilen. Quellen: Marmur & Doty 1961/1962, Sambrook & Russell, Thermo Fisher NanoDrop. Nur für Ausbildung und Versuchsplanung.

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DNA-Molkonzentrationsrechner (µg/mL → nM)

Rechnet die Massenkonzentration von DNA in die molare Konzentration um: nM = µg/mL × 10⁶ ÷ (Masse pro Basenpaar × bp). Durchschnittsmassen nach NEB: doppelsträngige DNA 650 Da/bp, einzelsträngige 330 Da/nt (Promega nutzt 660). Klassische Falle: Mit 10⁻³ im Nenner ergibt sich µM, nicht nM (Faktor 1000). 1 µg/mL = 1 ng/µL; mit Volumen folgen Gesamt-pmol und Moleküle pro µL. Quellen: NEB NEBioCalculator, Promega BioMath, N_A = 6.022×10²³. Nur für Ausbildung und Versuchsplanung.

Education

DNA-Kopienzahl-Rechner (Konzentration → Kopien)

Rechnet eine DNA-Massenkonzentration in Molekülkopien pro Mikroliter um: Kopien/µL = c(g/µL) × N_A ÷ (Länge bp × 660 g/mol). Unterstützt ng/µL (übliche NanoDrop-Ausgabe, identisch mit µg/mL), pg/µL (Qubit-Bereich) und µg/µL; inklusive pmol/µL-Umrechnung und Gesamt Kopien in einem optionalen Volumen. Richtwert: ein 5.000-bp-Plasmid bei 50 ng/µL → 9.12×10⁹ Kopien/µL (0.0152 pmol/µL). Hinweise: 660 Da/bp ist ein Durchschnitt, der für Plasmide/Genom/Amplicons genügt (bei exakten Oligos Basenmassen summieren); A260 überschätzt bei RNA/freien Nukleotiden — für Genauigkeit Fluoreszenz-Assay nutzen. Quellen: N_A SI 2019, Thermo-Fisher-Konvention, Sambrook & Russell. Nur für die Planung.

Education

Protein-DNA-Bindungsaffinitätsrechner (Kd-Schätzung)

Schätzt das Kd aus einem Messpunkt gemäß 1:1-Gleichgewicht: bei Proteinüberschuss gilt f = [P]÷([P]+Kd), also Kd = [P]×(1−f)÷f; bei f = 0,5 entspricht das Kd der Proteinkonzentration. Zwei Eingaben: gebundener Anteil direkt (0–1) oder Fluoreszenzanisotropie f = (r−rfrei)÷(rgeb.−rfrei). Ergänzt ΔG° = RT·ln(Kd) (standardmäßig 25 °C). Bereiche: <1 nM sehr fest, 1–100 nM fest (typische Ziele von Transkriptionsfaktoren), 100 nM–1 µM mäßig, >1 µM schwach (Salz und poly(dI-dC)-Wettbewerber prüfen). Annahmen: Gleichgewicht, 1:1, Protein im großen Überschuss; für vollständige Kurven die gesamte Titration fitten. Quellen: Cantor & Schimmel, Heyduk & Lee 1990, Lakowicz. Nur für Ausbildung.

Null-Ordnungs-Reaktion - Interaktive Visualisierung

Interaktive Visualisierung der Kinetik von Null-Ordnungs-Reaktionen und Konzentrationsänderungen über Zeit

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Kettenreaktion

Interaktive Visualisierung der radikalischen Kettenpolymerisation

Prinzip von Le Chatelier

Interaktive Visualisierung des Prinzips von Le Chatelier - Erforschen Sie, wie Konzentrations-, Druck- und Temperaturänderungen das chemische Gleichgewicht beeinflussen