# Калькулятор Tm праймера ПЦР (Уоллес / ближайшие соседи)

Вычисляет температуру плавления (Tm) ПЦР-праймера двумя методами, с выдачей обоих: правило Уоллеса Tm = 2°C×(A+T) + 4°C×(G+C) (быстрая оценка для коротких олигов <14 нт, без учёта контекста, концентрации и соли) и унифицированный термодинамический метод ближайших соседей SantaLucia 1998: Tm = 1000ΔH/(ΔS + R·ln(Ct/4) + 0.368(N−1)·ln[Na+]) − 273.15 — с 16 параметрами стэкинга, терминальными членами инициации и поправкой на симметрию самокомплементарных последовательностей; задаётся концентрация праймера и натрия (семейство методов Primer3). Также выводятся GC-состав, состав оснований и рекомендуемая Ta = Tm − 5°C. Источники: Wallace 1979, SantaLucia 1998, Breslauer 1986, Primer3 2012. Только для первичного скрининга.

> Каноническая страница: https://elysiatools.com/ru/tools/pcr-primer-tm

- **Категория:** Education

- **Ключевые слова:** калькулятор tm праймера, температура плавления, правило уоллеса, tm ближайших соседей, термодинамика санталуции, дизайн праймеров, gc-состав, температура отжига, пцр праймер, tm олигонуклеотида, primer3, пцр

## Обзор

Калькулятор Tm праймера ПЦР оценивает температуру плавления последовательности длиной 5–60 нт по правилу Уоллеса и методу ближайших соседей SantaLucia 1998. Результат включает оба значения Tm, GC-состав, длину праймера и рекомендуемую стартовую температуру отжига Ta = Tm − 5°C.

## Входные данные

- **Последовательность праймера (5'→3')** (text): DNA primer sequence, A/C/G/T only (case-insensitive); 5–60 nt.
- **Метод расчёта Tm** (select): Wallace for a quick short-oligo estimate; nearest-neighbor is the standard for primer design.
- **Концентрация праймера (нМ)** (number): Primer strand concentration (nearest-neighbor method only).
- **Концентрация натрия (мМ)** (number): \[Na+\] of the reaction buffer (nearest-neighbor method only).
- **Знаков после запятой** (number)

## Когда использовать

- Для первичной оценки Tm нового ПЦР-праймера по его последовательности 5'→3'.
- Чтобы сравнить быструю оценку по Уоллесу с термодинамическим расчётом ближайших соседей.
- Чтобы учесть заданные концентрации праймера и натрия при расчёте методом ближайших соседей.

## Как это работает

- Введите последовательность ДНК-праймера, содержащую только A, C, G и T, длиной от 5 до 60 нт.
- Выберите правило Уоллеса или метод ближайших соседей SantaLucia 1998.
- Для метода ближайших соседей укажите концентрацию праймера в нМ и натрия в мМ.
- Получите оба значения Tm, GC-состав, длину и рекомендуемую стартовую Ta; число знаков после запятой можно настроить.

## Сценарии использования

- Сравнение Tm прямого и обратного праймера перед постановкой ПЦР.
- Быстрый анализ влияния GC-состава и длины олигонуклеотида на температуру плавления.
- Проверка различий между упрощённым правилом Уоллеса и расчётом с учётом концентрации и соли.

## Частые вопросы

### Какие последовательности принимает калькулятор?

Только последовательности ДНК из букв A, C, G и T длиной от 5 до 60 нуклеотидов, без учёта регистра.

### Какой метод расчёта Tm выбрать?

Правило Уоллеса подходит для быстрой оценки коротких олигонуклеотидов. Для дизайна праймеров используйте метод ближайших соседей.

### Зачем указывать концентрацию праймера и натрия?

Эти параметры участвуют в термодинамическом расчёте ближайших соседей и влияют на полученное значение Tm.

### Что означает рекомендуемая Ta?

Это стартовая температура отжига, рассчитанная как Tm − 5°C.

### Можно ли использовать результат как окончательную настройку ПЦР?

Нет. Калькулятор предназначен только для первичного скрининга; итоговые условия следует дополнительно проверить.

## Связанные инструменты

- [Конвертер поглощения и пропускания (A = −log₁₀T)](https://elysiatools.com/ru/tools/absorbance-transmittance-converter): Двусторонний пересчёт между поглощением и пропусканием: A = −log₁₀(T), T = 10⁻ᴬ, %T = 100·T, A = 2 − log₁₀(%T). Принимает поглощение A, процентное пропускание %T или долю пропускания T и сразу выдаёт все три представления. Ориентиры: A=0 → %T=100; A=1 → %T=10; A=0,301 → %T=50. Отрицательное поглощение означало бы %T > 100 %, что невозможно в стандартной спектрофотометрии, и отклоняется.
- [Калькулятор температуры отжига ПЦР (Ta = Tm − 5°C)](https://elysiatools.com/ru/tools/annealing-temperature-calculator): Вычисляет температуру отжига (Ta) ПЦР по двум правилам: простое лабораторное Ta = Tm − 5°C (берётся МЕНЬШИЙ Tm пары праймеров) и эмпирическая формула Рыхлика 1990: Ta = 0.3×Tm(праймера) + 0.7×Tm(продукта) − 14.9 (Tm продукта обычно 75–90°C; формула даёт на 1–8°C выше простого правила для типичных пар). Выводит рекомендуемую Ta, диапазон градиента ±3°C и направление подстройки: низкая Ta даёт неспецифичные полосы и димеры, высокая — нет продукта; держите разницу Tm праймеров в пределах 2–3°C и отжигайте по меньшему. Источники: Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Только для планирования.
- [Анализатор родословных аутосомно-доминантного наследования](https://elysiatools.com/ru/tools/autosomal-dominant-pedigree): Вычисляет риск для потомства при аутосомно-доминантном (АД) наследовании и оценивает соответствие наблюдаемых чисел ожидаемому расщеплению. Генотипы родителей → ожидаемая доля: AA × любой = все больны; Aa × Aa = 3:1 (75%); Aa × aa = 1:1 (50%); aa × aa = никто. Наблюдаемые числа проверяются критерием хи-квадрат (df = 1, критическое 3.841). Признаки АД родословной: вертикальная передача, оба пола поражены одинаково, есть передача отец→сын (исключает X-сцепленный доминантный тип), здоровые не передают (кроме de novo). Примеры: хорея Гентингтона, ахондроплазия, синдром Марфана. Источники: Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls, OMIM. Только для обучения.
- [Калькулятор риска аутосомно-рецессивного наследования](https://elysiatools.com/ru/tools/autosomal-recessive-risk): Вычисляет вероятность рождения больного ребёнка (или хотя бы одного из n детей) с аутосомно-рецессивным заболеванием. Больной ребёнок (aa) должен получить рецессивный аллель от ОБОИХ родителей: P(ребёнок болен) = P(родитель 1 передаёт a) × P(родитель 2 передаёт a). Статусы: носитель (Aa), больной (aa), не носитель (AA), неизвестен (P(Aa)=c, P(aa)=c² по популяционной частоте). Два носителя → 25% на ребёнка, 50% носителей, P(носитель | здоров) = 2/3; хотя бы один из n = 1 − (1−r)^n. По умолчанию 0.04 (муковисцидоз 1/25). Источники: Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Только для обучения, не заменяет медико-генетическое консультирование.
- [Калькулятор подсчёта клеток в камере Горяева](https://elysiatools.com/ru/tools/cell-counting-hemocytometer): Переводит сырой подсчёт из камеры Горяева (улучшенная Нойбауэра) в концентрацию: клеток/мл = (всего подсчитано ÷ число квадратов) × разведение × 10⁴ (большой квадрат 1 мм² при глубине 0,1 мм вмещает ровно 0,1 мкл). Введите общий подсчёт, число квадратов (обычно 4 угловых или 5 с центральным) и кратность разведения; при желании — объём образца для общего числа клеток. Даёт советы по идеальной плотности 20–100 клеток на квадрат. Источники: руководство Freshney, геометрия камеры. Только для обучения.
- [Конвертер плотности клеток (клеток/мл↔клеток/мкл↔10⁶/мл↔10¹²/л)](https://elysiatools.com/ru/tools/cell-density-unit-converter): Полный пересчёт между единицами плотности клеток: клеток/л, клеток/мл, клеток/мкл, 10³ клеток/мкл, 10⁶ клеток/мл, 10⁹ клеток/л и 10¹² клеток/л. Охватывает и культивирование клеток (E. coli 5×10⁸ клеток/мл = 500 ×10⁶ клеток/мл), и гематологические отчёты (эритроциты 4,9×10¹²/л = 4,9×10⁶ клеток/мкл; лейкоциты 6,5×10⁹/л = 6500 клеток/мкл), сразу выдавая таблицу всех единиц. Сопутствующий инструмент: калькулятор OD600.
- [Калькулятор времени удвоения клеток](https://elysiatools.com/ru/tools/cell-doubling-time): Вычисляет кинетику экспоненциального роста по двум подсчётам: время удвоения t_d = ln2 × t ÷ ln(Nₜ/N₀), число удвоений n = ln(Nₜ/N₀) ÷ ln2 и удельная скорость μ = ln(Nₜ/N₀)/t (ч⁻¹). N₀ и Nₜ — число клеток или плотность в любых согласованных единицах; время — в часах/днях/минутах. Предполагается лог-фаза в обеих точках (посев субконфлюэнтный, сбор до контактного торможения), иначе t_d завышается; приведены ориентиры для HEK293/HeLa/CHO. Источник: руководство Freshney. Только для обучения.
- [Калькулятор жизнеспособности клеток (трипановый синий)](https://elysiatools.com/ru/tools/cell-viability-trypan-blue): Вычисляет жизнеспособность по подсчётам живых/мёртвых клеток в тесте исключения трипанового синего: жизнеспособность % = живые ÷ (живые + мёртвые) × 100; концентрация живых = подсчёт × разведение × 10⁴ ÷ квадраты. Краситель не проходит через целые мембраны: живые клетки светлые, повреждённые окрашиваются в синий. Даёт оценку состояния культуры (≥90% здорова, 70–90% приемлемо, <70% стресс) и советы протокола (считать в течение 3–5 мин; длительная экспозиция убивает живые клетки). Источники: Freshney, протокол Strober. Только для обучения.

## Примеры

- [Примеры Обработки Изображений Web Python](https://elysiatools.com/ru/samples/web-image-processing-python): Примеры обработки изображений Web Python используя PIL/Pillow включая чтение, сохранение, изменение размера и преобразование формата
- [Примеры Обработки Изображений Android Java](https://elysiatools.com/ru/samples/android-image-processing-java): Примеры обработки изображений Android Java включая чтение/сохранение, масштабирование и преобразование формата
- [Примеры Обработки Изображений Android Kotlin](https://elysiatools.com/ru/samples/android-image-processing-kotlin): Примеры обработки изображений Android Kotlin включая чтение/сохранение, масштабирование и преобразование формата
- [Примеры Обработки Изображений Web Rust](https://elysiatools.com/ru/samples/web-image-processing-rust): Примеры обработки изображений Web Rust включая чтение/запись, масштабирование и преобразование форматов