# Калькулятор LOD-балла (анализ сцепления)

Двухточечный анализ сцепления по LOD-баллам: LOD(θ) = log10[θ^r(1−θ)^(N−r) / 0.5^N], где r — число рекомбинантных мейозов, N — общее число информативных мейозов. Оценка максимального правдоподобия θ̂ = r/N; вычисляется максимальный LOD (Zmax) или LOD при фиксированном θ, плюс таблица кривой LOD для θ = 0.05–0.45. Классические пороги (Morton 1955): Z ≥ 3 — значимое сцепление (1000:1); Z ≤ −2 — значимое отсутствие сцепления; между ними — неопределённо. Источники: Morton 1955, Ott 1999, Griffiths, StatPearls. Только для обучения.

> Каноническая страница: https://elysiatools.com/ru/tools/lod-score-calculator

- **Категория:** Education

- **Ключевые слова:** lod-балл, калькулятор lod, анализ сцепления, генетическое сцепление, доля рекомбинантов, оценка теты, логарифм отношений, картирование генов, двухточечное сцепление, менделевская генетика, генетика

## Обзор

Калькулятор выполняет двухточечный анализ генетического сцепления по числу рекомбинантных и нерекомбинантных мейозов. Он вычисляет максимальный LOD-балл при θ̂ = r/N или LOD при заданной доле рекомбинации θ, формирует таблицу кривой LOD и интерпретирует результат по порогам Мортона.

## Входные данные

- **Режим θ** (select): Report the maximum LOD at θ̂ = r/N, or evaluate the LOD at a fixed θ.
- **Число рекомбинантов** (number): Number of recombinant meioses observed (r).
- **Число нерекомбинантов** (number): Number of non-recombinant meioses observed.
- **Доля рекомбинантов θ** (number): Recombination fraction at which to evaluate the LOD in fixed-θ mode (0 < θ < 0.5).
- **Знаков после запятой** (number)

## Когда использовать

- Для оценки свидетельств в пользу сцепления между двумя генетическими локусами.
- Для проверки гипотезы о сцеплении при заданной доле рекомбинации θ.
- Для учебных расчётов по генетическому картированию и интерпретации LOD-баллов.

## Как это работает

- Выберите режим: максимальный LOD с оценкой θ̂ или расчёт LOD при фиксированном θ.
- Введите число рекомбинантных и нерекомбинантных мейозов.
- Для фиксированного режима задайте θ в диапазоне 0 < θ < 0,5 и выберите число знаков после запятой.
- Калькулятор возвращает LOD-балл, оценку θ при применимости, вывод по порогам Мортона и таблицу значений для θ от 0,05 до 0,45.

## Сценарии использования

- Расчёт Zmax и оценки доли рекомбинации по наблюдаемым мейозам.
- Исключение сцепления на заданном генетическом расстоянии с помощью фиксированного θ.
- Сравнение LOD-баллов при θ от 0,05 до 0,45 по таблице кривой.

## Частые вопросы

### Что означает LOD-балл?

Это десятичный логарифм отношения правдоподобия сцепления при выбранном θ к правдоподобию свободной рекомбинации при θ = 0,5.

### Как рассчитывается оценка θ̂?

В режиме максимального LOD используется оценка максимального правдоподобия θ̂ = r/N, где r — число рекомбинантов, а N — общее число информативных мейозов.

### Как интерпретировать результат?

LOD ≥ 3 значимо поддерживает сцепление, LOD ≤ −2 свидетельствует против него при проверяемом θ, а промежуточный результат считается неопределённым.

### Какой диапазон θ допустим в фиксированном режиме?

Нужно задать значение больше 0 и меньше 0,5.

### Можно ли использовать результат для клинического решения?

Нет. Калькулятор предназначен только для обучения.

## Связанные инструменты

- [Анализатор родословных аутосомно-доминантного наследования](https://elysiatools.com/ru/tools/autosomal-dominant-pedigree): Вычисляет риск для потомства при аутосомно-доминантном (АД) наследовании и оценивает соответствие наблюдаемых чисел ожидаемому расщеплению. Генотипы родителей → ожидаемая доля: AA × любой = все больны; Aa × Aa = 3:1 (75%); Aa × aa = 1:1 (50%); aa × aa = никто. Наблюдаемые числа проверяются критерием хи-квадрат (df = 1, критическое 3.841). Признаки АД родословной: вертикальная передача, оба пола поражены одинаково, есть передача отец→сын (исключает X-сцепленный доминантный тип), здоровые не передают (кроме de novo). Примеры: хорея Гентингтона, ахондроплазия, синдром Марфана. Источники: Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls, OMIM. Только для обучения.
- [Калькулятор коэффициента инбридинга (F Райта)](https://elysiatools.com/ru/tools/inbreeding-coefficient): Вычисляет коэффициент инбридинга F Райта: вероятность того, что два аллеля одного локуса идентичны по происхождению. F_X = Σ (1/2)^(n1+n2+1) × (1 + F_A), где n1/n2 — поколений от отца/матери до общего предка, F_A — инбридинг предка; сумма по всем общим предкам. Ориентиры: самооплодотворение 0.5, родитель×потомок 0.25, полные сибсы 0.25 (два пути 1,1), полусибсы 0.125, дядя×племянница 0.125, двоюродные сибсы 0.0625 (два пути 2,2). Риск рецессивного заболевания растёт с q² до q² + F·q·(1−q). Источники: Wright 1922, Falconer & Mackay, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Только для обучения.
- [Калькулятор коэффициентов родства (r и φ)](https://elysiatools.com/ru/tools/kinship-coefficient): Вычисляет по формуле путей Райта коэффициент родства r и коэффициент кинства (коансестри) φ между двумя особями: r = Σ (1/2)^(n1+n2) × (1 + F_A), где n1/n2 — поколений от каждой особи до общего предка, сумма по всем предкам; φ = r/2, а F потомка = φ родителей. Ориентиры: монозиготные близнецы 1.0, родитель-потомок/полные сибсы 0.5, полусибсы/дед-внук/дядя-племянник 0.25, двоюродные сибсы 0.125, троюродные 0.03125. Плюс определение степени родства. Источники: Wright 1922, Falconer & Mackay, Hartl & Clark 2007, Jacquard 1970. Только для обучения.
- [Расчёт вероятности болезни потомка по родословной (дерево вероятностей)](https://elysiatools.com/ru/tools/pedigree-probability-tree): Пошагово вычисляет вероятность больного потомка в родословной с помощью менделевского дерева вероятностей (правило произведения вдоль ветви, правило суммы между ветвями). Аутосомно-рецессивный: P(больной) = P(отец носитель) × P(мать носительница) / 4, плюс вероятность носительства (два известных носителя → 1/4 больных, 1/2 носителей, как при муковисцидозе). Аутосомно-доминантный (гетерозиготы, например хорея Хантингтона): оба поражены → 3/4. X-сцепленный рецессивный (гемофилия A, дальтонизм): мать-носитель × здоровый отец → 50% сыновей больны, 50% дочерей носительницы, с разбивкой по полу и общей вероятностью. Показан каждый шаг ветвления. Источники: Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Только для обучения.
- [Анализатор анализирующего скрещивания (определение гомо/гетерозиготы)](https://elysiatools.com/ru/tools/test-cross-analyzer): Определяет, является ли особь с доминантным фенотипом (неизвестный генотип AA или Aa) гомозиготой или гетерозиготой, путём анализирующего скрещивания с рецессивной гомозиготой (aa). Если появляется хотя бы один рецессивный потомок (aa) → родитель гетерозигота (Aa); если все потомки доминантные → вероятно гомозигота (AA). Статистическая достоверность: при отсутствии рецессивов, если родитель Aa, P(0 рецессивных) = 0.5^n. Источники: Mendel 1866, Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Только для обучения.
- [Калькулятор температуры отжига ПЦР (Ta = Tm − 5°C)](https://elysiatools.com/ru/tools/annealing-temperature-calculator): Вычисляет температуру отжига (Ta) ПЦР по двум правилам: простое лабораторное Ta = Tm − 5°C (берётся МЕНЬШИЙ Tm пары праймеров) и эмпирическая формула Рыхлика 1990: Ta = 0.3×Tm(праймера) + 0.7×Tm(продукта) − 14.9 (Tm продукта обычно 75–90°C; формула даёт на 1–8°C выше простого правила для типичных пар). Выводит рекомендуемую Ta, диапазон градиента ±3°C и направление подстройки: низкая Ta даёт неспецифичные полосы и димеры, высокая — нет продукта; держите разницу Tm праймеров в пределах 2–3°C и отжигайте по меньшему. Источники: Rychlik 1990, Innis & Gelfand 1990, Lorenz 2012. Только для планирования.
- [Калькулятор риска аутосомно-рецессивного наследования](https://elysiatools.com/ru/tools/autosomal-recessive-risk): Вычисляет вероятность рождения больного ребёнка (или хотя бы одного из n детей) с аутосомно-рецессивным заболеванием. Больной ребёнок (aa) должен получить рецессивный аллель от ОБОИХ родителей: P(ребёнок болен) = P(родитель 1 передаёт a) × P(родитель 2 передаёт a). Статусы: носитель (Aa), больной (aa), не носитель (AA), неизвестен (P(Aa)=c, P(aa)=c² по популяционной частоте). Два носителя → 25% на ребёнка, 50% носителей, P(носитель | здоров) = 2/3; хотя бы один из n = 1 − (1−r)^n. По умолчанию 0.04 (муковисцидоз 1/25). Источники: Griffiths, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Только для обучения, не заменяет медико-генетическое консультирование.
- [Калькулятор подсчёта клеток в камере Горяева](https://elysiatools.com/ru/tools/cell-counting-hemocytometer): Переводит сырой подсчёт из камеры Горяева (улучшенная Нойбауэра) в концентрацию: клеток/мл = (всего подсчитано ÷ число квадратов) × разведение × 10⁴ (большой квадрат 1 мм² при глубине 0,1 мм вмещает ровно 0,1 мкл). Введите общий подсчёт, число квадратов (обычно 4 угловых или 5 с центральным) и кратность разведения; при желании — объём образца для общего числа клеток. Даёт советы по идеальной плотности 20–100 клеток на квадрат. Источники: руководство Freshney, геометрия камеры. Только для обучения.

## Примеры

- [Примеры Обработки Изображений Web Python](https://elysiatools.com/ru/samples/web-image-processing-python): Примеры обработки изображений Web Python используя PIL/Pillow включая чтение, сохранение, изменение размера и преобразование формата
- [Примеры Анализа Логов ELK Stack](https://elysiatools.com/ru/samples/elk-stack-samples): Комплексные примеры ELK Stack для агрегации, обработки и визуализации логов в распределенных системах
- [Примеры Обработки Изображений Android Java](https://elysiatools.com/ru/samples/android-image-processing-java): Примеры обработки изображений Android Java включая чтение/сохранение, масштабирование и преобразование формата
- [Примеры Обработки Изображений Android Kotlin](https://elysiatools.com/ru/samples/android-image-processing-kotlin): Примеры обработки изображений Android Kotlin включая чтение/сохранение, масштабирование и преобразование формата

## Связанные материалы

- [Инструменты кодирования и конвертации аудио](https://elysiatools.com/ru/hubs/audio-convert): Сравните инструменты конвертации аудиоформатов, изменения битрейта, частоты дискретизации, смены кодека и экспорта в одном хабе.
- [Инструменты конвертации форматов изображений и анимированного экспорта](https://elysiatools.com/ru/hubs/image-convert): Сравните конвертеры JPG, PNG, GIF, AVIF, WebP, TIFF, ICO, base64 и инструменты экспорта анимированных изображений в одном хабе.
- [Инструменты JSON-обмена и перевода форматов](https://elysiatools.com/ru/hubs/json-convert): Сравните инструменты преобразования JSON для CSV, YAML, TOML, GraphQL, XML, Markdown, Excel, BSON, EDN и других структурированных форматов в одном хабе.
- [Инструменты перевода цветовых пространств для веба и печати](https://elysiatools.com/ru/hubs/design-convert): Подборка инструментов для перевода цветовых пространств между вебом и печатью в одном хабе.