# Calculadora de comprimento de fragmentos de restrição Estima os tamanhos dos fragmentos após a digestão: um substrato circular com n cortes produz n fragmentos (contornando a origem) e um linear produz n+1. O modo de posições calcula fragmentos exatos a partir de coordenadas separadas por vírgula; o modo de número de sítios dá a contagem e a média com distribuição uniforme. Inclui a frequência esperada de sítios em DNA aleatório: enzimas de 4 bases ~1 a cada 256 bp, de 6 bases ~1 a cada 4096 bp (REBASE/Sambrook) e avisos de resolução em agarose (<50 bp pode escapar). Fontes: Sambrook & Russell 3ª ed., REBASE. Apenas para educação. > Página canônica: https://elysiatools.com/pt/tools/restriction-fragment-length - **Categoria:** Education - **Palavras-chave:** comprimento fragmentos restrição, calculadora digestão restrição, dupla digestão plasmídeo, mapa de restrição fragmentos, fragmentos dna bp, digestão plasmídeo circular, fragmentos dna linear, cortador 4 bases 256 bp, cortador 6 bases 4096 bp, tamanho fragmentos agarose, biologia molecular, calculadora laboratório ## Visão geral A Calculadora de comprimento de fragmentos de restrição estima os tamanhos gerados por uma digestão de DNA circular ou linear. Informe as posições de corte para obter fragmentos exatos ou indique apenas o número de sítios para calcular a quantidade e o tamanho médio esperado. ## Entradas - **Topologia do substrato** (select): Circular plasmids give n fragments from n cuts; linear DNA gives n+1. - **Modo de entrada** (select): Enter exact cut positions, or just the number of cut sites for an average estimate. - **Comprimento do substrato (bp)** (number): Total length of the substrate (plasmid or linear DNA) in base pairs. - **Posições de corte (bp, separadas por vírgula)** (text): Cut coordinates counted from base 1 (positions mode); each must be strictly inside the substrate and unique. - **Número de sítios de corte** (number): Number of cut sites (count mode); fragments = n circular or n+1 linear. - **Casas decimais** (number) ## Quando usar - Planejar uma digestão simples ou dupla de um plasmídeo circular. - Estimar os fragmentos de um produto de PCR ou outro DNA linear. - Comparar tamanhos esperados com a resolução de um gel de agarose. ## Como funciona - Selecione a topologia do substrato: plasmídeo circular ou DNA linear. - Informe o comprimento total em pares de bases e escolha o modo de entrada. - No modo de posições, digite coordenadas de corte únicas e separadas por vírgulas para obter os fragmentos exatos. - No modo de número de sítios, informe n cortes para calcular n fragmentos circulares ou n+1 fragmentos lineares, com uma estimativa média. ## Casos de uso - Verificar rapidamente o mapa de uma dupla digestão de plasmídeo e confirmar se o total dos fragmentos corresponde ao tamanho do substrato. - Prever os tamanhos produzidos ao cortar um amplicon linear em posições internas conhecidas. - Fazer uma estimativa inicial quando se conhece o número de sítios, mas ainda não as coordenadas exatas. ## Perguntas frequentes ### Como são calculados os fragmentos de um plasmídeo circular? Um substrato circular com n cortes produz n fragmentos, incluindo o segmento que contorna a origem. ### Quantos fragmentos resultam de um DNA linear? Um DNA linear com n cortes internos produz n+1 fragmentos. ### As posições de corte são informadas em que formato? Digite as coordenadas em bp, contadas a partir da base 1, separadas por vírgulas, como 1000, 2000. ### O que o modo de número de sítios informa? Ele calcula a quantidade de fragmentos e o comprimento médio esperado considerando uma distribuição uniforme dos cortes. ### Um fragmento menor que 50 bp será visível no gel? Pode não ser resolvido ou pode escapar em um gel de agarose; o resultado deve ser interpretado com essa limitação. ## Ferramentas relacionadas - [Analisador de composição de aminoácidos](https://elysiatools.com/pt/tools/amino-acid-composition): Analisa a composição de uma sequência: contagens e percentagens molares de cada um dos 20 aminoácidos padrão; totais por grupo (básicos K/R/H, ácidos D/E, aromáticos F/W/Y, sulfurados C/M, alifáticos A/I/L/V, amidas N/Q, hidroxila S/T, outros G/P); GRAVY com os valores de hidropatia de Kyte–Doolittle 1982 (>0 tendência hidrofóbica, <0 hidrofílica; globulares solúveis ficam entre −1 e +0,3); e a massa molecular pela tabela ProtParam. Códigos de ambiguidade (B/J/O/U/X/Z) contam-se à parte e excluem-se das percentagens. Fontes: Kyte & Doolittle 1982, ExPASy ProtParam, Lehninger. Apenas para educação. - [Simulador do efeito gargalo genético (perda de heterozigosidade)](https://elysiatools.com/pt/tools/bottleneck-effect-simulator): Simula a perda esperada de heterozigosidade após um gargalo (esperança determinística). Sob deriva Wright-Fisher ideal, H_{t+1} = H_t(1 − 1/(2N)) por geração, logo H_final = H₀(1−1/2Nb)^t × (1−1/2Nr)^g; o tamanho efetivo harmônico Ne = (t+g)/(t/Nb + g/Nr) é dominado pelo mínimo; F acumulado = 1 − H_final/H₀. Para um alelo de frequência p, a sobrevivência a UMA geração de gargalo é 1 − (1−p)^(2Nb); alelos raros perdem-se primeiro. Casos clássicos: elefante-marinho-do-norte (~20 sobreviventes em 1890), guepardo, nēnē do Havaí, bisão-europeu, atol Pingelap. Fontes: Wright 1931, Nei et al. 1975, Hartl & Clark 2007, StatPearls. Apenas uso educativo. - [Processador de Limites de Dados](https://elysiatools.com/pt/tools/data-boundary-processor): Ferramenta avançada de processamento de limites que identifica e gerencia valores mínimos e máximos em dados numéricos. Perfeita para validação de dados, verificação de intervalos, análise estatística e pré-processamento de dados. - [Calculadora de massa molecular de proteína (por sequência)](https://elysiatools.com/pt/tools/protein-molecular-weight): Calcula a massa molecular de uma proteína a partir da sequência: MW = Σ massas médias dos resíduos + H₂O (18,01524 Da), com a mesma tabela do ExPASy ProtParam (A 71,0788 … W 186,2132). A entrada não diferencia maiúsculas; espaços e separadores * - . são removidos; códigos de ambiguidade (B/J/O/U/X/Z) não são somados, mas contados e reportados. O resultado é a cadeia polipeptídica não modificada: sem remoção de peptídeo sinal, pontes dissulfeto (−2H por ponte), PTMs ou tags. Retorna kDa, massa média por resíduo e comprimento. Fontes: ExPASy ProtParam (Gasteiger 2005), manual de Fasman. Apenas para educação. - [Calculadora de eficiência de transfecção (taxa GFP+)](https://elysiatools.com/pt/tools/transfection-efficiency): Calcula a eficiência de transfecção pela taxa GFP+: eficiência = células GFP+ ÷ total × 100. O modo de medição única acrescenta intervalo de confiança Wilson de 95% (mais confiável que a aproximação normal em contagens pequenas); o modo de réplicas recebe contagens paralelas separadas por vírgula e devolve eficiência por poço, média e desvio padrão amostral (n−1). Faixas de interpretação: ≥70% excelente (linhas fáceis HEK293/CHO), 30–70% bom, 10–30% moderado, <10% baixo (considerar eletroporação ou vetores virais). Premissas: mesmo limiar de GFP, excluir células mortas, leitura no pico de 24–72 h. Fontes: Wilson 1927, Newcombe 1998, Kim & Eberwine 2010. Apenas para educação. - [Tutor de autômatos finitos, Mealy/Moore, Karnaugh e minimização](https://elysiatools.com/pt/tools/finite-state-machine-mealy-moore-karnaugh-minimization-tutor): Explica passo a passo autômatos e lógica combinacional: construção por subconjuntos ε-NFA→NFA→DFA, minimização por refinamento de partições de Moore, conversão Mealy↔Moore; agrupamento Gray em Karnaugh e Quine-McCluskey com implicantes primos e cobertura mínima exata para o SOP mínimo. Inclui diagramas ASCII, tabelas e iterações. - [Gerador de baralho SRS a partir de lista de frequência](https://elysiatools.com/pt/tools/language-vocab-spaced-repetition-deck-generator): Cole uma lista de vocabulário bilíngue e exporte um baralho compatível com Anki que divide cada entrada em cartões de reconhecimento, recordação e cloze com classe, IPA e frases de exemplo, além de prévia SM-2. - [Conversor de Velocidade Angular (rad/s / rpm / deg/s / Hz)](https://elysiatools.com/pt/tools/angular-velocity-converter): Conversão de velocidade angular: rad/s (base SI) ↔ rpm (1=2π/60 rad/s) ↔ grau/s (1=π/180 rad/s) ↔ Hz (1 rotação/s=2π rad/s). Hz aqui = rotação por segundo. Conversão via rad/s com os quatro equivalentes. Ref.: vinil 33⅓ rpm≈3,49 rad/s, marcha lenta ~800 rpm≈83,8 rad/s. ## Exemplos - [Exemplos de Processamento de Imagem Web Python](https://elysiatools.com/pt/samples/web-image-processing-python): Exemplos de processamento de imagem Web Python usando PIL/Pillow incluindo leitura, salvamento, redimensionamento e conversão de formato - [Exemplos de Comprimento e Distancia](https://elysiatools.com/pt/samples/length-distance): Amostras educativas para explicar unidades metricas e imperiais, intuicao de distancia e conversoes comuns - [Exemplos de Unidades de Comprimento](https://elysiatools.com/pt/samples/length-unit): Referencias praticas que voce pode copiar quando quiser comparar diferentes unidades de comprimento diretamente com metros (m) - [Exemplos de Processamento de Imagem Android Java](https://elysiatools.com/pt/samples/android-image-processing-java): Exemplos de processamento de imagem Android Java incluindo leitura/escrita, dimensionamento e conversão de formato ## Conteúdo relacionado - [Ferramentas de codigo de barras, QR e etiquetas](https://elysiatools.com/pt/hubs/barcode-utility): Reune em um so hub ferramentas para gerar codigos de barras, criar e decodificar QR, validar UPC/EAN, compartilhar WiFi por QR e preparar etiquetas imprimiveis. - [Ferramentas de codificacao e conversao de audio](https://elysiatools.com/pt/hubs/audio-convert): Compare conversao de formatos de audio, ajustes de bitrate, conversao de taxa de amostragem, troca de codec e exportacao em um unico hub. - [Ferramentas de conversao de formatos de imagem e exportacao animada](https://elysiatools.com/pt/hubs/image-convert): Compare conversores de imagem para JPG, PNG, GIF, AVIF, WebP, TIFF, ICO, base64 e saidas voltadas para animacao em um unico hub. - [Ferramentas de intercambio JSON e traducao de formatos](https://elysiatools.com/pt/hubs/json-convert): Compare ferramentas de conversao JSON para CSV, YAML, TOML, GraphQL, XML, Markdown, Excel, BSON, EDN e outros formatos estruturados em um unico hub.