# Калькулятор длины рестрикционных фрагментов

Оценивает размеры фрагментов после рестрикции: кольцевой субстрат с n разрезами даёт n фрагментов (с заходом через начало координат), линейный — n+1. Режим позиций вычисляет точные фрагменты по координатам через запятую; режим числа сайтов даёт количество и средний размер при равномерном распределении. Плюс ожидаемая частота сайтов в случайной ДНК: 4-буквенные сайты ~1 на 256 п.н., 6-буквенные ~1 на 4096 п.н. (REBASE/Sambrook) и советы по разрешению агарозы (<50 п.н. может уйти). Источники: Sambrook & Russell 3-е изд., REBASE. Только для обучения.

> Каноническая страница: https://elysiatools.com/ru/tools/restriction-fragment-length

- **Категория:** Education

- **Ключевые слова:** длина рестрикционных фрагментов, калькулятор рестрикции, двойная рестрикция плазмиды, карта рестрикции фрагменты, фрагменты днк п.н., расщепление кольцевой плазмиды, фрагменты линейной днк, 4-буквенный сайт 256 п.н., 6-буквенный сайт 4096 п.н., размер фрагментов агароза, молекулярная биология, лабораторный калькулятор

## Обзор

Калькулятор длины рестрикционных фрагментов оценивает размеры ДНК после рестрикции по длине субстрата, топологии и позициям или числу сайтов разреза. Для кольцевой ДНК он учитывает фрагмент через начало координат, а для линейной — два концевых фрагмента.

## Входные данные

- **Топология субстрата** (select): Circular plasmids give n fragments from n cuts; linear DNA gives n+1.
- **Режим ввода** (select): Enter exact cut positions, or just the number of cut sites for an average estimate.
- **Длина субстрата (п.н.)** (number): Total length of the substrate (plasmid or linear DNA) in base pairs.
- **Позиции разрезов (п.н., через запятую)** (text): Cut coordinates counted from base 1 (positions mode); each must be strictly inside the substrate and unique.
- **Число сайтов рестрикции** (number): Number of cut sites (count mode); fragments = n circular or n+1 linear.
- **Знаков после запятой** (number)

## Когда использовать

- Чтобы точно рассчитать фрагменты кольцевой плазмиды по координатам сайтов рестрикции.
- Чтобы определить число и размеры фрагментов линейной ДНК после заданного числа разрезов.
- Чтобы получить среднюю длину фрагмента при равномерном распределении сайтов и оценить ожидаемую картину на агарозном геле.

## Как это работает

- Выберите топологию субстрата: кольцевая плазмида или линейная ДНК.
- Укажите длину субстрата в п.н. и выберите режим ввода: точные позиции или число сайтов.
- В режиме позиций введите уникальные координаты разрезов через запятую; калькулятор вычислит каждый интервал.
- Результат содержит список фрагментов, их количество, среднюю, минимальную, максимальную и общую длину.

## Сценарии использования

- Проверка карты рестрикции плазмиды перед двойной рестрикцией.
- Планирование анализа линейного ПЦР-продукта по ожидаемым размерам фрагментов.
- Учебная оценка частоты сайтов: примерно 1 сайт на 256 п.н. для 4-буквенного и на 4096 п.н. для 6-буквенного распознавателя.

## Частые вопросы

### Сколько фрагментов дают разрезы кольцевой ДНК?

Кольцевой субстрат с n разрезами даёт n фрагментов, включая фрагмент через начало координат.

### Сколько фрагментов образуется у линейной ДНК?

Линейная ДНК с n разрезами даёт n+1 фрагмент.

### Как вводить позиции разрезов?

Введите координаты от 1 до длины субстрата через запятую, например 1000, 2000.

### Что показывает режим числа сайтов?

Он рассчитывает количество фрагментов и их средний размер при равномерном распределении сайтов.

### Можно ли заранее оценить видимость фрагментов на агарозе?

Да, калькулятор даёт ориентиры по разрешению: фрагменты короче 50 п.н. могут потеряться.

## Связанные инструменты

- [Анализатор аминокислотного состава](https://elysiatools.com/ru/tools/amino-acid-composition): Анализирует состав последовательности: подсчёт и мольные проценты каждой из 20 стандартных аминокислот; суммы по группам (основные K/R/H, кислые D/E, ароматические F/W/Y, серосодержащие C/M, алифатические A/I/L/V, амидные N/Q, гидроксильные S/T, прочие G/P); GRAVY по значениям гидропатии Kyte–Doolittle 1982 (>0 гидрофобный сдвиг, <0 гидрофильный; растворимые глобулярные белки обычно между −1 и +0,3); плюс молекулярная масса по таблице средних масс ProtParam. Коды неоднозначности (B/J/O/U/X/Z) считаются отдельно и исключаются из процентов. Источники: Kyte & Doolittle 1982, ExPASy ProtParam, Lehninger. Только для обучения.
- [Симулятор эффекта бутылочного горлышка (потеря гетерозиготности)](https://elysiatools.com/ru/tools/bottleneck-effect-simulator): Моделирует ожидаемую потерю гетерозиготности после бутылочного горлышка (детерминированное ожидание). При идеальном дрейфе Райта—Фишера H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) за поколение, откуда H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; эффективный размер по среднему гармоническому Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) определяется минимумом; накопленный F = 1 − H_final/H₀. Для аллеля частоты p выживание за ОДНО поколение горлышка = 1 − (1−p)^(2Nb); редкие аллели теряются первыми. Классика: северный морской слон (~20 особей в 1890-х), гепард, гавайская казарка, зубр, атолл Пингелап. Источники: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Только для обучения.
- [Обработчик Границ Данных](https://elysiatools.com/ru/tools/data-boundary-processor): Продвинутый инструмент обработки границ, который определяет и обрабатывает минимальные и максимальные значения в числовых данных. Идеально подходит для валидации данных, проверки диапазонов, статистического анализа и предварительной обработки данных.
- [Калькулятор молекулярной массы белка (по последовательности)](https://elysiatools.com/ru/tools/protein-molecular-weight): Вычисляет молекулярную массу белка по последовательности: MW = Σ средних масс остатков + H₂O (18,01524 Да), по той же таблице, что ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). Ввод нечувствителен к регистру, пробелы и разделители * - . отбрасываются; коды неоднозначности (B/J/O/U/X/Z) не суммируются, но подсчитываются и отмечаются. Результат — немодифицированная полипептидная цепь: без удаления сигнального пептида, дисульфидных мостиков (−2H на мостик), ПТМ и меток. Возвращает кДа, среднюю массу остатка и длину. Источники: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), справочник Fasman. Только для обучения.
- [Калькулятор эффективности трансфекции (доля GFP+)](https://elysiatools.com/ru/tools/transfection-efficiency): Считает эффективность трансфекции по доле GFP+: эффективность = GFP+ клетки ÷ всего × 100. Режим одиночного измерения добавляет 95% доверительный интервал Вильсона (надёжнее нормальной аппроксимации при малых выборках); режим повторов принимает параллельные списки через запятую и выдаёт эффективность по лункам, среднее и выборочное стандартное отклонение (n−1). Шкалы: ≥70% отлично (легко трансфицируемые линии HEK293/CHO), 30–70% хорошо, 10–30% умеренно, <10% низко (рассмотреть электрофорез или вирусные системы). Допущения: один порог GFP, мёртвые клетки исключены, пик экспрессии 24–72 ч. Источники: Wilson 1927, Newcombe 1998, Kim & Eberwine 2010. Только для обучения.
- [Тутор по конечным автоматам, Mealy/Moore, картам Карно и минимизации](https://elysiatools.com/ru/tools/finite-state-machine-mealy-moore-karnaugh-minimization-tutor): Пошаговый разбор автоматов и комбинационной логики: построение подмножеств ε-NFA→NFA→DFA, минимизация разбиениями Мура, преобразование Mealy↔Moore; группы Грея в карте Карно и метод Куайна-МакКласки с простыми импликантами и точным минимальным покрытием для минимальной ДНФ. С ASCII-диаграммами, таблицами и итерациями.
- [Генератор SRS-колоды из частотного списка](https://elysiatools.com/ru/tools/language-vocab-spaced-repetition-deck-generator): Вставьте двуязычный словарный список и экспортируйте совместимую с Anki колоду, автоматически разбивая каждую запись на карточки распознавания, припоминания и cloze с частью речи, IPA и примерами, плюс предпросмотр SM-2.
- [Конвертер угловой скорости (rad/s / rpm / deg/s / Hz)](https://elysiatools.com/ru/tools/angular-velocity-converter): Пересчёт угловой скорости: рад/с (база СИ) ↔ об/мин (1=2π/60 рад/с) ↔ град/с (1=π/180 рад/с) ↔ Гц (1 оборот/с=2π рад/с). Гц здесь = оборот в секунду. Пересчёт через рад/с с четырьмя эквивалентами. Эталон: винил 33⅓ об/мин≈3,49 рад/с, холостой ход ~800 об/мин≈83,8 рад/с.

## Примеры

- [Примеры Обработки Изображений Web Python](https://elysiatools.com/ru/samples/web-image-processing-python): Примеры обработки изображений Web Python используя PIL/Pillow включая чтение, сохранение, изменение размера и преобразование формата
- [Примеры Длины и Расстояния](https://elysiatools.com/ru/samples/length-distance): Обучающие примеры по метрическим и имперским единицам длины, ощущению расстояния и распространенным переводам
- [Примеры Единиц Длины](https://elysiatools.com/ru/samples/length-unit): Практические справочные данные, которые можно копировать, когда вы хотите сравнить разные единицы длины напрямую с метрами (m)
- [Примеры Обработки Изображений Android Java](https://elysiatools.com/ru/samples/android-image-processing-java): Примеры обработки изображений Android Java включая чтение/сохранение, масштабирование и преобразование формата

## Связанные материалы

- [Инструменты для штрихкодов, QR-кодов и этикеток](https://elysiatools.com/ru/hubs/barcode-utility): Соберите в одном хабе инструменты для генерации штрихкодов, создания и декодирования QR-кодов, проверки UPC/EAN, WiFi QR и печатных этикеток.
- [Инструменты кодирования и конвертации аудио](https://elysiatools.com/ru/hubs/audio-convert): Сравните инструменты конвертации аудиоформатов, изменения битрейта, частоты дискретизации, смены кодека и экспорта в одном хабе.
- [Инструменты конвертации форматов изображений и анимированного экспорта](https://elysiatools.com/ru/hubs/image-convert): Сравните конвертеры JPG, PNG, GIF, AVIF, WebP, TIFF, ICO, base64 и инструменты экспорта анимированных изображений в одном хабе.
- [Инструменты JSON-обмена и перевода форматов](https://elysiatools.com/ru/hubs/json-convert): Сравните инструменты преобразования JSON для CSV, YAML, TOML, GraphQL, XML, Markdown, Excel, BSON, EDN и других структурированных форматов в одном хабе.